موقعیت فیلوژنتیکی phytophthora erythroseptica و ارتباط آن با دودمان های p. cryptogea
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی
- نویسنده بنفشه صفایی فراهانی
- استاد راهنما رضا مستوفی زاده قلمفرسا کرامت اله ایزدپناه ضیاالدین بنی هاشمی
- سال انتشار 1394
چکیده
در این مطالعه، روابط فیلوژنتیکی این گونه ها با استفاده از توالی سنجی نواحی هسته ای (فاصله ی ترانویسی شده ی داخلی، بتاتوبولین، پروتئین شوک حرارتی 90 و الیسیتین) و میتوکندریایی (زیرواحد یک سیتوکروم سی اکسیداز و زیرواحد یک اِن اِی-دی اِچ دهیدروژناز) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این پژوهش نشان داد که در تمامی درخت های فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس توالی نواحی هسته ای و میتوکندریایی و درخت های برآیند نواحی هسته ای و میتوکندریایی، سه دودمان مجزا در p. cryptogea وجود دارد. واگرایی مولکولی مشاهده شده بین این دودمان ها به اندازه ای بود که بتوان آن ها را به عنوان گونه هایی مجزا توصیف کرد. علیرغم وجود برخی تفاوت های ریخت شناختی و فیزیولوژیکی در میان آرایه های فوق، این تفاوت ها برای شناسایی آرایه ها از یک دیگر چندان قابل اعتماد نبود. علاوه بر این، در تمامی درخت های فیلوژنتیکی رسم شده (به استثنای درخت رسم شده بر اساس توالی ژن الیسیتین) جدایه های p. erythroseptica در تباری مجزا و تک نیا با ارزش پشتیبانی بالا قرار گرفتند. این تبار جد مشترکی با p. cryptogea sensu stricto داشت اما به طور مشخص از p. cryptogea مجزا بود. بنابراین نتایج این پژوهش موقعیت p. erythroseptica را به عنوان گونه ای مجزا و خویشاوند نزدیک گونه ی مرکب p. cryptogea تأیید می کند. بررسی دامنه ی میزبانی p. cryptogea sensu stricto، p. sp. pseudocryptogea، p. sp. kelmania ، p. erythroseptica و هفت گروه دورگ شناسایی شده در این پژوهش با استفاده از 12 گونه ی گیاهی نشان داد تمامی آرایه ها قادر به ایجاد آلودگی در هندوانه (citrullus vulgaris) و بادمجان (solanum melongena) هستند اگرچه توانایی آن ها در ایجاد آلودگی در خربزه (cucumis melo)، خیار سبز (cucumis sativus) و گوجه فرنگی (lycopersicum esculentum) با یک دیگر تفاوت داشت. علاوه بر این، تمامی جدایه های بررسی شده در این پژوهش قادر به ایجاد پوسیدگی صورتی در غده های سیب زمینی بودند.
منابع مشابه
شناسایی و ردیابی اختصاصی Phytopthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica با واکنش زنجیرهای پلیمراز
گونههای Phytophthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریختشناختی به یکدیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایهها از یکدیگر و از سایر گونههایی که صفات ریختشناختی همگرا دارند، شیوهای بر اساس واکنش زنجیرهای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعهای از جدایهها مربوط به میزبانهای مختلف، که نماینده...
متن کاملتنوع ژنتیکی درونگونهای Phytophthora cryptogea و P. drechsleri *
گونههای Phytophthora drechsleri و P. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونهها، جدایههایی از P. drechsleri و P. cryptogea مربوط به میزبانهای متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایههایی از آرایه خویشاوند آنها، P. erythroseptica، از طریق روش میکروستلایتهای فزو...
متن کاملشناسایی و ردیابی اختصاصی phytopthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica با واکنش زنجیره ای پلیمراز
گونه های phytophthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت شناختی به یک دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه ها از یک دیگر و از سایر گونه هایی که صفات ریخت شناختی همگرا دارند، شیوه ای بر اساس واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه ای از جدایه ها مربوط به میزبان های مختلف، که نماینده ی تنوع موجود در ژن های هست...
متن کاملتنوع ژنتیکی درون گونه ای phytophthora cryptogea و p. drechsleri *
گونههای phytophthora drechsleri و p. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونهها، جدایههایی از p. drechsleri و p. cryptogea مربوط به میزبانهای متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایههایی از آرایه خویشاوند آنها، p. erythroseptica، از طریق روش میکروستلایت های فزونسازی شده تصادفی (rams) مطالعه شدند. این بررسی به کمک...
متن کاملPhylogenetic history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates from floriculture crops in North Carolina greenhouses.
The evolutionary history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates previously collected from floriculture crops in North Carolina commercial greenhouses was explored with coalescent- and parsimony-based analyses. Initially, 68 isolates representing 13 location-host groups were sequenced at multiple loci. Sequences of all isolates within a group were identical. A subset of isolates we...
متن کاملشناسایی و ردیابی Phytophthora erythroseptica و دورگهای آن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی
گونهیPhytophthora erythroseptica ، عامل پوسیدگی صورتی سیبزمینی، یکی از اُاُمیستهای بیماریزای گیاهی است که خسارت اقتصادی قابل توجهی را در مزرعه و انبار وارد میکند. به منظور شناسایی و ردیابی دقیق و حساس P. erythroseptica ، شش توالی هستهای و میتوکندریایی برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت. به دلیل شباهت زیاد توالیهای P. erythroseptica</em...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023