تایید آزمایشگاهی یک microrna نوین در ناحیه حذف ژنومی شایع (3p26.3) در سرطان ریه

سرطان ریه یکی از علل اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در سطح دنیاست. مطالعات سیتوژنتیکی نشان می دهد که تومورهای ریوی ناهنجاری کروموزومی مختلفی را نشان می دهند که جهش در بازوی کوتاه کروموزوم 3 یکی از موارد شایع می باشد. mirna ها rna های غیر کد کننده تک رشته ای کوچکی هستند که بعنوان تنظیم کننده های بیان ژن در سطح بعد از رونویسی عمل می کنند. mirna ها فرایندهای مهم سلولی همانند تکثیر، تمایز، اپوپتوز و تومورزایی را کنترل می کنند. ناحیه ژنومی mirna ها نشان می دهد که انها در نواحی کروموزومی حساس و مرتبط با سرطان قرار گرفته اند. در مطالعه حاضر ناحیه بازوی کوتاه کروموزوم 3 برای وجود mirna های جدید که ممکن است نقشهایی در سرطانزایی ریوی داشته باشند، تحت مطالعه قرار گرفت. با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی متعدد، ما نواحی حفاظت شده در ساب باند 3p26.3 را برای یافتن ساختارهای سنجاق سری که مشخصه پیش سازهای mirna است، جستجو کردیم. با توجه به امتیازهای بدست امده توسط نرم افزارها، ما سه ساختار سنجاق سری را برای تایید تجربی انتخاب کردیم. از بین سه ساختار سنجاق سری انتخاب شده، یکی از انها بنام mir-stlb-3 بیان اندوژنوس ان توسط pcr شناسایی شد و تعیین توالی صحت وجود این mirna را تایید کرد. ترانسفکشن سلولهای sw480 با وکتور بیانی حامل پیش ساز این mirna منجر به بیش بیانی فرم بالغ mir-stlb-3 گردید که بیانگر واقعی بودن این mirna است. از نرم افزار lab diana برای پیش بینی اهداف ژنی mir-stlb-3 استفاده گردید. نتایج real-time pcr در سلولهای sw480 ترانسفکت شده با حامل بیان کننده mir-stlb-3 نشان داد که بیان دو ژن itg?1bp1 و trkc در سطح معنی داری کاهش یافته است.