تعیین توالی و آنالیزهای بیوانفورماتیکی بخشی از اگزون و اینترون شماره هفت ژن بتاکازئین در شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایران

هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی بخشی از اگزون و اینترون شماره 7 ژن بتاکازئین شترهای تک کوهان و دو کوهان ایرانی بود.کازئین بخش اصلی پروتئین های شیر می باشد که به صورت چندین شکل مولکولی (?s1, ?s2, ? and ?) با واریانت های آللی متنوع می باشد. بتاکازئین برای ساختار میسل های کازئین مهم می باشد و پلی مورفیک ترین ژن پروتئین موجود در شیر می باشد. برای انجام این تحقیق تعداد 10 نمونه خون شتر تک کوهانه از کشتارگاه مشهد و تعداد 5 نمونه خون شتر دو کوهانه از مرکز اصلاح نژاد شهر مشکین شهر استان اردبیل جمع آوری شد. پس از استخراج dna، تکثیر قطعه 927 جفت بازی از ناحیه ژنی بتاکازئین با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای اختصاصی طراحی شده براساس روش استاندارد انجام گردید. توالی یابی نواحی تکثیر شده به روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و به منظور تعیین فاصله ژنتیکی با توالی های حاصل از مطالعات دیگر، مورد مقایسه قرار گرفتند. دو تفاوت تک نوکلئوتیدی در اگزون شماره هفت و همچنین دو تفاوت تک نوکلئوتیدی در اینترون شماره 7 شترهای ایرانی در مقایسه با توالی قبلی شتر تک کوهان ثبت شده در ncbi مشاهده شد. همچنین نتایج آزمون فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor-joining نشان داد شتر ایرانی بیشترین شباهت را با گونه شتر تک کوهانه ثبت شده در ncbi دارا می باشد.