شناسایی ژن های موثر در بروز بیماری آلزایمر در مراحل اولیه با ابزار داده کاوی

بیماری آلزایمر یکی از شکل های جنون در دوره ی پیری است، این بیماری ازجمله بیماری های غیرقابل درمانی است که به طورمعمول در دهه های هفتم عمر انسان علائم خود را نشان می دهد. این بیماری ممکن است، سال ها بدون بروز علائم در بدن فرد وجود داشته باشد. با توجه به انجام تحقیقات بسیار زیاد بر روی این بیماری همچنان علل بروز آن مجهول مانده است. بیماری آلزایمر یا بر اساس توارث و یا به طور اتفاقی در فرد مسن ایجاد می شود. در این پایان نامه از کتابخانه های ریزآرایه مربوط به بیماران آلزایمر استفاده شد تا ژن هایی که در افراد مبتلابه این بیماری دچار افزایش و یا کاهش بیان شده اند شناسایی شود، لیست ژن های به دست آمده با سایر تحقیق هایی که تاکنون انجام شده مشابهت بسیار بالایی دارد و تنها تفاوت هایی در میزان بیان ژن ها وجود دارد که با توجه به تفاوت در نمونه ها امری طبیعی است. بعد از یافتن ژن های دچار تغییر بیان، نوبت به یافتن الگوهای خاص در توالی های ژن ها می رسد که این کار با استفاده از روش های وزن دهی انجام شد، توالی های tgcccc،agcctg،gaatat،aattg و aaattg با 8 تکرار به عنوان مهم ترین توالی ها شناخته شدند. درنهایت الگوریتم های داده کاوی بیزین، ماشین بردار پشتیبان، خوشه بندی، شبکه ی عصبی و درخت تصمیم روی 11 پایگاه داده (10 پایگاه داده حاصل از الگوریتم های وزن دهی و fc پایگاه داده ی اصلی) اجرا شد. الگوریتم های شاخه ماشین بردار پشتیبان بهترین عملکرد را با مقدار 89/0 داشتند و پایین ترین عملکرد را الگوریتم های گروه خوشه بندی با میانگین عملکرد 71/0 داشتند. با اجرای الگوریتم های درخت تصمیم روی پایگاه داده ها به این نتیجه رسیدیم که توالی aattg در بیماری آلزایمر یک بیومارکر مهم است که درخت تصمیم با استفاده از این توالی با دقت بالای 95/0 قادر به جدا کردن ژن ها به دو گروه افزایش و کاهش بیان می شود.