استفاده از داده های microarray در دسترس مخمر برای بررسی الگوی بیان ژن در استرس های مختلف

پایان نامه
چکیده

ساکارومایسس سرویزیه یکی از مهم ترین مدل ارگانیسم های موجود در بیوتکنولوژی می باشد. این ارگانیسم دردستکاری های ژنتیکی و تولید محصولات بیوتکنولوژیک نقش مهمی دارد. درک مکانیسم ها و فرآیند هایموجود در این ارگانیسم می تواند پنجره ای به سوی افزایش مقاومت ساکارومایسس و تولید محصولاتبیوتکنولوژِی بگشاید. هدف این مطالعه یافتن ژن های مرکزی در پاسخ به استرس های اکسیداتیو و محدودیتآمینواسید می باشد که می توانند جهت افزایش مقاومت این ارگانیسم مدنظر قرار گیرند. مسیر بیوسنتز بیوتین ابتدایی ترین پاسخ ساکارومایسس سرویزیه به استرس اکسیداتیو که به مرکزیت ژن های bio3، bio4 و bio5 اتفاق می افتد می باشد.پس از گذشت زمان سه و شش دقیقه از اعمال اثر اکسیداتیو، ساکارومایسس سرویزیه از فرآیند اکسیداسیون-احیا جهت پاسخ دادن به عامل استرس استفاده می کند. اعمال اثر اکسیداتیو در ساکارومایسس سرویزیه پس ازدوازده و بیست دقیقه باعث تنظیم در بیان ژن های مسئول در ساخت ریبوزوم می شود که این تغییرات در سطح شبکه به مرکزیت nop15 و rrp5به انجام می رسد. نحوه پاسخ در زمانهای چهل و هفتاد دقیقه تغییر کرده و این ارگانیسم از سیستم تخریب پروتئینی پروتئوزم به عنوان پاسخ اصلی استفاده می کند که در این پاسخ ژن ub14 به عنوان اصلی ترین ژن نقش ایفا می کند. ارگانیسم در زمان صدو بیست دقیقه هم چنان از سیاست قبلی جهت مقابله با استرس استفاده می کند اما در این مرحله این ژنssa1 است که مهم ترین نقش را بر عهده دارد. در محدودیت یوراسیل فرآیند های متابولیک مانند بیوسنتربیوتین و فرآینده های مرتبط با کو آنزیم ها به مرکزیت ژن های ub14 و cor1 دچار تغییر می شوند.ژنهایی مانند his4 و gcn4 در محدودیت آمینواسید لوسین، pho85 و pho81 در محدویت فسفات نقشمرکزی در شبکه و کنترل پاسخ را دارند.

منابع مشابه

بررسی بیان ژن پروتئینOpticin در رده های مختلف سلول های سرطانی

سابقه و هدف: Opticin از دسته پروتئوگلایکان های کوچک غنی از لوسین عمدتاً در چشم انسان یافت می شود. همچنین opticin در سطوح پایینی نسبت به چشم، در بافت های طبیعی مغز، غضروف، کبد و پوست نیز شناسایی شده است. در این مطالعه، بیان opticin در رده‌های سلول های سرطانی انسان بررسی شد. روش بررسی: در این پژوهش بنیادی، رده‌های سلول های سرطانی انسان شامل رده سلول A-172 (سرطان مغز)، رده سلول T47D (سرطان غدد پست...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

متن کامل

بررسی بیان ژن CIB4 در بافت‌های مختلف گوسفند کرمانی با استفاده از Real Time qPCR

سابقه و هدف: گوسفند کرمانی یکی از مهمترین نژادهای گوسفند بومی ایران است و به خوبی با شرایط محیطی خشن و نامطلوب قسمت جنوب شرقی کشور که آب و هوای گرم و خشک غالب است و مراتع کم و کم کیفت هستند سازگار شده است. پروتئین CIB4 یکی از اعضای خانواده‌ پروتئین‌های متصل‌شونده به کلسیم و اینتگرین، یعنی CIB می‌باشد که در باروری بالا موثر است. ژن CIB4 دارای 2 ترنسکریپت L-CIB4 و S-CIB4 می‌باشد. تا کنون وظایف بی...

متن کامل

بررسی تولید آنزیم پروتئاز قلیایی توسط مخمر یاروویا لیپولیتیکا با استفاده از محیط کشت‏ های مختلف

مقدمه: پروتئاز‏های قلیایی از مهم‏ترین آنزیم‏های صنعتی محسوب می‏شوند و با توجه به کاربرد‏های فراوانی که در حذف آلاینده‏های محیطی و پیشبرد فرآیند‏های صنعتی دارند، مورد توجه پژوهشگران‏ بسیاری قرار گرفته‏اند. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی مخمر بومی مولد آنزیم پروتئاز قلیایی و تعیین فعالیت آنزیم در این جدایه است. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: نمونه‏گیری ‏از خاک، آب و پساب کارخانه‏های مختلف انجام شد. به...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023