ارزیابی تصحیح اثر لبه در عملکرد روش های blast و h-tuple با استفاده از منحنی roc
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده علوم ریاضی
- نویسنده فاطمه رنجبر کفشگرکلایی
- استاد راهنما افشین فیاض موقر مهران نقی زاده قمی
- سال انتشار 1392
چکیده
هم ترازی بهینه یک ابزار ضروری جهت شناسایی عملکرد یک توالی زیستی برای زیست شناسان است. از جمله ابزار هایی که این هم ترازی بهینه و معنی داری آماری آن را محاسبه می کنند می توان به روش های blast و h-tupleاشاره کرد. تصحیح اثر لبه، روشی در بهبود معنی داری آماری هم ترازی بهینه می باشد. تصحیح اثر لبه در روش blast بررسی شده است. ما در این پایان نامه، تصحیح اثر لبه و تاثیر آن بر روش h-tuple را بررسی کرده و آن را با روش blast، با استفاده از منحنی roc، بر روی داده های واقعی مقایسه می کنیم. نتایج حاصل نشان می دهد که تصحیح اثر لبه کارایی هر دو روش را افزایش می دهد. همچنین روش h-tuple با تصحیح اثر لبه و بدون آن از روش blast کاراتر می باشد.
منابع مشابه
ارزیابی عملکرد روش های blast و h-tuple در مقایسه توالی های زیستی با استفاده از منحنی roc.
نمودار مشخصه عملکرد سیستم roc)) با توجه به عملکرد درست و اشتباه سیستم (روش یا دسته بندی کننده)، کارایی آن را نشان می دهد. عملکرد درست و اشتباه سیستم، با توجه به وضعیت مشاهدات در واقعیت و پیش بینی که سیستم برای مشاهدات انجام می دهد بدست می آید. پس با توجه به وضعیت مشاهدات در واقعیت و وضعیتی که دسته بندی کننده پیش بینی می کند یک جدول 2×2 می سازیم. از این جدول دو نسبت مثبت د...
ارزیابی عملکرد روش های dali ,blast , h-tuple و smith-waterman در مقایسه توالی های زیستی با استفاده از منحنی $roc$
مقایسه توالی های پروتئین ابزار مهمی است که می تواند باعث تشخیص عملکرد توالی ها و در نهایت منجر به طبقه بندی آنها گردد. این مقایسه ها می توانند از طریق ساختار و یا از طریق توالی پروتئین ها انجام پذیرند. هم ترازی ساختاری، ابزار با ارزشی برای مقایسه پروتئین هایی با عملکرد مشابه است که از لحاظ توالی شباهت کمتری دارند و عملکرد آنها به آسانی به وسیله تکنیک های استاندارد هم ترازی توالی کشف نمی...
اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملارزیابی خطاهای انسانی در حرفه پرستاری بخش مراقبتهای ویژه قلب با استفاده از روش SPAR-H
Background: Quality and safety are two major concerns in the medical professions. According to irreparable consequences arising from human errors in the intensive care unit, the safety level in these sectors is very important. This study aimed to evaluate the human errors in the intensive cardiac care unit nurses. Methods: This research was a qualitative study, conducted by SPAR-H method. In th...
متن کاملاثر چشمه میکروترمورها در تعیین مشخصات ساختگاهی با استفاده از روش H/V
در این مقاله تابع بزرگ‌نمایی ساختگاه در 10 ایستگاه شتاب‌نگاری متعلق به شبکه شتاب‌نگاری سازمان پیشگیری و مدیریت بحران شهر تهران در گسترده شهر تهران تعیین شده است. بدین منظور از ثبت نوفه‌های پیوسته در 40 روز متوالی و تحلیل آنها به روش نسبت طیفی مولفه‌‌های افقی به قائم (H/V)، استفاده شده است. نتایج به‌دست آمده نشان‌دهنده حساسیت تابع‌های بزرگ‌نمایی ساختگاه به میزان و منشأ نوفه صنعتی بوده است. ا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده علوم ریاضی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023