شناسایی و تأیید لوکوس های بین ریزماهواره ژنومی مرتبط با جنسیت در گیاه خرما

پایان نامه
چکیده

نخل خرما (phoenix dactylifera l.)، گیاهی تک¬لپه، دوپایه و با عمر طولانی است که از نظر اقتصادی از اهمیت بالایی در کشور ایران برخوردار است. از آنجا که باردهی این گیاه پس از 5 سال آغاز می¬گردد، تعیین جنسیت آن در مراحل اولیه رشد در سرعت بخشیدن به برنامه¬های اصلاحی و در هنگام احداث نخلستان بسیار مهم می¬باشد. بر این اساس برنامه¬ریزی برای انتخاب نخل خرمای مقاوم و پرمحصول احتیاج به شناسایی نشانگرهای مولکولی دارد. در این تحقیق از نشانگرهای دی.ان.ا از 11 آغازگر بین¬ریزماهواره¬ای 17 و 18 نوکلئوتیدی برای تکثیر دی.ان.ا الگو استفاده شد. از 36 رقم نخل خرما (11 رقم نر و 25 رقم ماده) استفاده شد.در مجموع 237 الل تکثیر شد که تمام آنها در بین ژنوتیپ¬ها چندشکلی نشان دادند. بیشترین تعداد الل¬های تکثیرشده مربوط به آغازگر ubc835، بیشترین شاخص محتوای چندشکلی مربوط به issr09 و بیشترین شاخص نشانگر مربوط به issr165 بود. در این تحقیق ارتباط بین صفت کیفی جنسیت و 237 الل تکثیرشده در 36 رقم نخل خرما مطالعه شد. با استفاده از روش رگرسیون چندگانه (گام-به¬گام)، سه الل bp 1150، bp1400 و bp 400 به ترتیب مربوط به آغازگرهای ubc890، issr04 و ubc835 به عنوان الل¬های مرتبط با جنسیت شناسایی شدند، همچنین صحت این الل¬های پیوسته¬به¬جنس با احتمال بسیار بالایی با استفاده از تجزیه تابع تشخیص مورد تأیید قرار گرفته شد. نتایج این تحقیق در تأمین اطلاعات اولیه برای انتخاب غیرمستقیم پایه¬های جنسی نر و ماده درخت خرما از طریق نشانگرهای مرتبط مفید می باشد.

منابع مشابه

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

بررسی ساختار تنوع ژنتیکی جمعیت های گندم نیای وحشیaegilops cylindrica با استفاده از لوکوس های بین ریزماهواره ژنومی

گونه آژیلوپس سیلندریکا (aegilops cylindrica)، یک آلوتتراپلوئید (28=x4=n2) با ژنوم ccdd است که با دورگ گیری بین گونه های دیپلوئید a. tauschii (14=x2=n2 ، dd) و a. caudata (14=x2=n2 ، cc) به وجود آمده است. این گونه، گیاهی یک ساله و متعلق به خانواده گرامینه می باشد. بررسی تنوع ژنتیکی در ژرم پلاسم های گیاهی پیش نیاز هر برنامه اصلاحی یا حفاظتی گیاهان است. این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی بین 35 ...

شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه‌های مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه‌های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری‌بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه‌ها با استفاده از آرایه‌های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده‌های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر ...

متن کامل

شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با تجمع آهن در دانه جمعیت هاپلوئیدهای مضاعف جو

آهن یکی از عناصر ضروری، کم مصرف برای اکثر گیاهان می­باشد که نقش مهمی در تثبیت ازت و فعالیت برخی از آنزیم­ها مانند کاتالاز، پراکسیداز و سیتوکروم اکسیداز دارد. به منظور مکان­یابی QTL­های مرتبط با میزان و غلظت آهن در دانه جو، 148 لاین هاپلوئید مضاعف حاصل از تلاقی رقم دو ردیفه استرالیایی Clipper و رقم شش ردیفه بومی الجزایر Sahara3771 در شرایط گلخانه­ای ارزیابی و صفات عملکرد دانه تک بوته، وزن هزار د...

متن کامل

شناسایی miRNA ها و ژن های هدف مرتبط با آنها در گیاه خشخاش ( Papaver somniferum)

miRNA ها یک رده از RNA های تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 17-22 نوکلئوتید می باشند. miRNA ها بیان ژن را پس از رونویسی از طریق تجزیه mRNA یا مهار ترجمه انها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرایند های بیولوژیکی و متابولیکی در گیاهان و جانوران بازی می کنند. روش های متعددی برای شناسایی miRNA ها موجود می باشد که یکی از ساده ترین و کم هزینه ترین انها ، روش شناس...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ایلام - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023