مقایسه مولکولی میگوی penaeus semisulcatus و زیرگونه آن p.semisulcatus persicus با استفاده از its 2 به عنوان نشانگر ژنومیک و d-loop به عنوان نشانگرمیتوکندریایی

میگوی ببری سبز خلیج فارس،p. semisulcatus یکی از گونه های مهم جنس penaeus در خلیج فارس است. براساس خصوصیات ریختی، زیرگونه جدیدی از آن، با نام p.(penaeus) semisulcatus persicus معرفی شده است. برای مطالـعه تفاوت های ژنتیکی میان گونه و زیر گونه مذکور، d-loop به عنوان نشانگر میتوکندریایی و its 2 به عنوان نشانگر ژنومیک مورد توجه قرار گرفتند. لذا 3 نمونه از گونه و 3 نمونه از زیر گونه از سواحل بوشهر جمع آوری و dna ژنومی استخراج شده از ماهیچه ی بدنی آن ها به عنوان الگو استفاده شد. بخشی از d-loop و طول کامل its 2 به ترتیب با استفاده از زوج آغازگرهای 12s(d-loopf) /pcr-ir(d-loopr) و its 2f/its 2r تکثیر و تعیین توالی شدند. همردیفی و فاصله ژنتیکی توالی ها با استفاده از نرم افزارهای clustalw2 و mega 5.2 بررسی و محاسبه شد. نتایج حاصل از آنالیز توالی ها، نشان داد d- loop غنی از at و its 2 غنی از gcمی باشد و گونه و زیرگونه تشکیل دو شاخه جداگانه می دهند. بر اساس قطعه ای با طول 615-613 نوکلوتید از d-loop و قطعه ای با طول 335 از its 2 فاصله ژنتیکی میان گونه و زیرگونه به ترتیب 9/31% تا 5/32% و 8/24% تا 3/32% محاسبه شد. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که گونه و زیرگونه مذکور در مقایسه با سایر گونه های جنس penaeus رابطه ژنتیکی نزدیک تری به هم دارند. داده های فوق وقوع دو گونه پنهان در میگوی ببری سبز را مورد توجه قرار می دهد.