شبیه سازی دینامیک مولکولی پیوند هیدروژنی در آب محدودشده در فضای نانومتری
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه خلیج فارس - دانشکده علوم پایه
- نویسنده ندا حیدری
- استاد راهنما حسین اسلامی نرگس مهدی پور
- سال انتشار 1391
چکیده
ما با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی به بررسی میکروسکوپی ساختار و دینامیک پیوند هیدروژنی در آب محدود شده بین صفحات آبگریز گرافینی پرداختیم. شبیه سازی مورد نظر را در مجموعه napt انجام دادیم. شبیه سازیها را با مدل spc/e برای آب، بین سطوح نانومتری گرافین در حالت تعادل با آب توده انجام دادیم. در این کار اتمهای سطح بصورت ثابت میباشد و شرایط مرزی متناوب در راستای x و y اعمال شده است. مولفه موازی فشار در kpa 101/3 ثابت شده است. ما هر دو خواص استاتیکی و دینامیکی آب را در بین دو صفحه تحلیل نمودیم. بدین صورت که با استفاده از بررسی تعداد پیوندهای هیدروژنی )در باریکههای موازی( در حال تعادل در این سیستم و مقایسه آن با آب توده به بالا بودن چگالی پیوند در اطراف دیوارهها پی میبریم. در مورد خواص دینامیک از از توابع همبستگی زمانی استفاده نمودیم. این توابع بسیار وابسته نفوذ مولکولی میباشند. با استفاده از این توابع مشاهده خواهیم کرد که نزول اولیه سریع این توابع به دلیل شکسته شدن پیوند هیدروژنی میباشد و نزول ثانویه این توابع به صورت نمایی به علت پدیده نفوذ میباشد.
منابع مشابه
شبیه سازی دینامیک مولکولی غیرتعادلی معکوس هدایت گرمایی در پلی آمید66 محدودشده در فضای نانو
شبیه سازی دینامیک مولکولی غیرتعادلی معکوس هدایت گرمایی در پلی آمید66 محدودشده در فضای نانو در این تحقیق با انجام شبیه سازی دینامیک مولکولی روی هدایت گرمایی فیلم های نانو متری پلی آمید 66 محدود شده بین صفحه های گرافیتی، خواص انتقال حرارت سیال محدود شده در فضای نانو را مورد مطالعه قرار داده ایم. برای این منظور شبیه سازی تعادلی سیستم در مجموعه-ی جدیدnapt انجام شده است [1]. که در این مجموعه تعدا...
بررسی نفوذ داروهای آسپیرین و ایبوپروفن در غشاء دولایه لیپیدی به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی
برهمکنش دو نوع داروی ضدالتهاب غیراستروئیدی آسپرین و ایبوبروفن همراه با یک غشاء مدل دولایه لیپیدی به کمک شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (Molecular Dynamic Simulation) بررسی شد. به منظور مطالعه‌ی تاثیر نوع دارو، حالت باری دارو، دوز دارو و وجود پروتئین غشائی انتگرالی بر نفوذ دارو در غشاء، 11 سیستم مختلف با شرایط یکسان شبیه‌سازی گردید. در هر سیستم 4 پارامتر نشان‌دهنده‌ی نفوذ و 9 پارامتر موثر بر نفوذ...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملشبیه سازی دینامیک مولکولی مایع یونی 1ـ بوتیل ـ3ـ متیل‌ایمیدازولیوم نیترات و رفتار دینامیکی مخلوط‌های دوتایی مایع یونی ـ آب
برای مدتی طولانی در گذشته آب به عنوان ناخالصی ناخواسته نسبت به مایعهای یونی خالص در نظر گرفته می شد، زیرا حضور مقدار کم آب ویژگی های مایع های یونی را تغییر زیادی می دهد. ولی در حال حاضر آب شریک بسیار مهمی برای مایع های یونی است، زیرا مخلوط مایع یونی ـ آب یک راهبرد آسان برای کنترل و دستیابی به ویژگی های یگانه هر دوی آن ها است. به کارگیری این نوع از مخلوط های دوتایی همچنین ...
متن کاملبررسی میانکنش پپتید ضد میکروبی سیکلوویولاسین o2 با غشا باکتری با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی
چکیده سیکلوتیدها پپتیدهای کوچک غنی از باندهای دی سولفید هستند که از گیاهان جدا شده اند و دارای طیف وسیعی از فعالیت های زیستی شامل فعالیت ضد میکروبی، ضد تومور، حشره کشی وAnti-HIV می باشند. با توجه به افزایش باکتری های مقاوم به دارو، جامعه ی جهانی در حال رویارویی با یک چالش جدی است و نیازی ضروری به ترکیبات جدید برای درمان بیماری ها احساس می شود. سیکلوتید ها به عنوان پپتیدهای کوچک، پتانسیل بالایی ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه خلیج فارس - دانشکده علوم پایه
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023