بررسی کنفورماسیونی دی پپتید محافظت شده ی hco-cys-ala-nh2 با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی
پایان نامه
- دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده شیمی
- نویسنده مهدی محسنی
- استاد راهنما بهزاد چهکندی مجید محمد حسینی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1391
چکیده
در این تحقیق مقادیر انرژی، زوایای دای هدرال، نوع مهاجرت ها و تاخوردگی صورت بندی های انواع lو d دی پپتید محافظت شده سیستئین – آلانین در فاز گازی با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در سطح b3lyp و سری پایه 6-31g(d)تعیین گردید.ساختار های پایدار در حالت های متفاوت از مناطق 9 گانه ی نقشه راماچاندران بدست آمده اند. بدین ترتیب که یکی از آمینواسید ها در یک منطقه ثابت نگه داشته شده و آمینواسید دیگر در مناطق مختلف نقشه راماچاندران تغییر می-یافت. زنجیر جانبی آمینواسید در سه حالت آنتی، گوچ مثبت و گوچ منفی قرار داده شده که برای هر کدام از حالت های زنجیر جانبی، 81 حالت و در مجموع برای هر کدام از آمینواسید ها، 243 حالت محاسبه شده است. نتایج محاسبات نشان می دهد که در دی پپتید محافظت شده l و d سیستئین – آلانین، فرم های پایدار به عنوان یک تاخوردگی نوع بتا یا به اصطلاح بتا ترن، در نقشه ی راماچاندران وجود ندارند.
منابع مشابه
مطالعه کانفورماسیونی دی پپتید محافظت شده hco-gly-l-val-nh2 با استفاده از محاسبات کوانتومی
در این تحقیق ? کنفورماسیون های دی پپتید hco–gly –l–val–nh2 که در پروتئین های متعددی وجود دارد ? در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است . محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 3 و با بهره گیری از سطوح مختلف تئوری و سری های پایه زیر انجام شده است . ? hf/6-31g* ? hf/6–311++g** ? b3lyp/6–31g* ? mp2/6–31g* بدین صورت که ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورماسیون های حاصل از چرخش زاویه (?...
بررسی کنفور ماسیونی دی پپتید محا فظت شده ی hco-ser-ala-nh2 با استفاده از محاسبات مکا نیک کوانتو می در فاز گازی
در این تحقیق ? کنفورماسیون های دی پپتیدhco–l-ser-l-ala–nh2و hco–d-ser-d-ala–nh2که در پروتئین های متعددی وجود دارد ? در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است. محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 3 و با بهره گیری از سطح تئوری g*31-6b3lyp/انجام شده است. بدین صورت که ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورماسیون های حاصل از چرخش زاویه (c) به فواصل30 درجه از صفر درجه تا 360 درجه محاسبه شدند که سه مین...
15 صفحه اولمطالعه کنفورمرهای مختلف دی پپتید محافظت شده hco-gly-l-leu-nh2 با استفاده از محاسبات کوانتومی
چکیده : در این تحقیق ، کنفورماسیون های مختلف دی پپتید hco-gly-l-leu-nh2 در اثر چرخش زنجیر های جانبی و زوایای پیچشی اسکلت ، در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است . محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 در سطح hfبا سری پایه 6-31g*و6-311++g** و در سطح b3lyp با سری پایه 6-31g* انجام شده است. در ابتدا از چرخش زاویه زنجیره جانبی (?1) ، به فواصل?30 از صفر تا ?360 درجه ساختار های بهینه و انرژی محا...
15 صفحه اولبررسی ساختاری کنفورمرهای مختلف تری پپتید محافظت شده hco-gly-l-ileu-gly-nh2 در فاز گازی با استفاده از محاسبات کوانتومی
چکیده ندارد.
15 صفحه اولبررسی ساختاری و ترمودینامیکی تری پپتید hco-val-gly-gly-nh2 با استفاده ازمحاسبات مکانیک کوانتومی
در این تحقیق می توان به نتایج زیر دست یافت : نتایج محاسبات برای کنفورماسیون های مختلف حاصل از چرخش زنجیر جانبی آمینواسید والین برای تری پپتیدهای val-gly-gly-nh2-hco ? hco-gly-gly-val-nh2 وhco-gly-val-gly-nh2 در دو فرم l و dدر سطح تئوری b3lyp با سری پایه (d)g31-6 به کمک نرم افزار گوسین ?سه مینیمم در زوایای ?60 =? ، ?180 = ? و? 60- = ? نشان داد ، که به ترتیب : گوچ مثبت (+g) ، آنتی (a) و گوچ منفی...
15 صفحه اولاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده شیمی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023