مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی survivin و بررسی اثر جهش t34a بر ساختار پروتئین

پایان نامه
چکیده

survivin پروتئینی است که مرگ برنامه‏ریزی شده سلول (آپاپتوز) را مهار نموده و چرخه تقسیم سلولی را نیز تنظیم می‏نماید. این پروتئین به شدت در اغلب تومورهای انسانی بیان می‏شود، اما در اکثر بافت‏های طبیعی تمایز‏یافته قابل شناسایی نیست. از میان مطالعات مرتبط با تاثیر جهش‏های مهارکننده survivin در سلول‏های سرطانی، فرم جهش‏یافته t34a مورد توجه بیشتری قرار گرفته است. نتایج به دست آمده از مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار طبیعی و جهش‏یافته این پروتئین نشان می‏دهد که ایجاد جهش فوق احتمالاً برهمکنش‏های بین survivin و پروتئین‏های hbxip (فاکتور کمکی برای اجرای عملکرد آنتی‏آپاپتوزی survivin) و xpo 1 (پروتئینی که به خروج survivin از هسته کمک می‏نماید) را دچار اختلال می‏‏نماید. از سوی دیگر، این جهش ممکن است باعث تسهیل و تقویت برهمکنش‏های میان survivin و پروتئین‏های smac/diablo (پروتئین مهارکننده فعالیت آنتی‏آپاپتوتیک survivin)، borealin و incenp (دو زیر‏واحد‏ موجود در کمپلکس cpc که در تنظیم صحیح چرخه تقسیم سلولی نقش دارند) و نیز هیستون h3 (پروتئین مورد نیاز برای تفکیک صحیح کروموزوم‏ها در حین تنظیم چرخه تقسیم سلولی) گردد. نتایج مذکور با نتایج به دست آمده از مطالعات تجربی سازگارند.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی p53 و بررسی اثر جهش g245s بر ساختار پروتئین

پروتئین p53، یک مهار‏کننده‏ی تومور کلیدی در سلول است که به هنگام آسیب به dna فعال می‏شود و مهمترین عملکرد خود که توقف چرخه‏ی سلولی و آپاپتوز است را انجام می‏دهد. پروتئین p53 در بیش از 50% سرطان‏ها جهش می‏یابد و 99% این جهش‏ها در دمین اتصالی به dna رخ می‏دهد. موقعیت اکثر این جهش‏ها (بیش از 90%) در لوپ‏‏های سطحی پروتئین (لوپ‏های l3 و l2) و موتیف lsh (loop sheet helix) جای گرفته است. لوپ‏های سطحی ...

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی p16و بررسی اثر جهش a118t بر ساختار پروتئین

p16 یک مهارکننده تومور کلیدی است که جهش آن در بیش از 70 نوع سرطان مختلف گزارش شده ‏است. این پروتئین در شرایط استرسی، مهمترین عملکرد خود را در جهت توقف چرخه‏ی سلولی، از طریق اتصال اختصاصی به cdk4 و cdk6 و متوقف کردن عملکرد آنها انجام می‏دهد. فقدان فعالیت p16 یکی از مهم-ترین وقایعی است که با سرطان‏های انسانی همراه می شود. در مطالعه حاضر، برای بررسی تاثیر جهش a118tبر ساختار و عملکرد p16، ساختار پر...

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی پروتئین shp-2 و بررسی اثر جهش y63c بر ساختار آن

پروتئین shp-2 یکی از تیروزین‏فسفاتازهای مهم در مسیرهای پیام‏رسانی سلول‏های انسانی است. این پروتئین شامل یک دومین کاتالیتیک (ptp) و دو دومین تنظیمی c-sh2) و (n-sh2 است. وقوع برخی از جهش‏های تغییر‏دهنده‏ی معنا در ژن ptpn11 که کدکننده‏ی shp-2 است، این آنزیم را فعال‏تر کرده و منجر به بروز برخی ناهنجاری‏های ژنتیکی، از جمله سندرم نونان می‏گردد. برای بررسی اثر جهش فعال‏کننده‏ی تیروزین 63 به سیستئین بر...

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدیstk11/ lkb1 و بررسی اثر جهش d194a بر ساختار آنزیم

ژن lkb1 یکی از پروتئین‏های خانواده سرین-ترئونین کیناز سلولی را رمز می‏نماید که قطبیت و تکثیر سلولهای اپیتلیال را متناسب با وضعیت انرژی سلول تنظیم می‏کنند. جهش‏های غیر‏فعال کننده در این ژن به سندروم peutz-jeghers منجر می شوند که در افراد مبتلا، استعداد ابتلا به انواع سرطان‏ها افزایش می‏یابد. lkb1 با اتصال به یک سودوکیناز غیر‏فعال به نام strad و یک پروتئین آداپتور به نام mo25 فعال می‏شود. در این ...

مدل‏سازی و شبیه‏سازی دینامیک مولکولی ساختار سه‏بعدی cdk2 و بررسی اثر جهش e172a بر ساختار آنزیم

از ویژگی‎های پروتئین‏ کینازهای یوکاریوتیک، وجود دو ناحیه ساختاری با هم تکامل‏یافته قطعه فعال‎کننده و زیردمین ghi می‏باشد. قطعه فعال‎کننده بین و شامل دو موتیف حفاظت‏شده آسپارتات-فنیل‏آلانین-گلیسین (dfg) و آلانین-پرولین-گلوتامات (ape) می‏باشد و زیردمین ghi نیز از مارپیچ‏های g، h و i تشکیل شده است. این دو قطعه توسط پل‏نمکی حفاظت‏شده‏‏ایی که بین گلوتامیک‎اسید موتیف ape و آرژنینی که در زیردمین ghi ق...

Survivin-T34A: molecular mechanism and therapeutic potential

The inhibitor of apoptosis protein survivin's threonine 34 to alanine (T34A) mutation abolishes a phosphorylation site for p34(cdc2)-cyclin B1, resulting in initiation of the mitochondrial apoptotic pathway in cancer cells; however, it has little known direct effects on normal cells. The possibility that targeting survivin in this way may provide a novel approach for selective cancer gene thera...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده علوم

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023