شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های احتمالی درگیر در مقاومت به سرمازدگی و یخ زدگی در سیب (malus domestica) و انگور (vitis vinifera)

پایان نامه
چکیده

تنش دمای پایین یکی از مهم ترین عوامل محیطی است که عملکرد گیاهان را محدود می نماید. شبکه وسیعی از ژن های مختلف در تنظیم تحمل گیاه به این تنش نقش ایفا می نمایند. در این تحقیق، نخست 921 عدد از ژن های مذکور از تحقیقات و مقالات معتبر علمی استخراج گردید و سپس به منظور شناسایی ژن های مشابه با آنها در ژنوم کامل دو گیاه سیب (malus domestica)و انگور (vitis vinifera)، توالی آمینو اسیدی این ژن ها در گیاه مدل آرابیدوپسیس از سایت ncbi استخراج شد و با استفاده از برنامه blastp با پایگاه های داده apple gene set (amino acid) و grape gene set (amino acid) در سایت iasma مورد مقایسه قرار گرفت. و نتایج کلی به دست آمده در 8 بازه تشابه مختلف، گروه بندی گردید و ژن های دارای همولوگ و فاقد همولوگ بر اساس معیارهای علمی در هر دو گیاه شناسایی شد.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی و تعیین مقاومت به سرما و یخ زدگی سه رقم تجاری انگور در شمال خراسان

به منظور مطالعه اثرات سرمازدگی و یخبندان طولانی مدت در سال 1386 بر روی مهمترین ارقام انگور در شمال خراسان، دو آزمایش تحقیقی انجام گرفت. در آزمایش اول و با توجه به اینکه ارقام کلاهداری و کج انگور از عمده­ ترین و مرغوبترین ارقام منطقه جهت فرآوری، تازه خوری و صادرات می باشند، اثر سرمای طبیعی بر شاخه های یک، دو و چندساله این ارقام در دو شرایط اقلیمی مشهد و بجنورد و در آزمایش دوم، شاخه­های یک، دو و ...

متن کامل

Degenerate Four Wave Mixing in Photonic Crystal Fibers

In this study, Four Wave Mixing (FWM) characteristics in photonic crystal fibers are investigated. The effect of channel spacing, phase mismatching, and fiber length on FWM efficiency have been studied. The variation of idler frequency which obtained by this technique with pumping and signal wavelengths has been discussed. The effect of fiber dispersion has been taken into account; we obtain th...

متن کامل

بررسی خواص ضدجهشی و سایتوتوکسیک عصاره پوست سیب Malus domestica

سابقه و هدف: در حال حاضر سرطان یکی از علل عمده مرگ و میر در جهان است بنابراین از پیشگیری می­توان به عنوان مهم­ترین رویکرد درمانی سرطان درنظر گرفت. رژیم غذایی نقش مهمی در پیشگیری از سرطان بازی می­کند. امروزه محققان توجه ویژه­ای به غذاهای طبیعی دارند که می­توانند به طور چشمگیری نقش پیشگیری  از  سرطان را داشته باشند. هدف از این تحقیق سنجش خواص ضدجهشی و ضدسرطانی عصاره پوست سیب بود. روش بررسی: در ای...

متن کامل

مقایسه روش‌های مختلف استخراج RNA در برگ سیب (Malus domestica)

سابقه و هدف: جداسازی RNA از گیاهانی که دارای مقدار زیادی ترکیبات پلی‌ساکارید و پلی‌فنل می‌باشند به علت اتصال و رسوب این ترکیبات با RNA  مشکل است. بنابراین در این مطالعه 11 پروتکل مختلف استخراجRNA  از برگ‌های سیب  غنی از ترکیبات فنلی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: کیفیت و کمیت  RNAبا الکتروفورز ژل آگارز 1.2% و اسپکتروفتومتری نانودراپ در طول موج 230، 260 و 280 نانومتر تعیین شد و سنتز cDNA و...

متن کامل

بررسی و تعیین مقاومت به سرما و یخ زدگی سه رقم تجاری انگور در شمال خراسان

به منظور مطالعه اثرات سرمازدگی و یخبندان طولانی مدت در سال 1386 بر روی مهمترین ارقام انگور در شمال خراسان، دو آزمایش تحقیقی انجام گرفت. در آزمایش اول و با توجه به اینکه ارقام کلاهداری و کج انگور از عمده­ ترین و مرغوبترین ارقام منطقه جهت فرآوری، تازه خوری و صادرات می باشند، اثر سرمای طبیعی بر شاخه های یک، دو و چندساله این ارقام در دو شرایط اقلیمی مشهد و بجنورد و در آزمایش دوم، شاخه­های یک، دو و ...

متن کامل

بررسی ارتباط مقاومت به بیماری آتشک (Fire Blight) با صفات مختلف رویشی و زایشی در ارقام سیب (.Malus domestica Borkh)

بیماری آتشک از معضلات مهم کاشت و پرورش درختان میوه دانه دار در کشور ما و در بیش از 40 کشور جهان می باشد. در بین روش های مبارزه با بیماری استفاده از ارقام مقاوم موثرترین و کم هزینه ترین روش است. در این تحقیق به منظور شناخت منابع مقاومت و انتخاب بهترین والدین جهت اصلاح ارقام مقاوم سیب (Malus domestica Borkh.) به بیماری، همبستگی صفات رویشی و زایشی با صفت مقاومت به آتشک در گروه های مختلف ارقام داخل...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023