بررسی نقش اسیدآمینه های موجود در سطح مشترک آکاربز-آلفاآمیلاز از گونه باسیلوس kr- 8104 در مهارآنزیم و اتصال آکاربز

چکیده: آکاربز یک داروی ضد دیابت است که هیدرولیز نشاسته توسط آلفا-آمیلاز را مهار می کند. بررسی مکانیسم مهار و اسیدهای آمینه درگیر در این مهار می تواند کمک شایانی به طراحی داروهای موثرتر مشتق از آکاربز کند. bacillus subtilis مقایسه توالی اسی دهای آمینه و ساختار کریستالوگرافی آنزیم آلفا- آمیلاز بدست آمده از مشخص م یکند که با وجود شباهت بسیار زیاد، مهار آنها در به bacillus kr-8104 (bka) و (bsua) انتخاب bka در جایگاه فعال tyr و 175 ser وسیله آکاربز متفاوت است. در این مطالعه دو اسید آمینه 105 شوند. (phe و 175 phe 105) bsua شد هاند تا به روش جه شزایی هدفمند تبدیل به معادل آنها در برای همه ic و 50 ki کاهش پیدا کرده است. همچنین ثابت مهار kcat و km پارامترهای سینتیکی از جمله آنزی مهای جهش یافته افزایش پیدا کرده که نشان دهنده اهمیت هر دو اسید آمینه در مهار توسط آکاربز است. با tyr با آکاربز و 175 ser نشان می دهد که با این تغییر پیوند های هیدروژنی که 105 docking مطالعات دیگر اسیدهای آمینه که در جایگاه فعال قرار دارند و ایجاد شبکه پیوند هیدروژنی می کنند از بین می رود و این دلیل اصلی کاهش حساسیت جهش یافته ها نسبت به آکاربز در مقایسه با آنزیم وحشی است.