مطالعه برهمکنشهای بین مولکولی در ساختار بلورین2’3’-di-o-acetyl-5’-deoxy-5-fluorocytidine توسط محاسبات نظریه تابعیت چگالی پارامترهای nqr وnmr
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
- نویسنده سیروس یوردخانی
- استاد راهنما ناصر هادیپور
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
برهمکنش های بین مولکولی، خصوصاً پیوند هیدروژنی، در سیستم های بیولوژیکی از اهمیت فراوانی برخوردار می باشند، و تعیین خواص دقیق آنها بسیار مشکل است. ویژگی های مختلف برهمکنش های n-h…h با استفاده از تئوری تابعیت چگالی مورد بررسی قرار گرفته اند. در این پژوهش، تانسورهای پوشیدگی شیمیایی و شیب میدان الکتریکی هسته های اکسیژن، نیتروژن و هیدروژن، اوربیتال های پیوندی طبیعی در مولکول 2’3’-di-o-acetyl-5’-deoxy-5-fluorocytidine کریستالی با استفاده از تابعیت b3lyp و سری پایه 6-311++g(d,p) بدست آمده و مورد بررسی قرار گرفته اند. در بین دو مدل انتخابی تانسورهای طیف سنجی رزونانس مغناطیس هسته در مدل شماره 2 نسبت به مدل 1 روند منظمتری را نشان می دهند. در قسمت دیگر این پژوهش فرم های تاتومری سیتوزین، 1- متیل-5- فلئورو سیتوزین و 2’3’-di-o-acetyl-5’-deoxy-5-fluorocytidine مورد بررسی قرار گرفته اند. تانسورهای پوشیدگی شیمیایی و شیب میدان الکتریکی هسته ها در این ساختارهای تاتومری با استفاده از تابعیت b3lyp و سری پایه 6-311++g(d,p) بدست آمده اند. نتایج بدست آمده حاکی از آن است که در بین تمامی فرم ها، فرم imino-oxo پایدارترین فرم در حالت گازی است.
منابع مشابه
Hydrolysis of capecitabine to 5'-deoxy-5-fluorocytidine by human carboxylesterases and inhibition by loperamide.
Capecitabine is an oral prodrug of 5-fluorouracil that is indicated for the treatment of breast and colorectal cancers. A three-step in vivo-targeted activation process requiring carboxylesterases, cytidine deaminase, and thymidine phosphorylase converts capecitabine to 5-fluorouracil. Carboxylesterases hydrolyze capecitabine's carbamate side chain to form 5'-deoxy-5-fluorocytidine (5'-DFCR). T...
متن کامل5-O-Acetyl-d-ribono-1,4-lactone
The title compound, C(7)H(10)O(6), was obtained from a regioselective enzyme-catalysed acyl-ation of d-ribono-1,4-lactone. The five-membered ring of the acyl-ated sugar shows an envelope conformation. In the crystal, the mol-ecules are linked by inter-molecular O-H⋯O hydrogen-bonds, forming a one-dimensional polymeric structure parallel to [010]. In addition, packing analysis shows stacking alo...
متن کاملIdentification of the cytosolic carboxylesterase catalyzing the 5'-deoxy-5-fluorocytidine formation from capecitabine in human liver.
Capecitabine, a prodrug of 5-fluorouracil, is first metabolized to 5'-deoxy-5-fluorocytidine (5'-DFCR) by carboxylesterase (CES), which is mainly expressed in microsomes. Recently, we clarified that 5'-DFCR formation was catalyzed by the enzyme in cytosol as well as microsomes in human liver. In the present study, the cytosolic enzyme involved in 5'-DFCR formation from capecitabine was identifi...
متن کاملBioactivation of capecitabine in human liver: involvement of the cytosolic enzyme on 5'-deoxy-5-fluorocytidine formation.
Capecitabine, an anticancer prodrug, is thought to be biotransformed into active 5-fluorouracil (5-FU) by three enzymes. After oral administration, capecitabine is first metabolized to 5'-deoxy-5-fluorocytidine (5'-DFCR) by carboxylesterase (CES), then 5'-DFCR is converted to 5'-deoxy-5-fluorouridine (5'-DFUR) by cytidine deaminase. 5'-DFUR is activated to 5-FU by thymidine phosphorylase. Altho...
متن کاملPeroxynitrite reaction products of 3',5'-di-O-acetyl-8-oxo-7, 8-dihydro-2'-deoxyguanosine.
Of the DNA bases, peroxynitrite (ONOO-) is most reactive toward 2'-deoxyguanosine (dGuo), but even more reactive with 8-oxo-7, 8-dihydro-2'-deoxyguanosine (8-oxodGuo), requiring a 1,000-fold excess of dGuo to provide 50% protection against the reaction with 8-oxodGuo. Therefore, it seems reasonable that 8-oxodGuo is a potentially important target in DNA and that the structures of the reaction p...
متن کامل1,2,3-Tri-O-acetyl-5-deoxy-d-ribofuranose
The title compound, C(11)H(16)O(7), was obtained from the breakage reaction of the glycosidic bond of 5'-de-oxy-2',3'-diacetyl-inosine. The ribofuran-ose ring has a C2-exo, C3-endo twist configuration. No alteration of the relative configuration compared with d-(-)-ribose is observed.
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023