تجزیه و تحلیل توالی هایest گونه triticum monococcum، خویشاوند وحشی گندم نان، به منظور تعیین گروه های کارکردی و بررسی بیان ژن ها

پایان نامه
چکیده

بررسی expressed sequence tags یا ests قابلیت روشن ساختن جنبه های مولکولی گذار به گلدهی، به عنوان چشمگیرترین تغییر تکاملی در گیاهان به وسیله مطالعه انتقال مریستم راسی ساقه shoot apical meristem (sam) از وضعیت رویشی به وضعیت گل آذین را داراست. در این مطالعه دو کتابخانه ی est مربوط به مریستم راسی ساقه گونه ی triticum monococcum (amam)، به عنوان یک گیاه دیپلوئید مدل، در مراحل رویشی و آغاز فاز زایشی مورد بررسی قرار گرفت. دسته بندی و آنالیز این توالی ها و به دنبال آن انجام آزمون های آماری وجود اختلاف معنی دار در شانزده گروه کارکردی مختلف همچون پروتئین، دیواره سلولی، علامت دهی و پروتئین های تنظیمی بین دو مرحله را نشان داد که بیانگر تغییر جهت دار فعالیت ژنوم طی گذار به گلدهی است. نمایه یابی بیان ژن ها بر اساس آزمون آماری audic and claverie مبین بیان افتراقی 37 ژن مختلف نظیر sus1، erd15، gr-rbp2، spl 16 و samdc و غیره، متعلق به گروه های کارکردی متفاوت، بود.. پنج ژن ناشناخته با بیان افتراقی در بین سایر ژن ها شناسایی شد که ساختار و کارکرد پروتئین مربوط به آن ها توسط ابزار های بیوانفورماتیک پیش بینی و بررسی گردید. در یک نتیجه گیری کلی می توان چنین استنباط نمود که فرآیند گذار به گلدهی فرآیندی است پیچیده که بخش های متعددی از ژنوم را به خود مشغول می کند. همچنین به نظر می رسد تعداد زیادی ژن به خصوص برخی عوامل رونویسی و پروتئین های علامت دهی نقش حیاتی در این فرآیند ایفا می کنند

منابع مشابه

بررسی کارکردی ژن های کاندید مقاومت به خشکی در گندم نان و برخی خویشاوندان وحشی آن

چکیده تنش خشکی مانع از تظاهر کامل پتانسیل ژنتیکی گیاهان زراعی می شود و از این رو موجب کاهش تولیدات کشاورزی می گردد. کمبود آب می تواند باعث القای ژن ها و تغییر الگوی بیان ژن در گیاه گردد. روش آنالیز expressed sequence tag (est) راهی سریع و منطقی برای کاندید کردن ژن های جدید برای مقاومت به تنش ها می باشد. در این تحقیق تعداد 12 کتابخانه est شاهد و تنش خشکی گندم و خویشاوندان وحشی آن شامل 37138 توا...

بررسی تنوع ژنتیکی گونه های وحشی و خویشاوند گندم

اهمیت تنوع ژنتیکی در گندم زراعی و اهداف اصلاحگران دلایلی هستند که ضرورت ارزیابی تنوع ژنتیکی گونه های وحشی و خویشاوند گندم به منظور اصلاح ارقام زراعی مقاوم به تنش ها و دارای عملکرد بالا را توجیه می کند. این پژوهش به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی 6 گونه آژیلوپس با استفاده از نشانگرهای issr انجام گرفت. همچنین، از دو روش پروتئینی sds-page و acid-page نیز برای تجزیه میزان تنوع استفاده شد. در روش sds-pag...

15 صفحه اول

مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها

سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...

متن کامل

تجزیه توالی ژن گلیادین در برخی گندم های نان ایران

یکی از صفات مهم در اصلاح کیفی گندم ارزش نانوایی آن است.تقریبا در تمام برنامههای مدرن اصلاحی ،کیفیت از اولویت بالایی بر خوردار است. یکی از مهمترین عواملی که در کیفت نان گندم تاثیر به سزایی دارد پروتئین های ذخیرهای دانه گندم گلوتنین و گلیادین است.گلیادینها پروتیئنهای مونومریکی هستند که در حدود 30 تا40 درصد از کل پروتئین های ذخیره ای دانه گندم را به خود اختصاص میدهند وباعث خاصیت کشسانی والاستیسیته...

بررسی چندشکلی نشانگرهای ایزوزیمی گونه های خویشاوند گندم نان

گونه های مختلفaegilops و triticum به دلیل خویشاوندی با مهم ترین گیاه زراعی مورد استفاده انسان یعنی گندم نان (triticum aestivum, l.) از اهمیت ژنتیکی و اقتصادی خاصی برخوردار هستند. در این پژوهش، هشت گونه مختلف از جنس های aegilops و triticum، از هر گونه سه جمعیت و از هر جمعیت 21 فرد مورد ارزیابی ایزوزیمی قرار گرفت. روش مورد استفاده الکتروفورز آکریلامید افقی با سیستم بافری ناپیوسته بود. از بین آنزی...

15 صفحه اول

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023