آنالیزفیلوژنتیک ومدل سازی ویروس در بیمارا ن آلوده ایرانی hiv براساس ناحیه v3-loop
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
- نویسنده شهاب فلاحی
- استاد راهنما مهرداد روانشاد محبوبه حاجی عبدالباقی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
مقدمه: امروزه از روش های مختلف مدل سازی در پزشکی بالینی، در تشخیص بیماری ها و بررسی ویژگی های مولکولی آنها استفاده می شود. در میان روشهای نوین مدلسازی، سیستمهای فازی از جایگاه ویژه ای در زمینه های مختلف علوم برخوردارند. هدف از این مطالعه بکارگیری یک مدل هوشمند ریاضی برای پیش بینی قدرت زنوتیپی ویروس hiv بر اساس تعدادی از ویژگی های ساختاری پپتید حاصل از ناحیه ی v3 loop است. مواد وروش ها: در مطالعه ی حاضر یک جفت پرایمر دژنره طراحی و بهینه سازی گردید و در ترکیب با hemi nested pcr برای تشخیص تاحیه ی v3- loop ژن env طیف وسیعی از ژنوتیپ های ویروس hiv-1 که دارای تغییرات نوکلئوتیدی بسیار شدید است استفاده گردید. در مرحله ی بعد گروهی از ویژگی های پپتید حاصل از ناحیه ی v3 برای مدل سازی زنوتیپ های ویروس با استفاده از شبکه های عصبی مصنوعی مورد مطالعه قرار گرفتند.بحث: در این مطالعه، از دو پرایمر دژنره جدید با قابلیت اتصال به نواحی اختصاصی از ژنوم استفاده گردید. در مرحله بعد داده های مولکولی بدست آمده از تکثیر ناحیه ی v3- loop برای مدل سازی ریاضی مورد استفاده قرار گرفتند. مدل ایجاد شده به خوبی موفق به تشخیص ژنوتیپ ویروس از روی خصوصیات تعیین شده بود.
منابع مشابه
اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملتعیین ساب‌تایپ‌های ویروس هپاتیت C در بیماران تالاسمی ایران به روش آنالیزفیلوژنتیک ناحیه NS5b
چکیده سابقه و هدف بیماران تالاسمی به تزریق مکرر خون نیاز دارند و در معرض خطر ابتلا به هپاتیت C هستند. بالا بودن فراوانی این ویروس در جمعیت تالاسمی، عوارض سنگین ناشی از آلودگی با آن و اهمیتی که تعیین تیپ ویروس در درمان آلودگی دارد، از دلایل انجام این تحقیق بود. این مطالعه با هدف شناسایی آلودگی مزمن در بیماران تالاسمی و تعیین تیپ‌هایی از ویروس که این گروه با آن آلوده هستند، انجام گرفت. مواد و ر...
متن کاملکاندیدیازیس دهانی در بیماران آلوده به ویروس نقص سیستم ایمنی (HIV) در ایران
Normal 0 false false false EN-US X-NONE AR-SA MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal" mso-tsty...
متن کاملCovariability of V3 loop amino acids.
We reanalyzed for covariability a set of 308 human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) V3 loop amino acid sequences from the B envelope sequence subtype previously analyzed by Korber et al.,1 as well as a new set of 440 sequences that also included substantial numbers of sequences from subtypes A, D, and E. We used the measure employed by Korber et al., essentially the likelihood ratio statis...
متن کاملتعیین ساب تایپ های ویروس هپاتیت c در بیماران تالاسمی ایران به روش آنالیزفیلوژنتیک ناحیه ns۵b
چکیده سابقه و هدف بیماران تالاسمی به تزریق مکرر خون نیاز دارند و در معرض خطر ابتلا به هپاتیت c هستند. بالا بودن فراوانی این ویروس در جمعیت تالاسمی، عوارض سنگین ناشی از آلودگی با آن و اهمیتی که تعیین تیپ ویروس در درمان آلودگی دارد، از دلایل انجام این تحقیق بود. این مطالعه با هدف شناسایی آلودگی مزمن در بیماران تالاسمی و تعیین تیپ هایی از ویروس که این گروه با آن آلوده هستند، انجام گرفت. مواد و روش...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023