جداسازی و بررسی تنوع ژنتیکی استرپتومایسس های جداسازی شده از خاک اردبیل با استفاده از تکنیک ardra و eric- pcr

استرپتومایسسها (streptomyces )از جمله باکتریهای گرم مثبت خاکزی هستند که در راسته اکتینومایسیته ( actinomycetes ) قرار دارند. این باکتریها کاربردهای بیشماری دارند و اشکال استفاده از آنها در پزشکی، کشاورزی، جنگل وبیوتکنولوژی بسیار گسترده است بطوریکه نیمی از آنتی بیوتیک های مصرفی و تولیدی جهان از استرپتومایسس ها بدست می آید با این وجود شرایط اقلیمی متفاوت ایران که می تواند گونه های بسیاری از استرپتومایسس را در خود داشته باشد متاسفانه هنوز در ایران برای پیدا نمودن تنوع استرپتومایسس ها و به تبع آن جداسازی انتی بیوتیک های با قدرت بیشتر انجام نشده است دراین تحقیق بمنظور شناسایی و بررسی تنوع استرپتومایسس ها، نمونه خاک از مناطق مختلف اردبیل، آستارا ،مشکین شهر ، سرعین ودر فصول مختلف سال انجام شد. با انتقال نمونه های خاک به آزمایشگاه ph خاک ها اندازه گیری و پس از رقت سازی در محیط کشت اختصاصی sca کشت داده شدند. پس از ظاهر شدن کلونی باکتری ها رنگ آمیزی گرم انجام و عکسبرداری شده و استوک گیری شدند. پس از کشت دوباره در محیط کشت مایع isp استخراج dna انجام شده و با استفاده از جفت پرایمر های اختصاصی ژن 16srdna تکثیر داده شدند. به منظور شناسایی گونه باکتری ها با استفاده از انزیم mspi محصول فرمنتاز برش داده شدند و با استفاده از برنامه بیوانفورماتیک gene doc الگوی برشی با الگوی برشی حاصل از برش توالی های ثبت شده در ncbi مورد مقایسه قرار گرفتند. پس از مشخص نمودن گونه های باکتری با استفاده از تکنیک eric-pcr تنوع داخل گونه ای باکتری های جداسازی شده مورد بررسی قرار گرفت و با استفاده از نرم افزار ntsys شجره انها رسم شد.