طراحی و راه اندازی روش str typing و بررسی اولیه فرکانس اللی 12 مارکر str

توالی های تکراری متوالی کوتاه(str)، امروزه اهمیت زیادی در تعیین هویت در پزشکی قانونی، تعیین نقشه های ژنومی و آنالیزهای پیوستگی ژنی دارند. به طور تخمینی حدود 400 میلیون مارکر str در ژنوم وجود دارند که اکثر آن ها دارای الل های پلی مورفیک با طول های متفاوتی هستند. تفاوت در طول آلل ها ناشی از تفاوت در تعداد دفعاتی است که توالی منومر اصلی تکرار شده است. از آنجایی که str ها به راحتی توسط تکنیک pcr قابل تکثیر می باشند، روش بررسی str ها به کمک pcr یا str typing ، تکنیک بسیار مفیدی در زمینه تعیین پروفایل dna ژنومی می باشد. این روش بسیار حساس تر از تکنیک های سنتی مانند rflp است. به علت وجود همین مزایا این مارکرها به عنوان مارکر های انتخابی در تعیین هویت در پزشکی قانونی خصوصاً در مورد نمونه های تخریب شده نقش مهمی ایفاء می کنند. در این مطالعه 12 لوکوس str که شامل tho1، tpox، csf1po، d16s539، d7s820، d13s317، d5s818، d8s1179، d18s51، fga، d2s1338 و d3s1358 می باشند مورد بررسی قرار گرفتند. بمنظور صرفه جویی در وقت و هزینه بررسی این لوکوس ها در 4 سیستم pcr-triplex طراحی و راه اندازی شد. تعداد 120 نمونه خون از افراد غیر خویشاوند با هویت نژادی مشخص بصورت تصادفی گرفته شد. dna ژنومی نمونه ها استخراج گردید و توسط triplex-pcr های طراحی شده لوکوس های مورد نظر تکثیر گردید و محصول pcr توسط الکتروفورز با ژل پلی اکریلامید مورد تجزیه قرار گرفت واز نتایج بدست آمده اندازه باندهای حاصل ازtriplex-pcr به وسیله نرم افزار total lab مورد بررسی و ارزیابی قرار گرفت. در نهایت محاسبه فرکانس اللی 12 لوکوس مذکور با آنالیز آماری نتایج، نشان داد که تمام لوکوس ها به جزء tpox دارای پلی مورفیسم بالایی هستند. کلید واژه: پروفایل dna، triplex pcr ، str ، rflp