در این پژوهش ساختار مولکولی و انرژی پیوند هیدروژنی درون مولکولی 26 صورت بندی 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به منظور تعیین مرتبه ی پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون-مولکولی مختلف بهینه شده است. نتایج محاسبات در فاز گاز و آب نشان می دهد که صورت بندی های 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) این ترکیب پایدارتر از بقیه هستند. ای...

ما یافته های خود را در ارتباط با انرژی های نسبی، خواص هندسی و قدرت پیوند هیدروژنی درون-مولکولی بیست صورت بندی مولکول 3-هیدروکسی پروپ-2- اِن سلنال (hps) را توسط روش های شیمی کوانتومی (dft, iefpcm, scipcm) گزارش کردیم. اثرات حلال توسط مدل های پیوستار قطبش پذیر (pcm, iefpcm, scipcm) در سطح b3lyp تخمین زده شده است. پارامترهای هندسی محاسبه شده و تجزیه و تحلیل صورت بندی در فاز گاز بیان کننده ی این است...

هدف این تحقیقْ بررسی اثر جذب ملکول پیرول 2‌ـ‌کربوکسیلیک اسید(PCA) بر سطح نانوخوشۀ بور نیترید (B12N12 ) خالص و نشاندارشده با اتم پالادیم است. همۀ ساختارهای منتخب با استفاده از نظریۀ تابعی چگالی در سطح B3LYP/Lanl2DZ با استفاده از نرم‌افزار گوسین (09) بهینه شدند. با استفاده از ساختارهای بهینه پارامترهای فضایی (طول پیوند و زاویۀ پیوند)، اربیتال‌های هومو و لومو، طیف فروسرخ (IR)، پارامتر پوششی متقارن ...

پیوندهای غیرکوالانسی مدلی از برهم کنش های درون ملکولی و بین ملکولی هستند که به دلیل نیروهای الکتروستاتیک و نیروهای لاندنی میان اتم های مختلف بوجود می آیند. پیوند هالوژنی به برهم کنش میان اتم هالوژن و گونه ی الکترون دهنده نسبت داده می شود. این واقعیت که هم اتم هالوژن و هم گونه ی الکترون دهنده دارای بار منفی هستند، برهم کنش های میان این دو بار منفی را چالش برانگیز کرده است. دو مفهوم "حفره ی سیگما...

در این پژوهش انرژی اتم ­ها در ایزومریزاسیون مولکول1و1 دی آمینو2و2- دی نیترو اتنFOX-7  به ایزومر نیتریت و ایزومر ناشی از انتقال درون ملکولی هیدروژن به روش نظریه تابعی چگالی (DFT) در سطح محاسباتی مکانیک کوانتومی B3 LYP/aug-cc-pVDZ مورد بررسی قرار گرفت. با مطالعه انرژی اتم ­ها به کمک نظریه کوانتومی اتم ...

این تحقیق مشتمل بر دو قسمت است: در قسمت اول سعی می¬شود تابه¬جای چگالی الکترونی که در نظریهaim مرسوم استفاده می¬شود با استفاده از چگالی انرژی جنبشی لاگرانژی، فضای ملکولی به محدوده¬های اتمی مجزایی تقسیم گردد. این روش برای تعدادی از ساختارهای استخلاف¬دار شده¬ی سیستم بنزاین با (استخلاف¬دار شده با گروه های هیدروکسی و نیترو) که در نمودار خطوط هم¬تراز خود جاذب غیرهسته¬ای (nna) نشان می¬دهند به¬کار گرفت...

در این پایان نامه، برهم کنش نانوبلوک های آدامانتان و برخی مشتقات آن با آب توسط روش های ab initio بررسی شده است. یکی از کاربردهای الماس واره ها به ویژه آدامانتان و مشتقات آن به عنوان نانوبلوک های ملکولی در تولید ساختارهای پیچیده با دقت ملکولی با استفاده از روش های خودتجمعی است که یکی از محیط های ممکن برای روش های خودتجمعی، محیط حلال مانند آب می باشد. بنابراین مطالعه برهم کنش آنها با آب، دارای اه...

چکیده مقدمه : آب گریزی ملکول ها عامل محرّک بسیاری از آثار و پدیده ها در سیستم های بیولوژیکی است. تاکنون تعداد زیادی درجه بندی آب گریزی برای اسیدهای آمینه پیشنهاد شده است. از این درجه بندی ها برای پیش بینی توپولژی پروتئین ها استفاده می شود. هدف : در کار حاضر با توجه به بعضی ملاحظات نظری درجه بندی جدیدی برای آب گریزی اسیدهای آمینه ساخته می شود مواد و روش ها: با این فرض که آب گریزی اسیدهای آمینه به...

با بکاربردن روش ساده شده murrell، اوربیتالهای هیبرید s، p و d اتم گوگرد، در ملکول هشت وجهی sf6، که ماگزیمم اورلپ را ایجاد می کنند، بدست آورده شده است . با درنظرگرفتن اینکه اوربیتالهای لیگاند p می باشند، انتگرال اورلپ (overlap integral) از جدولهای داده شده برای توابع slater بدست آمده است . با استفاده از این، بهترین اوربیتالهای هیبرید محاسبه شده، قدرت نسبی پیوندها و سهم هر یک از اوربیتالهای s، p ...