مکان یابی یک ژن ABC-Transporter مرتبط با بیماری اسکالد جو (Rhynchosporium secalis (Oud.) Davis) با استفاده از یک نشانگر CAPS
نویسندگان
چکیده مقاله:
خانواده بزرگ پروتئین های ABC-Transporter به عنوان یک پل ارتباطی در غشاهای سلولی همه موجودات زنده یافت می‌شوند. این پروتئین ها مسئول تبادل مواد گوناگون از جمله متابولیت های دخیل در مکانیسم های دفاعی گیاهان می باشند. در این تحقیق، جهت مکان یابی یک ژن ABC-Transporter اختصاصی در برهمکنش سازگار و ناسازگار با قارچ R. secalis عامل بیماری اسکالد جو از SNP ها و نشانگر CAPS استفاده شد. یک قطعه kb2/2 حاصل از فراورده PCR با آغازگر های اختصاصی برای ژن مذکور در 10 والد جو توالی یابی شد و پس از همردیفی برای کشف SNPها مورد استفاده قرار گرفت. در میان SNPهای مشاهده شده، یک SNP با تفاوت در جایگاه برشی آنزیم NlaIII در والدین Chebec و Harrington مشاهده و برای تبدیل به نشانگر CAPS و مکان‌یابی استفاده شد. نتایج مکان‌یابی موقعیت این ژن را روی بازوی بزرگ کروموزوم شماره 3 جو تعیین کرد. همچنین نتیجه بررسی همولوژی در این ناحیه از کروموزوم نیز همچون مطالعات قبلی نشاندهنده وجود Synteny بالا برای کروموزوم شماره 3 جو با کروموزوم شماره 1 برنج بود.
منابع مشابه
تنوع ژنتیکی جدایه‌های Rhynchosporium secalis عامل بیماری اسکالد جو در استان ایلام
اسکالد یا کچلی جو یکی از بیماری‌های متداول جو در اکثر مناطق دنیا می‌باشد. برای تعیین تنوع ژنتیکی در جدایه‌های Rhynchosporium secalis از گیاهان آلوده جو در مزارع مختلف استان شامل ایلام، آسمان آباد، سرابله، شباب، ایوان و سیروانکه لکه‌های قهوه‌ای مایل به زرد با حاشیه قهوه‌ای در قسمت‌های هوایی برگ و ساقه داشتند، نمونه برداری شد. 47 جدایه با استفاده از محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار برای اهداف این ...
متن کاملتنوع ژنتیکی جدایه های rhynchosporium secalis عامل بیماری اسکالد جو در استان ایلام
اسکالد یا کچلی جو یکی از بیماری های متداول جو در اکثر مناطق دنیا می باشد. برای تعیین تنوع ژنتیکی در جدایه های rhynchosporium secalis از گیاهان آلوده جو در مزارع مختلف استان شامل ایلام، آسمان آباد، سرابله، شباب، ایوان و سیروانکه لکه های قهوه ای مایل به زرد با حاشیه قهوه ای در قسمت های هوایی برگ و ساقه داشتند، نمونه برداری شد. 47 جدایه با استفاده از محیط کشت سیب زمینی دکستروز آگار برای اهداف این ...
متن کاملبیماری اسکالد جو
کریمی ک.، ارزنلو م. و میرابی ف. 1393. بیماری اسکالد جو. دانش بیماری‌شناسی گیاهی 4(1):12-1. جو یکی از غلات پرمصرف در جهان به شمار می‌رود. بیماری سوختگی برگ یا اسکالد ناشی از قارچ Rhynchosporium commune یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های این گیاه به شمار می‌رود که در شرایط مساعد میزان خسارت آن می‌تواند به 40 درصد محصول برسد. آلودگی اولیه از هاگ‌های آزاد شده از بقایای بوته‌های بیمار سال زراعی قبل پدید...
متن کاملردیابی ژن‌های مقاوم به بیماری پژمردگی فوزاریومی در ارقام گوجه‌فرنگی با استفاده از نشانگر CAPS
بیماری‌های فوزاریومی در اغلب مناطق کشت گوجه‌فرنگی باعث کاهش تولید عملکرد این محصول می‌شوند. بهترین روش کنترل این بیماری تهیه و استفاده از ارقام مقاوم به فوزاریوم است. انتخاب فنوتیپی ارقام مقاوم گوجه‌فرنگی کاری پیچیده و بسیار زمان‌بر می‌باشد. نشانگرهای مولکولی که با ژن مقاومت به بیماری پژمردگی فوزاریومی پیوستگی دارند، می‌توانند برای غربال کردن مواد ژنتیکی مقاوم به این بیماری مورد استفاده قر...
متن کاملTranscriptome Analysis of the Barley-Rhynchosporium secalis Interaction
Leaf scald caused by the infection of Rhynchosporium secalis, is a worldwide crop disease resulting in significant loss of barley yield. In this study, a systematic sequencing of expressed sequence tags (ESTs) was chosen to obtain a global picture of the assembly of genes involved in pathogenesis. To identify a large number of plant ESTs, which are induced at different time points, an amplified...
متن کاملمقاومت مزرعه‌ای به بیماری کچلی (اسکالد) جو
مقاومت مزرعه‌ای به بیماری کچلی یا اسکالد (Scald) (Slow-scalding resistance: S-SR) موضوعی جدید در اصلاح ارقام مقاوم به بیماری کچلی جو است که به خاطر ناپایداری ژن‌های بزرگ اثر از توجه روزافزونی برخوردار شده است. به منظور تشخیص ژنوتیپ‌های دارای این نوع مقاومت، در سال‌های 1380-1378 واکنش کمّی پنجاه ژنوتیپ جو با عکس‌العمل‌های متفاوت به این بیماری در قالب یک طرح آلفا لاتیس با سه تکرار در دوایستگاه تحق...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 9 شماره 2
صفحات 157- 168
تاریخ انتشار 2007-07
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023