تنوع ژنتیکی درون‌گونه‌ای Phytophthora cryptogea و P. drechsleri *

نویسنده

  • رضا مستوفی‌زاده قلمفرسا نویسنده
چکیده مقاله:

گونه‌های Phytophthora drechsleri و P. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونه‌ها، جدایه‌هایی از P. drechsleri و P. cryptogea مربوط به میزبان‌های متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایه‌هایی از آرایه خویشاوند آنها، P. erythroseptica، از طریق روش  میکروستلایت‌های فزون‌سازی شده تصادفی (RAMS) مطالعه شدند. این بررسی به کمک سه آغازگرِ متغیر قلاب‌دار، VHV(GT)7G، DDB(CCA)5و DHB(CGA)5انجام گرفت. در بین جدایه‌های مورد بررسی دو الگوی نواربندی متفاوت دیده شد که شامل 26 نشانگر RAMS در بین جدایه‌های P. cryptogea و P. erythroseptica و 18 نشانگر RAMS در بین جدایه‌های P. drechsleri بود. واکاوی UPGMA روی نشانگرهای RAMS نشان داد که P. cryptogea دارای تغییرات مولکولی قابل توجهی بوده که بیانگر تنوع درون‌گونه‌ای آن است. در جمعیت مورد بررسی P. cryptogea مربوط به مناطق مختلف دنیا حداقل سه گروه ژنتیکی مجزا وجود دارد که میانگین تشابه در بین این جمعیت‌ها 54-60 درصد برآورد گردید. نشانگرهای چندشکلی RAMS در جدایه‌های P. erythroseptica تقریباً همانند نشانگرهای مشاهده شده در P. cryptogea بودند و این جدایه‌ها در میان دندروگرام P. cryptogea به صورت رگه‌ای واگرا ظاهر شدند. به نظر می‌رسد که جدایه‌های P. erythroseptica به دو گروه P. cryptogea به مراتب شبیه‌ترند تا گروه سوم به دو گروه مذکور. در این بررسی هیچ‌ شواهدی مبنی بر وجود رگه‌هایی با ساختار زیست‌جغرافیایی دیده نشد. این امر ممکن است به خاطر دامنه میزبانی وسیع گونه و نقل ‌و‌انتقال جهانی رگه‌های آن باشد که به همراه گیاهان زراعی و باغی جا به‌ جا شده‌اند. براساس داده‌های به دست آمده P. drechsleri گونه‌ای همگن‌تر است، اما رگه‌هایی در آن مشاهده می‌شود که منعکس کننده‌ توزیع جغرافیایی آن است. واکاوی RAMSهیچ نوع جهت‌گیری بر اساس اختصاصیت میزبانی را در بین رگه‌های مختلف این دو گونه مشخص نکرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

تنوع ژنتیکی درون گونه ای phytophthora cryptogea و p. drechsleri *

گونه­های phytophthora drechsleri و p. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونه­ها، جدایه­هایی از p. drechsleri و p. cryptogea مربوط به میزبان­های متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایه­هایی از آرایه خویشاوند آنها، p. erythroseptica، از طریق روش  میکروستلایت های فزون­سازی شده تصادفی (rams) مطالعه شدند. این بررسی به کمک...

متن کامل

Phylogenetic history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates from floriculture crops in North Carolina greenhouses.

The evolutionary history of Phytophthora cryptogea and P. drechsleri isolates previously collected from floriculture crops in North Carolina commercial greenhouses was explored with coalescent- and parsimony-based analyses. Initially, 68 isolates representing 13 location-host groups were sequenced at multiple loci. Sequences of all isolates within a group were identical. A subset of isolates we...

متن کامل

شناسایی و ردیابی اختصاصی ‌Phytopthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica با واکنش زنجیره‌ای پلیمراز

گونه‌های Phytophthora drechsleri، P. cryptogea و P. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت‌شناختی به یک‌دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه‌ها از یک‌دیگر و از سایر گونه‌هایی که صفات ریخت‌شناختی همگرا دارند، شیوه‌ای بر اساس واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه‌ای از جدایه‌ها مربوط به میزبان‌های مختلف، که نماینده...

متن کامل

شناسایی و ردیابی اختصاصی phytopthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica با واکنش زنجیره ای پلیمراز

گونه های phytophthora drechsleri، p. cryptogea و p. erythroseptica بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی خویشاوندند و از نظر ریخت شناختی به یک دیگر شباهت دارند. برای تمایز این آرایه ها از یک دیگر و از سایر گونه هایی که صفات ریخت شناختی همگرا دارند، شیوه ای بر اساس واکنش زنجیره ای پلیمراز ساده و تودرتو ابداع شد. بدین منظور مجموعه ای از جدایه ها مربوط به میزبان های مختلف، که نماینده ی تنوع موجود در ژن های هست...

متن کامل

واکنش ارقام مختلف کدوییان به Phytophthora melonis و P. drechsleri در شرایط گل‌خانه

Phytophthora drechsleri  که قبلاً در بسیاری از کشورها از جمله ایران به عنوان عامل بوته‌میری کدوییان گزارش شده بود، از لحاظ ریخت‌شناسی و نیاز دمایی با P. melonis ، عامل دیگر بوته‌میری کدوییان، تفاوتی ندارد. هدف اصلی این پژوهش بررسی بیماری‌زایی دو گونه‌ی P. drechsleri و P. melonis نسبت به ارقام مختلف جالیز در شرایط گل‌خانه بود. 87 رقم مختلف کدوییان شامل: خیار، ط...

متن کامل

موقعیت فیلوژنتیکی phytophthora erythroseptica و ارتباط آن با دودمان های p. cryptogea

در این مطالعه، روابط فیلوژنتیکی این گونه ها با استفاده از توالی سنجی نواحی هسته ای (فاصله ی ترانویسی شده ی داخلی، بتاتوبولین، پروتئین شوک حرارتی 90 و الیسیتین) و میتوکندریایی (زیرواحد یک سیتوکروم سی اکسیداز و زیرواحد یک اِن اِی-دی اِچ دهیدروژناز) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این پژوهش نشان داد که در تمامی درخت های فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس توالی نواحی هسته ای و میتوکندریایی و درخت های برآیند نواحی...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 50  شماره 1

صفحات  17- 17

تاریخ انتشار 2014-12-01

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023