بررسی مولکولی و فیلوژنتیکی جدایه‌های جنس Rhizopus بر اساس منطقه ITS و مناطق D1-D2 از DNA ریبوزومی *

سی و هفت جدایه از جنس Rhizopus به دست آمده از میزبان‌های مختلف در استان‌های تهران، آذربایجان غربی، یزد و کردستان جهت مطالعات تاکسونومیکی مورد بررسی قرار گرفتند. منطقه ITS شامل ژن 5.8S و مناطق D1-D2 مربوط به DNA ریبوزومی با استفاده از جفت آغازگرهای ITS1/NL4 تکثیر شدند. محصولات تکثیر شده توسط PCR با استفاده از آنزیم‌های برشی HaeIII، RsaI، HinfI و MspI مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند و هفت جدایه نماینده، انتخاب شده و توالی‌یابی شدند. توالی‌های بهدستآمدهبا23توالیاز بانک ژن مقایسهشدند. براساس آنالیزفیلوژنتیکومحاسبهفاصله ژنتیکی جدایه‌های Rhizopus در سه گروه قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده، سه گونه شناسایی شد:  R. lyococcus، R. stolonifer var. stoloniferو R. oryzae. گونه R. lyococcusبرای نخستین بار از ایران گزارش می‌شود. هر سه گونه شناسایی شده برای اولین بار از میزبان‌های هلو، شلیل، زردآلو، توت‌فرنگی، طالبی، خرمالو، آفتاب‌گردان و گوجه‌فرنگی از ایرانجداسازی شده‌اند و گونه R. stolonifer var. stolonifer برای اولین بار از روی شلیل از دنیا گزارش می‌شود. در این تحقیق نشان داده شد که مناطق D2-D1 از بخش LSU در DNA ریبوزومی نسبت به منطقه ITS در فیلوژنی این جنس مناسب‌تر است.