بررسی تفاوت بیان ژن RASGRP3 در پاسخ پرنده به آنفلوانزا نسبت به پرنده‌ی سالم با استفاده از آنالیز داده‌های بیان ژن و PCR کمی

    ژن RASGRP3 یکی از ژن­هایی است که اثرگذاری آن بر پیامد آلودگی آنفلوانزا در میزبان بسیار محتمل است.  این ژن پاسخ التهابی را کاهش داده و در واقع آستانه­ای برای ممانعت از پاسخ التهابی شدید که منجر به آسیب بافت­های میزبان می­شود، تنظیم می­نماید.  به منظور بررسی دخالت این ژن در پاسخ میزبان به آنفلوانزا از آنالیز داده­های ترنسکریپتوم موجود در پایگاه­های داده­ای و سپس PCR کمی استفاده نمودیم.  در این راستا از سه مطالعه­ی مرتبط با بیان ژن­های میزبان در پاسخ به آنفلوانزا استفاده شد تا تغییرات بیان ژن مورد نظر در حالت آلودگی نسبت به حالت سلامت، مورد بررسی قرار گیرد.  سپس بر روی نمونه­های آلوده شده با سویه­ی H5N1، PCR کمی انجام گردید.  آنالیز داده­های ترنسکریپتوم در نرم­افزار R و با استفاده از پکیج MetaDE و روش آماری Fisher، تفاوت بیان ژن RASGRP3 را با احتمال بسیار بالا تأیید نمود.  نتایج Real-time PCR نشان داد که این ژن در پاسخ به سویه­ی H5N1 به طور معنی­داری کاهش بیان یافت.  این نتایج نشان می­دهد ژن RASGRP3 از ژن­های کاندید قوی در مکانیزم تنظیمی پاسخ میزبان به آنفلوانزاست که می­تواند با دخالت در مکانیزم دفاعی میزبان منجر به تنظیم شدت پاسخ به آلودگی شده و بر پیامد آلودگی و بقای پرنده پس از جدال با ویروس اثر بگذارد.