بررسی تبارزایی دو جدایه‌ی ایرانی ویروس موزاییک رگه‌ای گندم (Wheat streak mosaic virus) بر اساس ناحیه‌ی کد کننده‌ی پروتئیناز NIa-Pro
نویسندگان
چکیده مقاله:
چکیده ویروس موزاییک رگه‌ای گندم (WSMV) Wheat streak mosaic virus از ویروس‌های خسارت زای غلات مربوط به خانواده Potyviridae و جنس Tritimovirus است. در این تحقیق، NIa-Pro که یکی از مهم‌ترین پروتئینازهای این ویروس میباشد، مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور 116 نمونه‌ی علائم‌دار گندم از مزارع خراسان شمالی، خراسان جنوبی و آذربایجان غربی جمعآوری و به منظورشناسایی اولیه، کلیه‌ی نمونهها با آزمون الایزا آزمایش گردیدند و تعداد 10 نمونه در مقابل آنتی بادی اختصاصی WSMV واکنش مثبت نشان دادند. این 10 نمونه مثبت در گلخانه روی گیاه گندم تکثیر و با آغازگر اختصاصی مربوط به توالی کامل NIa-Pro در آزمون RT-PCR سنجش شده و قطعه‌ای به طول 732 جفت باز تکثیر گردید. سپس دو جدایه متفاوت از نظر جغرافیایی مربوط به آذربایجان غربی و خراسان شمالی، همسانه سازی و تعیین ترادف شد. در مقایسه‌ی ترادف‌های به دست آمده در این تحقیق با ترادف های موجود در ژن بانک، دو گروه تشکیل شد. جدایه‌های ایرانی مربوط به این مطالعه در گروه یک، زیر گروه IB و مجزا از جدایه‌های اروپایی و جدایه ایرانی که در تحقیقات پیشین تعیین توالی شده بود و نزدیک به جدایه آمریکایی (NC-001886)، بودند قرار گرفتند. بررسی مکان‌های برشی در ژن NIa-Pro نشان داد که مناطق برش، در این پروتئین حفاظت شده است، جایگزینی تعدادی اسید آمینه در مکان‌های حفاظت شده نظیر توالیGKSH در محل 124-121، A/T در جایگاه 154و گلوتامین با آلانین در جایگاه 208 در جدایه‌های ایرانی مشهود بود. تحقیق حاضر اولین بررسی جدایه‌های ایرانی در ناحیه‌ی کد کننده مذکور میباشد.
منابع مشابه
ردیابی و بررسی تبارزایی ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus) در گیاه زعفران (Crocus sativus L.) در ایران
چکیده ویروس موزائیک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یکی از اعضای جنس پوتی‌ویروس میباشد که وسیعترین دامنهی میزبانی را در بین پوتی‌ویروسها دارد. به منظور ردیابی و شناسایی این ویروس، در ماههای آبان و آذر سال 1395 از مزارع زعفران دارای علائم استان خراسان جنوبی و شهرستان های قاین، خوسف و بیرجند تعداد 175 نمونه برداشت گردید. ردیابی اولیهی ویروس با آزمون الایزا صورت گرفت که طی آن آلودگی نمونه‌ه...
متن کاملحذف ویروس موزاییک خیار (cucumber mosaic virus, cmv) از گلایل
ویروس موزاییک خیار از رایجترین ویروس‌های گلایل در سراسر جهان است. تکثیر گلایل از طریق اندام رویشی پداژه است بنابراین بیماریهای ویروسی در آن از نسلی به نسل بعد منتقل و سبب افزایش بیماری و کاهش کیفیت آن میشود. بنابراین تولید پداژههای سالم از اهمیت زیادی برخوردار است. در این تحقیق درصد آلودگی پداژههای گلایل موجود در بازار به ویروس موزاییک خیار در دو استان تهران و البرز تعیین شد و روش گرمادرما...
Development of a multiplexed PCR detection method for Barley and Cereal yellow dwarf viruses, Wheat spindle streak virus, Wheat streak mosaic virus and Soil-borne wheat mosaic virus.
Barley and Cereal yellow dwarf viruses (B/CYDVs), Wheat spindle streak mosaic (WSSMV), Soil-borne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat streak mosaic virus (WSMV) constitute the most economically important group of wheat viruses. In this paper, a multiplex reverse transcription polymerase chain reaction (M-RT-PCR) method was developed for the simultaneous detection and discrimination of eight vi...
متن کاملImpact of Wheat streak mosaic virus and Triticum mosaic virus Coinfection ofWheat on Transmission Rates by Wheat Curl Mites
Oliveira-Hofman, C., Wegulo, S. N., Tatineni, S., and Hein, G. L. 2015. Impact ofWheat streak mosaic virus and Triticum mosaic virus coinfection of wheat on transmission rates by wheat curl mites. Plant Dis. 99:1170-1174. Wheat streak mosaic virus (WSMV) and Triticum mosaic virus (TriMV) are transmitted by the wheat curl mite (WCM, Aceria tosichella), and coinfections of wheat by these viruses ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 6 شماره 3
صفحات 151- 161
تاریخ انتشار 2017-11-22
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023