شبیه سازی دینامیک مولکولی پیوند هیدروژنی در آب محدودشده در فضای نانومتری

ما با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی به بررسی میکروسکوپی ساختار و دینامیک پیوند هیدروژنی در آب محدود شده بین صفحات آبگریز گرافینی پرداختیم. شبیه سازی مورد نظر را در مجموعه napt انجام دادیم. شبیه سازیها را با مدل spc/e برای آب، بین سطوح نانومتری گرافین در حالت تعادل با آب توده انجام دادیم. در این کار اتمهای سطح بصورت ثابت میباشد و شرایط مرزی متناوب در راستای x و y اعمال شده است. مولفه موازی فشار در kpa 101/3 ثابت شده است. ما هر دو خواص استاتیکی و دینامیکی آب را در بین دو صفحه تحلیل نمودیم. بدین صورت که با استفاده از بررسی تعداد پیوندهای هیدروژنی )در باریکههای موازی( در حال تعادل در این سیستم و مقایسه آن با آب توده به بالا بودن چگالی پیوند در اطراف دیوارهها پی میبریم. در مورد خواص دینامیک از از توابع همبستگی زمانی استفاده نمودیم. این توابع بسیار وابسته نفوذ مولکولی میباشند. با استفاده از این توابع مشاهده خواهیم کرد که نزول اولیه سریع این توابع به دلیل شکسته شدن پیوند هیدروژنی میباشد و نزول ثانویه این توابع به صورت نمایی به علت پدیده نفوذ میباشد.