شناسایی، توالی یابی و بررسی ویژگی های ایمونولوژیک یک پروتئین سطحی اختصاصی acinetobacter baumannii با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شاهد - دانشکده علوم
- author کبری احمدی زانوس
- adviser ایرج رسولی
- publication year 1391
abstract
acinetobacter baumannii یک باکتری گرم منفی، غیر متحرک و هوازی اجباری است که به عنوان پاتوژن بیمارستانی شناخته شده و غالباً مقاوم به انواع آنتی بیوتیک هاست. این باکتری همچنین به عنوان یک عامل مهم شیوع و مرگ ومیر در بیمارستان ها مخصوصاً در میان بیماران دارای نقص ایمنی شناسایی شده است. کنترل و درمان عفونت ناشی از آن به دلیل توانایی پاتوژن برای مقاومت به انواع آنتی بیوتیک ها و زنده ماندن در شرایط محیطی مختلف و استفاده از طیف وسیعی از منابع غذایی، سخت است. تشخیص اولیه عفونت ایجاد شده بوسیله a. baumannii استراتژی مهمی برای کنترل کردن عفونت بیمارستانی ناشی از این پاتوژن است. روش های رایج شناسایی این باکتری بوسیله روش های کشت معمول و تست های بیوشیمیایی است که بدست آوردن نتایج آن ها بین ? تا ? روز طول می کشد. بنابراین یک تست جدید، سریع، حساس، اختصاصی و اقتصادی که مدیریت سریع عفونت های a. baumannii را فراهم می کند، مورد نیاز است. ایجاد یک تست تشخیصی اختصاصی و حساس به یک بیومارکری نیاز دارد که واکنش تقاطعی با باکتری های دیگر نداشته و تنها برای a. baumannii اختصاصی باشد. براین اساس، هدف از این مطالعه شناسایی و توالی یابی یک پروتئین غشای خارجی kda 34.4 معرفی شده توسط islam et al. از بین پروتئین های غشای خارجی (omps) a. baumannii atcc 19606 است. در مطالعه حاضر ما از نرم افزارهای مختلف بیوانفورماتیکی برای غربالگری کل پروتئوم باکتری استفاده کردیم. غربالگری پروتئین ها با توجه به ویژگی هایی از جمله: وزن مولکولی، موقعیت یابی، توپولوژی، همولوژی، آنتی ژنیسیته و آلرژی زایی صورت گرفته است. در نهایت 201 پروتئین در وزن مولکولی بین kda 33-36 پیدا شد که در این میان 11 پروتئین به عنوان پروتئین غشای خارجی شناسایی شدند و در نهایت ? مورد از پروتئین ها از نظر مکانی کاندیدای مناسبی برای انتخاب بودند. براساس آنالیزهای انجام شده با blast و پیش بینی های آنتی ژنیسیته و دیگر بررسی های صورت گرفته تنها یکی از ? پروتئین به عنوان پروتئین آنتی ژن و اختصاصی a. baumannii شناخته شد.
similar resources
مطالعه بیوانفورماتیکی ویژگی های ایمونوژنیک پروتئین های با بیان متأثر از آهن در باکتری acinetobacter baumannii
baumannii acinetobacter یک پاتوژن بیمارستانی با قدرت بیماری زایی در حال رشد است. این باکتری عفونت-های مقاوم به چندین آنتی بیوتیک ایجاد می کند و به درمان های دارویی و مواد ضد میکروبی به شدت مقاوم است. به همین علت نیاز روز افزونی به توسعه روش های جدید درمان بر علیه این پاتوژن نیاز است. سیستم های اکتساب آهن فاکتور های مهم ویرولانس این باکتری پاتوژن هستند. آنتی بادی بر علیه پروتئین های غشایی تحت تن...
استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی برای مطالعه پروتئین مایوستاتین
ژن مایوستاتین متعلق به خانواده فاکتورهای تمایز رشد (tgf-β) میباشد که در رشد و نمو و بلوغ و بهطور اختصاصی در توسعه ماهیچه اسکلتی بالغ بیان میشود. در این پژوهش با بهره گیری از نرمافزارهای بیوانفورماتیکی، توالی اسیدآمینهای پروتئین مایوستاتین در گونههای مختلف ازجمله گاو، گوسفند، بز، اسب، خوک، مرغ، بوقلمون، اردک، غاز، کبوتر، موش و انسان بررسی شد. در همردیفی بخش پایانی پروتئین مایوستاتین (فر...
full textAcinetobacter baumannii
Acinetobacter baumannii is an opportunistic bacterial pathogen primarily associated with hospital-acquired infections. The recent increase in incidence, largely associated with infected combat troops returning from conflict zones, coupled with a dramatic increase in the incidence of multidrug-resistant (MDR) strains, has significantly raised the profile of this emerging opportunistic pathogen. ...
full textشناسایی پروتئین fha-like در acinetobacter baumannii، نقش آن در بیماریزایی و ایمنی زایی
مقدمه: پروتئین های وابسته به خانواده سیستم ترشحی دوجزئی می توانند درچسبندگی باکتری نقش داشته باشند. چسبندگی برروی سطوح، به عنوان یک عامل بیماریزایی، اولین گام در انجام فرایند تجمع باکتریایی می باشد. اسینتوباکتربومانی دارای توانایی ویژه ای برای کلونیزاسیون برروی سطوح مختلف است. هدف از انجام این تحقیق، شناسایی، مطالعه و بررسی نقش پروتئین های این خانواده در چسبندگی اسینتوباکتربومانی به سلول اپی تل...
تشخیص عفونت باکتریایی acinetobacter baumannii با استفاده از آنتی بادی سرمی ایجاد شده برعلیه پروتئین نوترکیب از توالی های تکراری bap g1e2f2g2g3
a.baumannii در سالهای اخیر به عنوان عامل اصلی عفونتهای بیمارستانی شناخته شده اند که همراه با مرگ و ناخوشی های قابل توجه است. بیشترین نگرانی در مورد این میکروارگانیسم توانایی کسب مکانیسم های مقاومت به انواع آنتی بیوتیکهای در دسترس می باشد. گروهی از پروتئینهای سطحی هستند که نقشی برجسته در توسعه اجتماع میکروبی بازی می کنند. یکی از این پروتئینها که برای اولین بار در staphylococcus aureus شرح داده ش...
15 صفحه اولCarbapenem-resistant Acinetobacter baumannii
To the editor: We read with interest the paper of Hrabák et al. [1] on the isolation of a blaNDM-1-carrying Acinetobacter baumannii strain. However, although the authors believed to be the first in the Czech Republic to report on a New Delhi metallo-beta-lactamase-1 (NDM-1)-producing bacterium, there have been other reports on the same A. baumannii strain in the country [2,3]. Here, we would li...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شاهد - دانشکده علوم
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023