PCR-DGGE : روشی نوین در دنیای میکروبیولوژی

author

  • آروین توکلی گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه الزهرا، تهران، ایران
Abstract:

PCR-DGGE یکی از روشهای مولکولی نوین میباشد که در ابتدا برای کشف پلی مورفیسم DNA ابداع شد. این تکنیک قطعات هم اندازهDNA را بر اساس اختلاف توالی جدا میکند. در حال حاضر این تکنیک در حوزه های مختلف علم میکروبیولوژی مانند میکروبیولوژی پزشکی، میکروبیولوژی غذایی و میکروبیولوژی صنعتی به کار میرود. در این روش پس از استخراج DNA از نمونه مورد نظر، DNA به کمک پرایمرهای یونیورسال از طریقPCR تکثیر میشود. سپس محصولPCR که حاوی قطعات هم اندازه ی DNA میباشد، بر روی ژل DGGE که حاوی شیبی از مواد دناتوره کننده (اوره و فرم آمید) است، قرار میگیرد و الکتروفورز انجام میشود DGGE . DNA ی باکتریهای مختلف را تفکیک میکند که میتوانند برای آنالیز های بعدی مورد استفاده قرار گیرند. علی رغم وجود برخی محدودیت ها مانند محدودیت در سایز توالی مورد استفاده، PCR-DGGE میتواند به عنوان یک تکنیک سریع و کارآمد برای اهداف بسیاری در میکروبیولوژی مورد استفاده قرار گیرد. در این مطالعه ضمن معرفی اجمالی این تکنیک، مزایا و محدودیت های آنرا در تحقیقات میکروبیولوژی مورد بررسی قرار میدهیم.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

Lactobacillus delbrueckii, Lactobacillus helveticus, PCR-DGGE, pyrosequencing

Diversity of thermophilic bacteria in milk assessed by culturing, PCR-DGGE, and 1 pyrosequencing 2 3 Elena Fernández 1 , Caio T. C. C. Rachid 2 , Tomasz Rychlik 1 , Ángel Alegría 1 , Raquel S. 4 Peixoto 2 , Susana Delgado 1 , and Baltasar Mayo 1 * 5 6 Departamento de Microbiología y Bioquímica, Instituto de Productos Lácteos de 7 Asturias (IPLA-CSIC), Paseo Río Linares s/n, 33300-Villaviciosa, ...

full text

PCR-DGGE Analysis of Caecal Microflora of Natustat -Supplemented Turkeys

Histomoniasis is a disease of turkeys on litter or range caused by the fragile protozoan Histomonas meleagridis, a parasite of worms, primarily spread in faeces, in Heterakis gallinarum (caecal worm) eggs or in Eisenia foetita (earthworms). Symptoms include poor feed conversion ratio (FCR), decreased body weight (BW), diarrhea, caecal and liver lesions, darkening of the facial regions and somet...

full text

بررسی تکنیک PCR-DGGE برای شناسایی گونه‌های مختلف کاندیدا

کاندیدا از جمله شایعترین مخمرهای عفونت زای انسانی می‌باشد و در سال‌های اخیر نرخ عفونت‌های ایجاد شده توسط این مخمر افزایش یافته است. شناسایی زود هنگام کاندیدا‌های بیماری زا نقش مهمی را برای انجام اقدامات درمانی و کنترل عفونت‌های بیمارستانی ایفا می‌نماید. روش‌های سنتی شناسایی کاندیدا نسبت به روش‌های مولکولی از حساسیت کمتری برخوردار بوده و به زمان بیشتری نیاز دارند. با توجه به وجود برخی محدودیت‌ها...

full text

«ادبیات مهاجرت» ایتالیا، بازتاب دنیای نوین زنان

«ادبیات مهاجرت» ایتالیا در واپسین دهة سدة گذشته از سوی طیفگوناگونی از نویسندگان مهاجر به این کشور که سودای برقراری ارتباط با جامعة میزبانو اثبات وجود خویش را در بطن آن در سر می‌پروراندند، پایه‌گذاری شد. این ادبیات باروایت از دنیاهای دور، ناهمسانی‌ها و ناسازگاری‌های ناشی از هجرت و دوپارگی وجودی کهمهاجران با آن دست به گریبانند، قوام یافته؛ و تا اکنون به معرفی هویت‌های بازیافتهو بازساختة این کوچ‌ن...

full text

مقایسه روش‌های مولکولی RAPD-PCR و DGGE-PCR در شناسایی لاکتوباسیلوس‌های جداسازی شده در طی رسیدن پنیر لیقوان

در این تحقیق با استفاده از دو روش مولکولی مستقل از کشت دی کد-پی سی آر (DGGE-PCR) و وابسته به کشت رپید-پی سی آر (RAPD-PCR)، تغییرات جمعیتی لاکتوباسیلوس‌های پنیر سنتی لیقوان بررسی شد. هر دو این تکنیک‌ها، توانایی بالایی در شناسایی و ردیابی این گروه از باکتری‌های اسیدلاکتیک نشان دادند. با این حال، تفاوت هایی نیز در نحوه شناسایی لاکتوباسیلوس‌های جداسازی شده در مراحل مختلف رسیدن دیده شد. در روش وابس...

full text

روشی نوین در بهینه‌سازی پنجره‌های تک‌جداره

از کل انرژی مصرفی کشور، حدود40% آن صرف سرمایش و گرمایش ساختمان‌ها می‌شود که یک سوم اتلاف حرارتی از طریق پنجره‌ها صورت می‌پذیرد. از آنجایی‌که بسیاری از ساختمان‌های موجود مطابق با استانداردهای مصرف انرژی ساخته نشده و به ناچار برای ایجاد شرایط آسایش حرارتی مجبور به مصرف انرژی بیش از حد هستند، بنابراین موجب به هدر دادن ذخایر انرژی شده و با واقعی شدن تعرفة حامل‌های انرژی، بالا رفتن هزینه‌ها را نیز س...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 7  issue 27

pages  9- 15

publication date 2017-09-23

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023