Identification of diagnostic biomarkers by bioinformatics analysis in the inflamed and non-inflamed intestinal mucosa in Crohn\'s disease patients

Authors

  • Azar Sheikholeslami Department of Mesenchymal Stem Cells, the Academic Center for Education, Culture and Research, Qom, Iran
  • Hoda Fazaeli Department of Mesenchymal Stem Cells, the Academic Center for Education, Culture and Research, Qom, Iran
  • Mohsen Sheykhhasan Department of Mesenchymal Stem Cells, the Academic Center for Education, Culture and Research, Qom, Iran
  • Naser Kalhor Department of Mesenchymal Stem Cells, the Academic Center for Education, Culture and Research, Qom, Iran
Abstract:

Background: Crohn's disease (CD) is a type of inflammatory bowel disease (IBD) which despite the unknown details is generally related to genetic, immune system, and environmental factors. In this study, we identify transcriptional signatures in patients with CD and then explain the potential molecular mechanisms in inflamed and non-inflamed intestinal mucosa in these patients. Materials and Methods: We obtain GSE83448 gene expression profiles from the Omnibus gene expression database. Also, for the gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis of differentially expressed gene (DEG) pathways, we used DAVID software. DEGs were detected in the inflamed and non-inflamed intestinal mucosa of CD patients using the GEO2R instrument, in comparison to the control group. Significant modules and hub genes were identified after producing protein-protein interaction networks (PPIs) of DEGs by Cytoscape software. Results: The 10 specific hub genes of CD, including Matrix Metallopeptidase 2 (MMP2), Cadherin 1 (CDH1), Periostin (POSTN), Collagen Type I Alpha 2 Chain (COL1A2), C-X-C Motif Chemokine Ligand 8 (CXCL8), Collagen Type III Alpha 1 Chain (COL3A1), JUN, Serine protease inhibitor clade E member 1 (SERPINE1), Integrin alpha M (ITGAM), and Connective tissue growth factor (CTGF), were used as biomarkers to discriminate between inflamed and non-inflamed intestinal mucosa groups in patients. Conclusion: These results may provide potential molecular targets and diagnostic biomarkers for the inflamed and non-inflamed intestinal mucosa in CD.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

the stady and analysis of rice agroclimatology in lenjan

the west of esfahan province, iran, is one of the most important agricultural areas throughout the country due to the climate variability and life-giving water of zayanderood river. rice is one of the major and economic crops in this area. the most important climatic elements in agricultural activities which should be considered include temperature, relative humidity, precipitation and wind. so...

15 صفحه اول

the analysis of the role of the speech acts theory in translating and dubbing hollywood films

از محوری ترین اثراتی که یک فیلم سینمایی ایجاد می کند دیالوگ هایی است که هنرپیش گان فیلم میگویند. به زعم یک فیلم ساز, یک شیوه متأثر نمودن مخاطب از اثر منظوره نیروی گفتارهای گوینده, مثل نیروی عاطفی, ترس آور, غم انگیز, هیجان انگیز و غیره, است. این مطالعه به بررسی این مسأله مبادرت کرده است که آیا نیروی فراگفتاری هنرپیش گان به مثابه ی اعمال گفتاری در پنج فیلم هالیوودی در نسخه های دوبله شده باز تولید...

15 صفحه اول

the role of type-d personality, social support and self-compassion in prediction of health behaviors in coronary heart disease patients

نظر به اهمیت و تاثیر روزافزون عوامل روانی – اجتماعی در سلامت جسمی و تاثیر عوامل روان شناختی در بروز بیماریهای مختلف از جمله بیماریهای قلبی و عروقی این پژوهش با هدف کلی بررسی ارتباط تیپ شخصیتی d ، حمایت اجتماعی و خود دلسوزی در پیش بینی رفتارهای بهداشتی بیماران کرونر قلبی و تعیین تفاوت بین بیماران کرونر قلبی با و بدون جراحی و افراد سالم در این متغیرها و رفتارهای بهداشتی آنان، انجام گرفت. جامعه آ...

15 صفحه اول

analysis of power in the network society

اندیشمندان و صاحب نظران علوم اجتماعی بر این باورند که مرحله تازه ای در تاریخ جوامع بشری اغاز شده است. ویژگیهای این جامعه نو را می توان پدیده هایی از جمله اقتصاد اطلاعاتی جهانی ، هندسه متغیر شبکه ای، فرهنگ مجاز واقعی ، توسعه حیرت انگیز فناوری های دیجیتال، خدمات پیوسته و نیز فشردگی زمان و مکان برشمرد. از سوی دیگر قدرت به عنوان موضوع اصلی علم سیاست جایگاه مهمی در روابط انسانی دارد، قدرت و بازتولید...

15 صفحه اول

a study of the fifth child and ben in the world by doris lessing in the light of julia kristevas psychoanalytic concepts

این مطالعه به بررسی عوامل روانشناختی کریستوادردو رمان دوربس لسینگ،فرزندبنجم و بن دردنیای واقعی می بردازد.موفقیت یا شکست کاراکترهادر تکمیل شکست تتیزی یه کمک بدر وهم از مهم ترین دغدغه محقق می باشد.به بررسی تحلیل روانشناختی تمامی کاراکترها خصوصا بن برداخته و به دنبال نشانه هایی از جامعه شیشه ای کریستوا می باشد.

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 9  issue 3

pages  0- 0

publication date 2021-08

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023