Cloning and determination of biochemical properties of protective and broadly conserved vaccine antigens from the genome of extraintestinal pathogenic Escherichia coli into pET28a vector

Authors

  • Jamil Kheirvari Khezerloo Department of Biochemistry, Faculty of Advanced Sciences & Technology, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran-Iran (IAUPS)
  • Mana Oloomi Department of Molecular Biology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
  • Mehri Habibi Department of Molecular Biology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran
  • Zohreh Haghri Department of Biotechnology, Faculty of Sciences and technologies, Islamic Azad University, Pharmaceutical Sciences, Tehran, Iran
Abstract:

Urinary tract infections are one of the most common infectious diseases that lead to significant health problems in the world. Urinary tract infections are referred to any infection in any part of the renal system. Uropathogenic Escherichia coli, Proteus mirabilis, and Klebsiella are main organisms that are involved in these infections. After identifying same protective and conserved virulence sequences in these microorganisms with similarity upper than 80%, sequences of synthetic gene was provided by bioinformatics techniques and ordered from Thermo Fisher Scientific Company. PCR amplification of this gene was performed by specific primers designed for this purpose. Construction of gene was performed by overlap PCR. The synthetic gene was cloned into pET28a vector. Our gene was amplified in E. coli Top10 tested. To confirm cloning, three methods including colony PCR, digestion and sequencing were used. First, two techniques were performed using horizontal electrophoresis, and also the synthetic gene showed significant homology with the sequence (99% Identified) in sequencing. Sequencing of this gene showed that fusion was constructed correctly. Determination of biochemical properties such as 3D structure, Ramachandran and comparison of Non-redundant Set of PDB structure was done by bioinformatic software and had exact and expectable results.A large part of the health system in the world is occupied by a urinary tract infection and governments spend a huge amount of money for the treatment and recovery of patients with these infections. On the other hands, antibiotic resistance in the not-far future will be a disaster for medical societies. This is the most important reason for the emergence of vaccine production against urinary tract infections.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

Identification of protective and broadly conserved vaccine antigens from the genome of extraintestinal pathogenic Escherichia coli.

Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) are a common cause of disease in both mammals and birds. A vaccine to prevent such infections would be desirable given the increasing antibiotic resistance of these bacteria. We have determined the genome sequence of ExPEC IHE3034 (ST95) isolated from a case of neonatal meningitis and compared this to available genome sequences of other ExPEC ...

full text

determination of some physical and mechanical properties red bean

چکیده: در این تحقیق، برخی خواص فیزیکی و مکانیکی لوبیا قرمز به-صورت تابعی از محتوی رطوبت بررسی شد. نتایج نشان داد که رطوبت بر خواص فیزیکی لوبیا قرمز شامل طول، عرض، ضخامت، قطر متوسط هندسی، قطر متوسط حسابی، سطح تصویر شده، حجم، چگالی توده، تخلخل، وزن هزار دانه و زاویه ی استقرار استاتیکی در سطح احتمال 1 درصد اثر معنی داری دارد. به طوری که با افزایش رطوبت از 54/7 به 12 درصد بر پایه خشک طول، عرض، ضخام...

15 صفحه اول

extraction and acetylation of purified trypsin from bovin pancreas and study of some its physico-chemical properties

آنزیم تریپسین در شرایط قلیایی ناپایدار می باشد .و فعالیت پروتئولیتیکی تریپسین منجربه خود هضمی آن در جایگاههای خاصی می گردد. بنابر این آنزیمی با ناپایداری بالا محسوب میگردد. در سالهای اخیر موفق شدند که با ایجاد تغیرات شیمیایی با اضافه کردن فلزات خاص ، کلسیم و یا عمل استیلاسیون منجر به افزایش پایداری آنزیم تریپسین گردند. مطالعات در حال حاضر نشان می دهد که تریپسین استیله شده فعالیت آنزیمی خود را ...

15 صفحه اول

the innovation of a statistical model to estimate dependable rainfall (dr) and develop it for determination and classification of drought and wet years of iran

آب حاصل از بارش منبع تأمین نیازهای بی شمار جانداران به ویژه انسان است و هرگونه کاهش در کم و کیف آن مستقیماً حیات موجودات زنده را تحت تأثیر منفی قرار می دهد. نوسان سال به سال بارش از ویژگی های اساسی و بسیار مهم بارش های سالانه ایران محسوب می شود که آثار زیان بار آن در تمام عرصه های اقتصادی، اجتماعی و حتی سیاسی- امنیتی به نحوی منعکس می شود. چون میزان آب ناشی از بارش یکی از مولفه های اصلی برنامه ...

15 صفحه اول

the role of russia in transmission of energy from central asia and caucuses to european union

پس ازفروپاشی شوروی،رشد منابع نفت و گاز، آسیای میانه و قفقاز را در یک بازی ژئوپلتیکی انرژی قرار داده است. با در نظر گرفتن این منابع هیدروکربنی، این منطقه به یک میدانجنگ و رقابت تجاری برای بازی های ژئوپلتیکی قدرت های بزرگ جهانی تبدیل شده است. روسیه منطقه را به عنوان حیات خلوت خود تلقی نموده و علاقمند به حفظ حضورش می باشد تا همانند گذشته گاز طبیعی را به وسیله خط لوله مرکزی دریافت و به عنوان یک واس...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 5  issue 3

pages  251- 256

publication date 2017-10-01

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023