مدل سازی و تعیین ساختار و ویژگی‌های آنزیم‌های سیتوکروم P450 در قارچ بیمارگر حشرات بووریا بازیانا
Authors
Abstract:
سابقه و هدف: آنزیم‌های سیتوکروم پ 450 خانوادة بزرگی از پروتئین‌های دارای آهن هستند و نقش مهمی در متابولیسم ترکیبات مختلف بازی می‌کنند. قارچ بیمارگر حشرات، بووریا بازیانا نیز حاوی این آنزیم‌ها برای هدف‌گیری آلکان‌ها در حشرات است... مواد و روش‌ها: بررسی ویژگی‌ها و پیش‌بینی ساختار سه بعدی هفت آنزیم موجود در بانک ژن مبتنی بر همولوژی با نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی انجام‌شد. یافته‌ها: در تمامی توالی‌ها یک ناحیة حفاظت‌شده با حدود 200 اسیدآمینه مرتبط با پ 450 شناسایی شد. این ناحیة حفاظت‌شده در توالی 45-96 تا حدود 477-520 قرار داشت. پروتئین‌های CYP539B5 و CYP52G11 (با شاخص ناپایداری کمتر از 40) پایدارند. CYP584Q1 بیشترین و CYP617N1 کمترین میزان اسید‌آمینة آبدوست را در بین سایرین داشت. بیشترین شاخص حضور زنجیرههای آلیفاتیک محاسبه‌‌شده مربوط به CYP617N1 و کمترین مربوط به CYP52X1 بود. از بین مدلهای انتخاب شده مدلی که دارای کمترین ارزش ای (e-value) و بالاترین پوشش بود به عنوان بهترین مدل انتخاب شد. تعداد مارپیچ‌ها در توالیهای مختلف از 0 تا 2 متغیر بود. CYP5337A1 و CYP52G11 فاقد مارپیچ و CYP617N1 دارای دو مارپیچ بود. تعداد اسیدهای‌آمینة تخمین‌زده‌شده در مارپیچ، در تمام موارد به جز CYP584Q1، CYP5337A1 و CYP52G11 بیشتر از 18 بود. پپتید سیگنال شناسایی نشد. نتیجه‌گیری: در این تحقیق، برای اولین بار ساختار‌های سه بعدی هفت آنزیم سیتوکروم پ 450 در قارچ بووریا بازیانامدلسازی شد. پایداری آنزیم‌ها و مقاومت آن‌ها در مقابل عوامل نامطلوب محیطی مانند دما و اشعة ماوراء بنفش می‌تواند میزان بیمارگری قارچ را علیه آفات افزایش دهد. در نتیجه، با مهندسی این آنزیم‌ها امکان افزایش بیمارگری وجود دارد.
similar resources
Degenerate Four Wave Mixing in Photonic Crystal Fibers
In this study, Four Wave Mixing (FWM) characteristics in photonic crystal fibers are investigated. The effect of channel spacing, phase mismatching, and fiber length on FWM efficiency have been studied. The variation of idler frequency which obtained by this technique with pumping and signal wavelengths has been discussed. The effect of fiber dispersion has been taken into account; we obtain th...
full textارزیابی توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی آنزیم‌های سیتو‌کرمP450 در قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana
توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی و روابط فیلوژنتیکی بین ژنهای کد کنندة هفت آنزیم سیتو‌کرمP450 متعلق به قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana جدایة ATCC90517 موجود در بانک ژن مورد ارزیابی قرار گرفت. براساس نتایج BLASTN، بیشترین میزان شباهت هفت توالی مورد بررسی با ژنهای B. bassiana جدایة ARSEF (84-100درصد) و سپس قارچ‌های Cordyceps militaris و Isaria fumosorosea (76-89 درصد) مشاهده شد که مطابق ...
full textگزارش قارچ بیمارگر حشرات Paecilomyces lilacinus از روی سوسک سرشاخه خوار رز Osphranteria coerulescens در ایران
سوسک سرشاخه خوار گلسرخیان به درختان میوه دانه دار و هسته دار مخصوصا تیره رزاسه حمله می کند. خسارت اصلی مربوط به لاروهای این آفت است که با تغذیه از قسمت مرکزی شاخه ها و ایجاد کانالهایی در آن, موجب قطع شدن آوندها و مختل شدن جریان شیره نباتی شده و در نتیجه برگها و شاخه ها پلاسیده و سپس خشک می گردد (اسماعیلی,1375). در بررسیهای انجام شده روی این حشره در منابع موجود تاکنون از عوامل بیمارگر گزارشی ارا...
full textمعرفی چند گونه از قارچ های بیمارگر حشرات از ایران
هنگام بررسی لاشه حشراتی که از مکان های مختلف در استان های مازندران، گیلان و تهران جمع آوری شده بود، پوشش قارچی در سطح بدن آن ها مشاهده گردید که پس از جداسازی و خالص کردن قارچ های مزبور گونه های beauveria brongniartii* (از روی حشره کامل کفشدوزک هفت نقطه ای)، paecilomyces lilacinus**(از روی لاروهای ابریشم باف ناجور و حشره کامل سن گندم)،p. tenuipes* (از روی لارو و شفیره ابریشم باف ناجور)،p. farin...
full textبررسی پتانسیل چند ماده‌ی طبیعی جامد در تولید کنیدی قارچ بیمارگر حشرات، (Beauveria bassiana (Ascomycota, Cordycipitaceae
در این تحقیق، محیط‌های غذایی گندم، آرد گندم، سبوس گندم، آرد برنج، سبوس برنج، شلتوک برنج، ارزن و آرد ذرت در قالب یک طرح کاملاً تصادفی برای تولید کنیدی‌های هوایی جدایه‌های Beauveria bassiana EUT105 وB. bassiana EUT116 به روش سامانه‌ی دو فازی مایع- جامد مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که در هر دو جدایه بین تیمارها اختلاف معنی‌داری وجود دارد. سبوس گندم با میانگین تولید 1010 × 3/2 و شلتوک ب...
full textاثر برخی عصاره‌های گیاهی و آفت‌کش‌ها روی رشد میسلیوم و تندش قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana در شرایط آزمایشگاهی
قارچ Beauveria bassiana (Bals.) Vuill یکی از بیمارگرهای حشرات است. زنده‌مانی کنیدی‌ها ممکن است در اثر عوامل محیطی و آفت‌کش‌های شیمیایی که برای حفاظت گیاهان استفاده می‌شوند، تغییر کند. در این پژوهش اثر آفت‌کش‌های ایمیداکلوپرید، فلوفنکسرون، آمیتراز و عصاره‌های گیاهی چریش (Azadirachta indica) از خانواده Meliaceae، آنغوزه (Ferula assa-foetida L.) از خانواده Apiaceae، خرزهره (Nerium oleander) از خان...
full textMy Resources
Journal title
volume 13 issue شماره 1(پیاپی 42)
pages -
publication date 2020-05-21
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023