شناسایی ژن‌های مؤثر بر میزان چربی محوطۀ بطنی جوجه‏‌‏های گوشتی با استفاده از داده‌های ‏ریزآرایه و توالی‌یابی ‏RNA

Authors

  • ابوالفضل بهرامی دانشجوی سابق دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ‏ایران
  • سید رضا میرائی آشتیانی استاد ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
  • فرزاد غفوری دانشجوی کارشناسی ارشد، ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی ‏و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
  • مصطفی صادقی دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ‏تهران، کرج، ایران
Abstract:

امروزه انتخاب ژنتیکی برای افزایش رشد و تولید پروتئین حیوانی با کیفیت بالا در جوجه‏‌‏های گوشتی (Gallus gallus domesticus)، معمولاً منجر به افزایش وزن بیش از حد خواهد شد که نتیجۀ آن تأثیر منفی بر راندمان مصرف خوراک و کیفیت لاشه مانند افزایش چربی محوطه بطنی می­شود. هدف این مطالعه استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت چربی دو دسته جوجه‏‌‏های گوشتی با چربی بالا و پایین در محوطۀ بطنی، به‏‌‏منظور شناسایی ژن­های مؤثر در متابولیسم و ذخیره چربی می­باشد. در تجزیه داده­های ریزآرایه و RNA-seq برای بیان تفاوت ژنی به­ترتیب 2914 و 1867 ژن استخراج شد که در مجموع با مقایسه ژن­های شناسایی­ شده که تفاوت بیانی معنی­داری داشتند (000001/0P<)، 1835 ژن شناسایی شد. سپس با مقایسه تعداد ژن مربوطه در میان پروفایل­های ترانسکریپتوم، ژن­های مشترک مرتبط شامل THBS1، COLEC12، ANXA7، RGS19، TMEM258 و HTR7L بودند که در فرآیند اصلی مسیرهای کنترل سنتز، متابولیسم و ذخیره چربی و مسیر سیگنالینگ غدد درون­ریز فعال شده توسط آدیپوکین­ها دارای نقش می­باشند. تجزیه و تحلیل ترانسکریپتوم مرتبط با ذخیره چربی محوطه بطنی می­تواند بیان­کننده نقش آن به‏‌‏عنوان یک اندام متابولیک و درون­ریز در جوجه‏‌‏های گوشتی باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

full text

تخمین چربی حفره بطنی با استفاده از اندازه گیری تری گلیسریدهای پلاسما و رطوبت لاشه در جوجه های گوشتی

This experiment was carried out to determine the relationship of plasma triglycerides and carcass dry matter with abdominal fat. One of the problems of broiler is carcass fatness, especially abdominal fat due to rapid growth of broilers which is not the consumer preference. Six hundred one-day-old commercial broiler chicks (Lohman) were divided into 40 groups, 15 chicks per group. Each one of t...

full text

تخمین چربی حفره بطنی با استفاده از اندازه گیری تری گلیسریدهای پلاسما و رطوبت لاشه در جوجه های گوشتی

This experiment was carried out to determine the relationship of plasma triglycerides and carcass dry matter with abdominal fat. One of the problems of broiler is carcass fatness, especially abdominal fat due to rapid growth of broilers which is not the consumer preference. Six hundred one-day-old commercial broiler chicks (Lohman) were divided into 40 groups, 15 chicks per group. Each one of t...

full text

شناسایی محاسباتی فاکتورهای تنظیمی مؤثر در بیماری برونشیت عفونی طیور با استفاده از داده‌های RNA-Seq

بیماری برونشیت عفونی یکی از بیماری‌های ویروسی بسیار عفونی و شایع طیور می‌باشد. در این مطالعه به منظور درک بهتر شبکه تنظیمی درگیر در بیماری برونشیت عفونی، در ابتدا ژن های با بیان بالا و مشابه با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های یک مطالعه RNA-Seq در چهار حالت متفاوت شامل مقایسه‌ی بافت طحال جوجه‌های مبتلا به برونشیت با جوجه‌های سالم با غلظت پایین سرم مانوز باند شده با لکتین در سن یک هفتگی و سه هف...

full text

تخمین چربی حفره بطنی با استفاده از اندازه گیری تری گلیسریدهای پلاسما و رطوبت لاشه در جوجه های گوشتی

این آزمایش به منظور تعیین رابطه تری گلیسریدهای پلاسما و رطوبت لاشه با میزان چربی حفره بطنی به اجرا در آمد. مسئله بالا بودن چربی لاشه، به ویژه چربی حفره بطنی، به دلیل رشد سریع مرغهای گوشتی یکی از مشکلات مرغداریها محسوب می شود، ضمن این که مورد علاقه مصرف کنندگان نیز نمی باشد. تعداد 600 قطعه جوجه یکروزه گوشتی تجارتی به 40 گروه 15 قطعه ای تقسیم شدند و به هر چهار گروه از جوجه ها یکی از 10 جیره آزمای...

full text

شناسایی RNA های غیرکدکننده کوتاه ‌عملکردی با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی در گوسفند و بز

MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that have functional roles in post-transcriptional modification. They regulate gene expression by an RNA interfering pathway through cleavage or inhibition of the translation of target mRNA. Numerous miRNAs have been described for their important functions in developmental processes in numerous animals, but there is limited information about sheep an...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 50  issue 4

pages  259- 269

publication date 2020-02-20

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023