شناسایی و تعیین خصوصیات میکرو RNA‌های محافظت شده Coriandrum sativum L.با استفاده از داده‌های توالی‌یابی نسل جدید

Authors

  • رضا میر دریکوند استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، واحد خرم‌آباد، دانشگاه آزاد اسلامی ، خرم‌آباد، ایران
  • سید سجاد سهرابی محقق، باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، خرم آباد، ایران
  • سید محسن سهرابی محقق، باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، خرم آباد، ایران
  • کامران سمیعی استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کنگاور، کنگاور، ایران
Abstract:

میکرو RNA‌ها (miRNAs) گروهی از مولکول‌های RNA کوچک و غیر کدکننده‌ با طولی حدود 24-18 نوکلئوتید هستند که بیان ژن‌های هدف خود را در سطوح مختلف رونویسی و پس از رونویسی در گیاهان کنترل می‌کنند. میکرو RNA‌ها در فرآیندهای مختلفی مانند رشد و نمو، فرآیندهای زیستی، تکثیر سلولی و پاسخ به تنش‌ها در گیاهان نقش مهمی بازی می‌کنند. گشنیز زراعی با نام علمی (Coriandrum sativum L.) گیاهی از خانواده چتریان (Apiaceae) است که دارای کاربردهای غذایی و دارویی مختلفی است. ژنوم این گیاه تاکنون توالی‌یابی نشده است و هیچ‌گونه گزارشی از شناسایی میکرو RNA‌ها برای آن ثبت نشده است. مطالعه حاضر به‌منظور شناسایی میکرو RNA‌های محافظت شده بالقوه و ژن‌های هدف آن‌ها در ترنسکریپتوم گیاه گشنیز صورت گرفت. ابتدا ترنسکریپتوم بافت‌های بذر و برگ این گیاه سرهم‌بندی شد و رونوشت‌های غیر کد‌کننده به پروتئین شناسایی و به‌عنوان توالی‌های کاندید پیش‌ساز میکرو RNA در نظر گرفته شدند. در نهایت از بین توالی‌های کاندید سه میکرو RNA با نام‌های csa-miR162، csa-miR169 و csa-miR399 متعلق به سه خانواده محافظت شده میکرو RNA پس از اعمال فیلترهای سخت‌گیرانه شناسایی شد. میکرو RNAهای شناسایی شده دارای بیان متفاوتی در بافت‌های بذر و برگ بودند و نقش ژن‌های هدفشان در فرآیندهای مختلف زیستی نیز مورد تأیید قرار گرفت. در مجموع با توجه به اینکه میکرو RNAهای شناسایی شده در مطالعه حاضر دارای نقش تنظیمی بر طیف وسیعی از شبکه‌های ژنی و فرآیندهای زیستی مختلف در گیاه گشنیز هستند، می‌توان از آن‌ها به‌عنوان ژن‌های کاندید در بهبود عملکرد کمی و کیفی و همچنین مقاومت به تنش‌های مختلف در این گیاه بهره برد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای مرتبط با تنش خشکی در گیاه جو

مطالعه سازوکار‏های تحمل تنش در گیاه جو، به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل تنش خشکی و در نهایت بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل تنش به کمک روش‏های نوین ژنتیک مولکولی می‌انجامد. در این پژوهش، به‌منظور شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای درگیر در تحمل تنش خشکی گیاه جو، واکاوی EST های برگ و ریشه در گیاه جو صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانه‌ها از پایگاه‌ NCBI دریافت گردید، سپس با کمک نرم افزارهای بی...

full text

شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای مرتبط با تنش خشکی در گیاه جو

مطالعه سازوکار‏های تحمل تنش در گیاه جو، به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل تنش خشکی و در نهایت بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل تنش به کمک روش‏های نوین ژنتیک مولکولی می‌انجامد. در این پژوهش، به‌منظور شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای درگیر در تحمل تنش خشکی گیاه جو، واکاوی EST های برگ و ریشه در گیاه جو صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانه‌ها از پایگاه‌ NCBI دریافت گردید، سپس با کمک نرم افزارهای بی...

full text

Antioxidant potential of Coriandrum sativum L. seed extract.

The seeds of C. sativum are used as a traditional drug for the treatment of diabetes. The antioxidant and free-radical-scavenging property of seeds in vitro was studied and also investigated whether the administration of seeds curtails oxidative stress in the kidney of streptozotocin-induced diabetic rats. Incorporation of seed powder in the diet led to marked lowering of blood glucose and a ri...

full text

Chemical and Biological Investigations of Coriandrum Sativum Linn

The ethanolic extract of whole plant of Coriandrum sativum Linn., family: Umbelliferae, was assessed for its possible analgesic, antidiarrhoeal, antimicrobial and cytotoxic activity. Preliminary phytochemical screening of the ethanolic extract revealed the presence of alkaloids, tannins, glycosides, and gums. In acetic acid induced writhing in mice, the ethanolic extract (250 and 500 mg/kg) exh...

full text

Anti-granuloma activity of Coriandrum sativum in experimental models

BACKGROUND Coriandrum sativum has been used in the traditional systems of medicine for management of arthritis and other inflammatory disorders. OBJECTIVES In this study, we have evaluated the anti-inflammatory and anti-granuloma activities of Coriandrum sativum hydroalcoholic extract (CSHE) in experimental models. MATERIALS AND METHODS The anti-inflammatory activity of CSHE was evaluated u...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 9  issue 25

pages  59- 74

publication date 2019-04-21

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023