شناسایی و تحلیل فیلوژنتیکی و بیانی چپرون‌های هیستونی کلاس NAP در ذرت (Zea mays)
Authors
Abstract:
در یوکاریوت‌ها DNA ژنومی در ترکیب با پروتئین‌های هیستونی کروماتین را ایجاد می‌کند. چپرون‌های هیستونی از طریق تغییر دسترسی به DNA بر میزان رونویسی ژن‌ها تأثیر می‌گذارند. بر خلاف مخمر و جانوران، در مورد چپرون‌های هیستونی گیاهی اطلاعات کمی وجود دارد. در این رابطه، خانواده nucleosome assembly protein (NAP) در تمام یوکاریوت‌ها حفاظت شده بوده و جزء جدایی ناپذیر در پایداری، حفظ و پویایی کرماتین یوکاریوتی می‌باشد. این پروتئین ها در انتقال هیستون‌ها به هسته، تشکیل نوکلئوزوم و القاء سیالیت کروماتین نقش داشته و لذا رونویسی بسیاری از ژن‌ها را تحت تأثیر قرار می‌دهد. در این مطالعه با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیکی، 6 ژن شبه NAP (ZmNPL1 تا ZmNAPL6) در ذرت شناسایی شد. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که این ژن‌های NAPL همانند ژن‌های NAPL آرابیدوپسیس و برنج به دو زیر گروه تقسیم شده و رابطه تکاملی نزدیکتری با ژن‌های NAPL برنج داشتند. این ژن‌ها دارای 3 تا 11 اینترون بوده و بر روی 5 کروموزوم از 10 کروموزوم ذرت قرار گرفته‌اند. آنالیز بیانی بر پایه ریزآرایه نشان دهنده تنظیم دقیق رونویسی ژن‌های ZmNAPL در طول نمو ذرت می‌باشد. این امر حاکی از نقش مهم این ژن‌ها در برنامه ریزی مرتبط با فرآیندهای نموی ذرت بود. این مطالعه اولین گزارش در مورد شناسایی و بررسی روابط تکاملی، ساختاری و بیانی ژن‌های NAPL ذرت بوده و نتایج بدست آمده از آن اطلاعات پایه برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد ژن-های NAPL ذرت را مهیا می‌سازد.
similar resources
Recombination in Zea Mays
meiotic process in plants or animals does not necessarily produce the same T:!rcentage of recombinants in male and female germ cells. In maize, the frequency of recombination in a particular chromosomal region is usually higher in microsporogenesis than in megasporogenesis, if a difference exists at all. Chromosomes 2 and 10, according to genetic tests thus far, have similar recombination frequ...
full textMaize (Zea mays L.).
Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation is an effective method for introducing genes into maize. In this chapter, we describe a detailed protocol for genetic transformation of the maize genotype Hi II. Our starting plant material is immature embryos cocultivated with an Agrobacterium strain carrying a standard binary vector. In addition to step-by-step laboratory transformation proced...
full textDegenerate Four Wave Mixing in Photonic Crystal Fibers
In this study, Four Wave Mixing (FWM) characteristics in photonic crystal fibers are investigated. The effect of channel spacing, phase mismatching, and fiber length on FWM efficiency have been studied. The variation of idler frequency which obtained by this technique with pumping and signal wavelengths has been discussed. The effect of fiber dispersion has been taken into account; we obtain th...
full textEpistasis in Maize (zea Mays
ISHER (1918) provided a framework for the characterization of genotypic variance whereby he partitioned it into three components: ( 1 ) a portion associated with the average effects of genes, (2) a portion associated with dominance effects (allelic interactions) of genes, and (3) a portion associated with epistatic effects (nonallelic interactions) of genes. A logical method for the further sub...
full textInterchromosomal recombination in Zea mays.
A new allele of the 27-kD zein locus in maize has been generated by interchromosomal recombination between chromosomes of two different inbred lines. A continuous patch of at least 11,817 bp of inbred W64A, containing the previously characterized Ra allele of the 27-kD zein gene, has been inserted into the genome of A188 by a single crossover. While both junction sequences are conserved, sequen...
full textMy Resources
Journal title
volume 7 issue 18
pages 27- 40
publication date 2017-09-17
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023