شناسایی سویه های Enteroaggregative Escherichia coli در اسهال کودکان توسط Multiplex PCR و مطالعه قابلیت چسبندگی آن ها به سلول اپی تلیال

Authors

  • جعفری , انیس بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران
  • داوودآبادی, ابوالفضل بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران
  • عباس زاده, مریم بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران
  • علوی , مانا بخش بیولوژی مولکولی، انستیتو پاستور ایران
Abstract:

زمینه و اهداف: Enteroaggregative Escherichia coli EAEC یک پاتوژن روده ای در حال ظهور است که باعث اسهال حاد و مزمن در کودکان می شود. مشخصه EAEC الگوی چسبندگی آجر مانند به سلول های HEp-2 یا HeLa که برای تشخیص EAEC تست طلایی محسوب می شود. این چسبندگی متمایز از الگوی (Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC و (Diffusly Adherent E.coli (DAEC است. در این مطالعه برای تشخیص سویه های EAEC از تست (Multiplex PCR(mPCR استفاده شد و نتایج با تست چسبندگی به سلول HeLa مقایسه گردید. روش بررسی: سویه های E. coli از نمونه مدفوع کودکان مبتلا به اسهال در مرکز طبی کودکان تهران جدا و شناسایی آنها طبق روش های استاندارد انجام گرفت. غربالگری اولیه سویه های EAEC بر اساس تست چسبندگی به سلول انجام شد و 170 سویه که به نوعی به سلول چسبندگی داشتند، انتخاب شدند. برای تشخیص سویه های EAEC از تست mPCR استفاده شد. این تست بر مبنای سه ژن پلاسمیدی aaP، aggR و AA طراحی شده است. سپس برای تعدادی از سویه های mPCR مثبت و منفی تست اتصال به سلول HeLa انجام گرفت. یافته ها: بر اساس mPCR، 114 سویه (%67) به عنوان EAEC تشخیص داده شدند. ژن های پلاسمیدی aaP،aggR و AA به ترتیب در 114 (100%)، در 110 (%96.4) و در 80 (%70) سویه دیده شدند. بر اساس تست چسبندگی به سلول 53 (%86.9) سویه mPCR مثبت و 3 (%27.2) سویه mPCR منفی نیز دارای الگوی چسبندگی آجر مانند بودند. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که mPCR قادر است اکثر سویه های EAEC، که دارای الگوی چسبندگی آجر مانند هستند، را تشخیص دهد. این تست قادر است آن دسته از سویه های EAEC را که الگوی آجر مانند را هم نشان نمی دهند، تشخیص دهد. به نظر می رسد که mPCR یک تست سریع و با ویژگی خوب برای تشخیص سویه های EAEC باشد و به ویژه برای غربالگری تعداد زیاد ایزوله در موارد اپیدمی مناسب می باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شناسایی سویه های enteroaggregative escherichia coli در اسهال کودکان توسط multiplex pcr و مطالعه قابلیت چسبندگی آن ها به سلول اپی تلیال

زمینه و اهداف: enteroaggregative escherichia coli eaec یک پاتوژن روده ای در حال ظهور است که باعث اسهال حاد و مزمن در کودکان می شود. مشخصه eaec الگوی چسبندگی آجر مانند به سلول های hep-2 یا hela که برای تشخیص eaec تست طلایی محسوب می شود. این چسبندگی متمایز از الگوی (enteropathogenic escherichia coli (epec و (diffusly adherent e.coli (daec است. در این مطالعه برای تشخیص سویه های eaec از تست (multip...

full text

Multiplex PCR for detection of three plasmid-borne genes of enteroaggregative Escherichia coli strains.

We developed a novel multiplex PCR assay for enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) detection, by using three plasmid-borne genes (the aggregative adherence [AA] probe, aap, and aggR). One or more of the loci were detected in 24 (86%) of 28 patient isolates analyzed. The multiplex PCR assay is a fast, convenient, and sensitive molecular test to detect EAEC.

full text

Evaluation of a multiplex PCR method to detect enteroaggregative Escherichia coli.

Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) has been implicated in sporadic diarrhea in children and adults and has been identified as the cause of several outbreaks worldwide. The HEp-2 test remains the gold standard for identification of this pathotype. A 60-65 MDa plasmid encodes the aggregative adherence fimbriae (AAF/I and AAF/II), a transcriptional activator (aggR gene), the enteroaggregati...

full text

Development of PCR for screening of enteroaggregative Escherichia coli.

In this study, we determined the sequence of the EcoRI-PstI fragment of the plasmid pCVD432, also termed the enteroaggregative Escherichia coli (EAggEC) probe. A primer pair complementary to this probe was designed for PCR amplification of a 630-bp region. Comparison of the analysis of the EAggEC probe sequence with those in database libraries revealed no significant similarity to any known bac...

full text

Enteroaggregative Escherichia coli.

Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) are an increasingly important cause of diarrhoea. E. coli belonging to this category cause watery diarrhoea, which is often persistent and can be inflammatory. EAEC have been implicated in sporadic diarrhoea in children and adults, in both developing and developed countries, and have been identified as the cause of several outbreaks worldwide. EAEC are ...

full text

آنالیز بیان افتراقی ژن ها در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی ازباکتری اشیرشیاکولای در سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی

Lipopolysaccharide is a component of outer membrane of gram-negative bacteria involved in the pathogenic process leading to mastitis and metritis in dairy cattle. Additionally, LPS could be caused endometrium inflammation and implantation failure in many animal species. Based on economic importance of these diseases in dairy cattle industry, analysis of differential gene expression (DGE) and al...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 2  issue 3

pages  19- 24

publication date 2009-03

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023