خواص آنتی ژنی پروتئین L و Pilin PilA نوع 4 باکتری Finegoldia magna به منظور طراحی درون‌ رایانه‌ای واکسن پپتیدی چند اپی توپی

author

حسین جاوید گروه پژوهشی ژنتیک، جهاد دانشگاهی فارس

Abstract:

سابقه و هدف: فاینگولدیا مگنا پاتوژنی فرصت طلب بوده و شایع ترین گونه بیماری زای کوکسی های بی هوازی گرم مثبت است و عامل ایجاد 5 تا 12 درصد تمام عفونت های بی هوازی. سوپر آنتی ژن پروتئین L و Pilin PilA نوع 4 آن جهت طراحی واکسن های پپتیدی چند اپیتوپی ارزشمند است. مواد و روش ها: ابزارهای ایمونولوژی محاسباتی برای پیشبینی اپیتوپ ها به کار برده شدند. اپیتوپ ها از نظر خاصیت آنتی‌ژنیستی و آلرژی‌زایی و انرژی اتصال به الل های HLA بررسی شده و سپس به وسیله توالی های GPGPG و EAAAK به هم متصل شدند. زیر واحد B سم باکتری ویبریو کلرا به عنوان ادجوانت به انتهای آمینی و جهت خالص سازی و شناسایی پروتئین، توالی 6×HisTag به انتهای کربوکسیلی اضافه گردید و کدون ها جهت بیان آتی در اشریشیا کلی بهینه سازی شدند. پیشبینی ساختار 3D واکسن و اصلاح ساختاری انجام گرفت. ارزیابی ساختار بوسیله تحلیل نمودار راماچاندران صورت گرفت. خصوصیات فیزیکی-شیمیایی واکسن، انحلال پذیری و پایداری آن نیز بررسی شد. یافته ها: اپی توپ های انتخابی دارای خاصیت آنتی‌ژنیستی بالا و بدون آلرژی‌زایی بوده و همچنین دارای قدرت اتصال بالا به الل های HLA پیشنهادی اند. ساختار سه بعدی واکسن پایداری، انحلال پذیری و نیمه عمر بالایی در میزبان بیانی اشریشیا کلی دارد. نتیجه گیری: در این مطالعه، پروتئین L و Pilin PilA نوع 4 باکتری فاینگولدیا مگنا با موفقیت در طراحی درون رایانه ای واکسن مورد استفاده قرار گرفت. بررسی آتی برون تنی و درون تنی این واکسن پیشنهاد می شود.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

جداسازی آنتی ژن کپسولی باکتری سالمونلا تایفی Ty2 و تست حیوانی آن به منظور تهیه واکسن

سابقه وهدف: بیماری تیفوئید یا حصبه گسترش جهانی دارد و شایع ترین عامل آن سالمونلا تایفی می باشد. ایجاد سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک ها درمان را پیچیده کرده و این بیماری را به عنوان یک تهدید برای اپیدمی های آینده مطرح نموده است. واکسیناسیون یکی از راهبردهای اساسی مقابله با این بیماری محسوب می شود. هدف از این پژوهش جداسازی آنتی ژن کپسولی (Vi) باکتری سالمونلا تایفی،<...

full text

جداسازی آنتی ژن کپسولی باکتری سالمونلا تایفی Ty2 و تست حیوانی آن به منظور تهیه واکسن

full text

طراحی و ساخت واکسن dna چند اپی توپی برای ایجاد ایمنی محافظت کننده علیه ویروس هپاتیت c

زمینه و هدف: تغییرپذیری ویروس هپاتیت c (hcv) مهم ترین مشکل در فرآیند تهیه واکسن علیه این عفونت می باشد. در این مطالعه تجربی، برای ساخت واکسن حفاظت کننده علیه hcv، ساختار dna دربرگیرنده اپی توپ های حفاظت شده از پروتئین های ویروسی طراحی و ساخته شد. به منظور تقویت پاسخ ایمنی القاء شده، از خاصیت ادجوانتی انتهای آمین gp96 (nt(gp96)) استفاده گردید. مواد و روش ها: واکسن چنداپی توپی (pt) hcv کدکننده چه...

full text

Postoperative mediastinitis due to Finegoldia magna with negative blood cultures.

We report a case of Finegoldia magna (formerly known as Peptostreptococcus magnus) mediastinitis following coronary artery bypass in a 50-year-old patient. Even if staphylococci remain the main causative organism of postoperative mediastinitis, the responsibility of anaerobic bacteria must be considered in cases of fever and sternal drainage with negative blood cultures.

full text

Complete Genome Sequence of Finegoldia magna, an Anaerobic Opportunistic Pathogen

Finegoldia magna (formerly Peptostreptococcus magnus), a member of the Gram-positive anaerobic cocci (GPAC), is a commensal bacterium colonizing human skin and mucous membranes. Moreover, it is also recognized as an opportunistic pathogen responsible for various infectious diseases. Here, we report the complete genome sequence of F. magna ATCC 29328. The genome consists of a 1,797,577 bp circul...

full text

پیش بینی اپی توپ های b و t cell آنتی ژن p۴۰ به منظور توسعه واکسن مایکوپلاسما آگالاکتیه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

آگالاکسی یک بیماری مسری در نشخوارکنندگان کوچک است که توسط باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه ایجاد می شود. پروتئین p40 از مهم ترین آنتی ژن های سطحی در باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه است، که می توان از آن به منظور طراحی واکسن نوترکیب استفاده کرد. هدف از مطالعه حاضر به دست آوردن ویژگی های بیوانفورماتیک آنتی ژن p40 بود. به همین منظور، طیف گسترده ای از نرم افزارهای آنلاین به منظور پیش بینی b و tcell اپی تو...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title

دنیای میکروب ها

volume 13 issue شماره 1(پیاپی 42)

pages -

publication date 2020-05-21

unfollow

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

Finegoldia magna پروتئین L Pilin PilA نوع 4 واکسن پپتیدی چند اپی توپی طراحی HLA

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com