تولید رده سلولی K562 بیان کننده اندونوکلئاز Cas9 (CRISPR-associated9)

Authors

  • انصاری, فائزه مرکز تحقیقات انتقال خون ـ مؤسسه عالی آموزشی و پژوهشی طب انتقال خون
  • شمس آرا, مهدی استادیار پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی ـ پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
Abstract:

چکیده سابقه و هدف امروزه ژنوم رده‌های سلولی به منظور ایجاد مدل‌های بیماری و درمان آن‌ها ویرایش می‌شود. البته بزرگی ژن Cas9 موجب مشکلاتی از جمله پایین بودن کارآیی سیستم CRISPR شده است. برای حل این مشکل، رده‌های سلولی بیان‌کننده Cas9 تولید شده‌اند که در آن‌ها تنها باید بخش RNA راهنمای CRISPR به سلول ترانسفکت شود. مواد و روش‌ها در این مطالعه تجربی، قطعه PGK-PURO/CMV (PPC) با PCR از وکتور pAAVS1-puro-DNR  تکثیر شده و در وکتور  pTG19-Tهمسانه‌سازی شد. سپس قطعه PPC از این وکتور با آنزیم‌های KpnI و EcoRI خارج شد. وکتور pCas-Guide-AAVS1 نیز تحت برش آنزیمی مشابه قرار گرفت و اتصال آن با قطعه PPC منجر به ساخت وکتور pPPC-Cas گردید. پس از بهینه کردن شرایط الکتروپوریشن، وکتور pPPC-Cas به درون سلول‌های K562 الکتروپوریت شد و سلول‌های مقاوم به پرومایسین انتخاب شدند و میزان بیان Cas9 در آن‌ها با Real-time PCR بررسی شد. یافته‌ها با PCR قطعه‌ای به طول 2514 جفت باز تکثیر شد. وکتورpPPC-Cas  طی دو مرحله همسانه‌سازی ساخته شد. سلول‌های ترانسفکت شده مقاوم به پرومایسین انتخاب شدند. انتخاب کلونی در ادامه انجام شد و سه کلونی که نسبت به هم بیان‌های بالا، متوسط و پایین داشتند، انتخاب شدند. نتیجه گیری در این مطالعه سلول‌های K562 بیان‌کننده Cas9 به دست آمدند که از آن‌ها می‌توان در مطالعه‌های آتی‌ژنومیک عملکردی و نیز تولید مدل‌های سلولی بیماری‌های انسانی استفاده کرد.  

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

استفاده از سیستم CRISPR/Cas9 برای دستکاری ژن SGR فستوکای بلند بر اساس بیان موقت

چکیده سابقه و هدف: یکی از فناوری های پیشرفته در ویرایش ژنوم، مربوط به فناوری تکرارهای کوتاه پالیندرومی فاصله دار منظم خوشه ای است. در این پژوهش RNA راهنمای مربوط به ژن SGR درگیر در تجزیه کلروفیل، در تماس نزدیک با پروتئین Cas9 در سازه CRISPR برای هدف قرار دهی این ژن در برگ های فستوکای بلند قرار گرفت. مواد و روش‌ها: در راستای ساخت سازه CRISPR/Cas9 قابل برنامه ریزی برای هدف گیری ژن SGR، ابتدا یک...

full text

CRISPR/Cas9: ابزار قدرتمند مولکولی برای ویرایش ژنوم

اصلاح هدفمند ژنومی با استفاده از نوکلئازهای هدایت شونده توسط RNA روشی سریع، آسان و پربازده است که نه تنها امکان دستکاری و تغییر ژن­ها و مطالعات کارکردی را برای پژوهشگران فراهم نموده است، بلکه آگاهی آن­ها را در رابطه با اساس مولکولی بیماری­ها و ابداع روش­های درمانی نوین و هدفمند افزایش داده است. تاکنون فنون متفاوتی با عنوان قیچی­های مولکولی با قابلیت ویرایش هدفمند ژنوم شاملZFN ،TALEN  وCRISPR/Ca...

full text

What is CRISPR/Cas9?

HYMS Centre for Education Development (CED), Hull York Medical School, University of York, York, UK Molecular Haematology Unit, MRC Weatherall Institute of Molecular Medicine, University of Oxford, John Radcliffe Hospital, Oxford, UK Department of Haematology, Oxford University NHS Foundation Trust, Churchill Hospital, Oxford, UK Academic Unit of Child Health, Sheffield Children’s Hospital, She...

full text

Overview of CRISPR-Cas9 Biology.

Prokaryotes use diverse strategies to improve fitness in the face of different environmental threats and stresses, including those posed by mobile genetic elements (e.g., bacteriophages and plasmids). To defend against these elements, many bacteria and archaea use elegant, RNA-directed, nucleic acid-targeting adaptive restriction machineries called CRISPR -: Cas (CRISPR-associated) systems. Whi...

full text

CRISPR-Cas9: Prospects and Challenges.

All science takes inspiration from nature, but nowhere is this more true than in biology, where some of the most powerful tools available to researchers are derived from natural products. From restriction enzymes and fluorescent proteins to microbial opsins and viral gene delivery vectors, researchers have capitalized on processes that occur in a variety of microbial, plant, and animal species....

full text

مهندسی ژنوم از آزمایشگاه تا بالین توسط CRISPR/Cas9

اکتشاف قیچی­های مولکولی به همراه توانایی آن­ها در ایجاد تغییرات هدفمند در نقاط مشخصی از ژنوم، به بررسی­های کارکردی ژن­ها، ژنوم و اپی­ژنوم منجر شده است. این فنون با افزایش فهم پژوهشگران در رابطه با اساس مولکولی بیماری­ها و تسهیل درمان­های نوین ژنتیکی کمک شایانی به علم ژنتیک پزشکی کرده است. سادگی سیستم CRISPR/Cas9، دستورزی راحت و قابلیت هدف­گیری چندگانه، CRISPR/Cas9 را به عنوان سیستم منتخب در بسی...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 16  issue 1

pages  32- 43

publication date 2019-02

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023