تمییز آلل‏ های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA

Authors

  • سید میلاد واحدی گروه بیماریهای داخلی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
  • شهرام جمشیدی گروه بیماریهای داخلی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
  • لیلا لنکرای مهاجر گروه بیماریهای داخلی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
Abstract:

زمینه مطالعه: نقش مهم مولکول‏های مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) اتصال به پپتید‌های پادگنی و عرضه آن‌ها به لنفوسیت‏های T است. از اینرو تنوع MHC با حساسیت و یا مقاومت در برابر بسیاری از بیماری‏های عفونی و بیماری های خودایمن مرتبط است. یک روش نوین بررسی تنوع ژنتیکی، تحلیل دقیق دمای شکافت (HRM-High Resolution Melting) DNA است که می توان آنرا برای بررسی تنوع MHC به کار برد. هدف: تمییز آلل‏ های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA روش کار: تعداد 40 نمونه خون از سگ های ارجاعی به بیمارستان دام‏های کوچک دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA و افزوده سازی اگزون دوم ژن DLA-DRB1، تحلیل HRM و منحنی ذوب صورت گرفت. برای تطبیق الگوهای HRM با توالی نوکلئوتیدی آلل ها، از روش تعیین توالی مستقیم استفاده شد. نتایج: بر اساس تنوع مشاهده شده در نتایج HRM و منحنی ذوب، 40 نمونه به 8 ژنوتیپ (A تا H) قابل تقسیم‏بندی بودند. بیشترین فراوانی مربوط به تیپ A (00/25 %) و سپس تیپ C و E (هر کدام 00/15 %) بود. در مجموع 5/82 % نمونه ها هتروزیگوت و 5/17 % نمونه ها هوموزیگوت بودند. نتیجه گیری: مطالعه حاضر اولین مطالعه‏ای است که برای تایپیگ آلل‏های ژن DLA-DRB1 از تکنیک HRM استفاده شده است. تطبیق نتایج HRM با توالی آلل ها نشان داد که این روش می‏تواند برای تفکیک آلل‏های DLA-DRB1 به کار رود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی ارتباط آلل‌های ژن DLA- DRB1 و درماتیت آتوپیک در سگ

زمینۀ مطالعه:مولکول‌های مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC)، در اتصال به پپتیدهای پادگنی و عرضه آن‌ها به لنفوسیت‌های T نقش مهمی دارند و تنوع آن‌ها با پاسخ‌های ایمنی و خودایمنی مرتبط است. ارتباط ژن‌ کدکننده MHC کلاس 2 در سگ (DRB1)با برخی بیماری‌های ایمنی سگ نشان داده شده است. هدف:کشف ارتباط بیماری درماتیت آتوپیک سگ با آلل‌های ژن DLA-DRB1. روش‌کار: تعداد 20 نمونه خون از سگ‌های مبتلا به درماتیت آتوپیک و ...

full text

تعیین ژنوتیپ‌هایDRB3 از مجتمع عمده پذیرش بافتی گاومیش با روش تحلیل دقیق دمای شکافت

    مجتمع عمده­ی پذیرش بافتی (MHC) نقشی مهم در پاسخ‌های ایمنی دارد و تنوع مولکول‌های آن با توانایی شناخت و پاسخ به پپتیدهای بیگانه مرتبط است.  در میان ژن‌های MHC گاوسانان، ژنوتایپینگ DRB3 برای بررسی‌های ژنتیک جمعیت و ارتباط MHC با صفات ایمنی و صفات تولیدی کاربرد بیش­تری دارد.  در این تحقیق اگزون دوم ژن Bubu-DRB3 با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز افزوده شد و سه روش تحلیل دقیق دمای شکافت (HRM)، تحلی...

full text

DLA-DRB1, DQA1, and DQB1 alleles and haplotypes in North American Gray Wolves.

The canine major histocompatibility complex contains highly polymorphic genes, many of which are critical in regulating immune response. Since domestic dogs evolved from Gray Wolves (Canis lupus), common DLA class II alleles should exist. Sequencing was used to characterize 175 Gray Wolves for DLA class II alleles, and data from 1856 dogs, covering 85 different breeds of mostly European origin,...

full text

DLA-DRB1 histocompatibility genotyping using RT-nested PCR and cycle sequencing.

Class-II histocompatibility genes are associated with predisposition to autoimmune diseases in many mammal species. We have developed a technique using reverse transcriptase and nested-PCR for amplification from blood samples of expressed sequences encoded by canine DLA-DRB1 loci. In the first polymerase chain reaction (PCR), we utilize primers DR-SP and DR-STOP as developed by Sarmiento et al....

full text

High-resolution characterization of the canine DLA-DRB1 locus using reference strand-mediated conformational analysis.

Several methods exist for genotyping class II DLA gene polymorphisms in the dog. The most accurate method is sequence-based typing, which involves direct sequencing of polymerase chain reaction products. However, this method is expensive and unsuitable for large-scale studies. Recently, reference strand-mediated conformation analysis (RSCA) has been shown to be effective for characterizing majo...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 73  issue 1

pages  93- 100

publication date 2018-05-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023