تعیین و تجزیه و تحلیل تعداد توالی های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس"Multiple-Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis" جهت تیپ بندی سویه های پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی

Authors

  • رشید, رمضانزاده مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، پژوهشکده توسعه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران.
  • روحی, سمانه مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، پژوهشکده توسعه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران.
  • مهاجری, پرویز مرکز تحقیقات عفونت بیمارستانی، پژوهشکده توسعه سلامت، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران.
Abstract:

مقدمه: شناسایی منبع پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی عامل مهم در کنترل عفونت است. هدف از این مطالعه بررسی و تجزیه‌وتحلیل تعداد توالی‌های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوسی جهت تیپ بندی سویه های پسودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت بیمارستانی است. روش کار: مطالعه توصیفی-تحلیلی حاضر طی آذر 1394 الی اسفند 1396 در شهر سنندج روی 134 نمونه بالینی پسودوموناس آئروژینوزا انجام شد. آزمایش های فنوتیپی میکروب شناسی و PCR جهت تائید پسودوموناس آئروژینوزا انجام شد. تیپ بندی مولکولی به روش توالی های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس انجام و تجزیه و تحلیل آن با استفاده از رسم ماتریکس صفر و یک صورت گرفت. جهت تحلیل داده ها از نسخه 12 Stata و آزمون دقیق فیشر و مجذور کای استفاده شد (05/0p≤). یافته‌ها: درصد سویه های پسودوموناس آئروژینوزا که مرتبط با عفونت بیمارستانی بودند 79/41% بود. بیشترین نمونه های بالینی عفونت بیمارستانی مرتبط با تراکئال (78/51%) و کمترین مربوط به خلط و مایع شکمی (هرکدام 78/1%) بود. بین عفونت بیمارستانی و بخش مراقبت ویژه و همچنین با نمونه های تراکئال ارتباط معنی داری مشاهده شد (05/0p≤). آنالیز 10 سویه جداشده از عفونت بیمارستانی وجود 10 الگو با تشابه 72% را نشان داد. نتیجه‌گیری: عفونت‌های بیمارستانی مرتبط با پسودوموناس آئروژینوزا و پراکنش اپیدمیولوژیکی این باکتری در مطالعه ما نشان داده شد. بررسی منشأ باکتری‌های علت عفونت بیمارستانی گام مهم در پیشگیری و کنترل آن است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

آنالیز نواحی تکراری چند ناحیه ای (MLVA) به منظور تیپ بندی سویه های سودوموناس آئروژینوزای عامل عفونت ادراری

سابقه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا یکی از شایع ترین عوامل عفونت­های ادراری در بیمارستان­ها می باشد. هدف از این مطالعه تعیین تیپ تعدادی از جدایه های بدست آمده از بیماران به روش MLVA به منظور رسیدن به یک الگوی ژنتیکی مشخص برای دسته بندی آنها می­باشد. مواد و روش ­ها: در این مطالعه 70 سویه سودموناس آئروژینوزا از نمونه ادراری بیماران در بیمارستان های تهران جمع آوری شد. برای بررسی ژنوتیپی بر اساس روش ...

full text

تعیین تیپ و بررسی ارتباط ژنتیکی سویه‌های لیستریا منوسایتوژنز جدا شده از نمونه‌های غذایی به وسیله تجزیه و تحلیل تعداد توالی‌های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس MLVA

زمینه و اهداف: لیستریا منوسایتوژنز عامل مسبب لیستریوزیس و عفونت‌های کشنده در انسان است. هدف از این مطالعه تیپ بندی و بررسی ارتباط ژنتیکی سویه‌های جدا شده از نمونه‌های مواد غذایی به‌وسیله تکنیک MLVA است. مواد و روش کار: بین سال‌های ۸۹ تا ۹۲ تعداد ۳۱۷ نمونه مواد غذایی از سطح شهر تهران جمع‌آوری و پس از تشخیص نهایی، DNA آن‌ها به‌منظور انجام تکنیک MLVA استخراج شد، سپس عکس‌های حاصل از ژل محصولات PCR ...

full text

تعیین تیپ و بررسی ارتباط ژنتیکی سویه های لیستریا منوسایتوژنز جدا شده از نمونه های غذایی به وسیله تجزیه و تحلیل تعداد توالی های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس mlva

زمینه و اهداف: لیستریا منوسایتوژنز عامل مسبب لیستریوزیس و عفونت های کشنده در انسان است. هدف از این مطالعه تیپ بندی و بررسی ارتباط ژنتیکی سویه های جدا شده از نمونه های مواد غذایی به وسیله تکنیک mlva است. مواد و روش کار: بین سال های ۸۹ تا ۹۲ تعداد ۳۱۷ نمونه مواد غذایی از سطح شهر تهران جمع آوری و پس از تشخیص نهایی، dna آن ها به منظور انجام تکنیک mlva استخراج شد، سپس عکس های حاصل از ژل محصولات pcr ...

full text

VNTRDB: a bacterial variable number tandem repeat locus database

Variable number tandem repeat-PCR (VNTR-PCR) is a novel method developed for molecular typing of microorganisms. This method has proven useful in epidemiological studies in medical microbiology. Although hundreds of bacterial genomes have been sequenced, variable number tandem repeats (TRs) derived from comparative genome analyses are scarce. This may hamper their application to the surveillanc...

full text

Diversity of Variable Number Tandem Repeat Loci in Shigella Species Isolated From Pediatric Patients

Multilocus variable number tandem repeat (VNTR) analysis (MLVA) is a new typing method with several advantages compared to other methods. Dissemination of Shigella is highly significant in developing countries. Whilst Shigella is becoming increasingly important as an etiologic agent of pediatric shigellosis in Iran, little is known about the genetic diversity of the local strains. Therefore, th...

full text

بررسی میزان فراوانی ژن متالوبتالاکتامازVIM1 در سویه های سودوموناس آئروژینوزای بیمارستانی با مقاومت چند گانه

 مقدمه و هدف: هدف از این مطالعه، شناسایی و بررسی میزان فراوانی ژن متالوبتالاکتامازVIM1 در سویه های سودوموناس آئروژینوزای بیمارستانی با مقاومت چند گانه بود. متالوبتالاکتامازها قادر به هیدرولیز طیف وسیعی از بتالاکتام ها از جمله پنی سیلین ها، سفالوسپورین ها و کارباپنم ها هستند، اما توانایی هیدرولیز مونوباکتام ها (آزترونام) را ندارند. متالوبتالاکتاماز بر اساس ساختار مولکولی به شش نوع تقسیم می ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 23  issue 6

pages  128- 141

publication date 2019-02

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023