تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroA جدا شده از طیور مبتلا به کلی باسیلوز در ایران و مقایسه آن با سویه‌های موجود در بانک ژنی

‌ژن‌aroA یکی از ژن‌های مهم برای تولید اسید آمینه‌های آروماتیک می‌باشد و برای حیات باکتری‌ بسیار ضروری است. نشان داده شده است، که توالی ژنی aroA در باکتری‌ها متفاوت است، بنابر این هدف این مطالعه تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroA در سویه‌ ‌اشریشیا کلی‌ ‌بومی‌ 80: K78O برای‌ ‌مشخص کردن تفاوت‌ها بین این سویه و سویه‌های موجود در بانک ژنی اشریشیا کلی ‌80: K78O بود. برای ازدیاد ژن aroA در سویه بومی از واکنش زنجیره‌ای پلی مراز استفاده شد. محصول 1206 بازی واکنش زنجیره‌ای پلی مراز از ژل الکترو فورز استخراج و در پلاسمید‌R57pTZ همسان سازی شد و سپس توالی نوکلئوتیدی آن تعیین گردید. این توالی هم از نظر توالی نوکلئوتیدی و هم از نظر توالی اسید آمینه‌ای با سویه‌‌های موجود در بانک ژنی مقایسه شد. نتایج نشان داد که توالی در ژن aroA اشریشیا کلی‌ ‌بومی با سویه‌های اشریشیا کلی‌ ‌موجود در بانک ژنی از لحاظ 2 اسید آمینه تفاوت دارد، که به ترتیب عبارتند از‌ ‌از اسیدآمینه سی و نهم سویه‌های موجود در بانک ژنی که ترئونین (Threonine) است و به جای آن در سویه بومی ایزولوسین ((Isoleucine قرار گرفته و دیگری اسیدآمینه دویست و چهلم که به جای اسید گلوتامیک ((Glutamic acidدر سویه‌های موجود در بانک ژنی، گلیسین ((Glycine در سویه بومی نشسته است. دانستن این تفاوت‌ها برای انجام روش‌های مولکولی، طراحی آغازگرهای مختلف و تحقیقات بعدی مهم است.