بهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی 16S rDNA
Authors
Abstract:
سابقه و هدف: شیر و فرآورده های آن در بعضی شرایط، موجب رشد عوامل بیماری زا از جمله اشریشیا کلی که مهمترین آلوده کننده مواد غذایی است می گردند. این مطالعه با هدف بهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی 16S rDNA انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی–توصیفی از 200 نمونه بستنی جمع آوری شده از مناطق محتلف اصفهان، تعداد 82 جدایه باکتریایی جداسازی گردید. از این تعداد 48 جدایه اندول مثبت بودند. جداسازی بر اساس استاندارد ملی ایران شماره 2946 و استفاده از محیط های کروموژنیک به صورت مقایسه ای انجام شد. پس از انجام آنالیز عددی و سایر آزمون ها، به کمک PCR قطعه 16S rDNA تکثیر و سپس توالی یابی گردید. یافته ها: با توجه به روش ارائه شده در استاندارد ملی روش یاد شده دارای 88 درصد صحت و 12 درصد خطا می باشد. در این بررسی جدایه های اندول مثبت مانند اشریشیا هرمانی، پروویدنشیا رتگری، کلبسیلا اکسی توکا و مورگانلا مورگانی توانستند در نتیجه نهایی ارائه شده در استاندارد ملی ایران خطا ایجاد نمایند. نتیجه گیری: آنالیزهای انجام شده با استفاده از محیط های کشت حاوی مواد کروموژنیک نشان داد که با صحت بالاتر، سرعت بیشتر و قیمت ارزان تر می توان اشریشیا کلی تیپیک را شناسایی نمود.
similar resources
بهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی 16s rdna
سابقه و هدف: شیر و فرآورده های آن در بعضی شرایط، موجب رشد عوامل بیماری زا از جمله اشریشیا کلی که مهمترین آلوده کننده مواد غذایی است می گردند. این مطالعه با هدف بهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی 16s rdna انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی–توصیفی از 200 نمونه بستنی جمع آوری شده از مناطق محتلف اصفهان، تعداد 82 جدایه باکتریایی جداسازی گردید. از این تعداد 48 جدایه اندول م...
full textبهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی ۱۶s rdna
سابقه و هدف: شیر و فرآورده های آن در بعضی شرایط، موجب رشد عوامل بیماری زا از جمله اشریشیا کلی که مهمترین آلوده کننده مواد غذایی است می گردند. این مطالعه با هدف بهینه سازی روش شناسایی اشریشیا کلی در بستنی بر مبنی 16s rdna انجام شد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی–توصیفی از 200 نمونه بستنی جمع آوری شده از مناطق محتلف اصفهان، تعداد 82 جدایه باکتریایی جداسازی گردید. از این تعداد 48 جدایه اندول م...
full textمقایسه روش‌های FTIR و تحلیل توالی ژن 16S rDNA در شناسایی و رده‌بندی باکتری‌های متیلوتروف
تحلیل توالی 16S rDNA اگر چه روشی نسبتاً دقیق و قابل اعتماد برای شناسایی و تاکسونومی باکتری‌هاست اما فرآیندی وقت‌گیر و پُر هزینه است. به همین دلیل یافتن راه‌های جایگزین همواره مورد توجه پژوهشگران بوده است. یکی از روش‌های مطرح FTIR (Fourier Transform Infrared) است که روشی فیزیکو-شیمیایی است مبتنی بر اندازه‌گیری لرزش پیوندهای مولکولی یک ترکیب که به وسیله فرکانس مناسبی از پرتو مادون قرمز تحریک شده‌ان...
full textشناسایی ژن‌های بیماری‌زایی در سویه‌های اوروپاتوژنیک اشریشیا کلی (UPEC) به روش Multiplex-PCR
زمینه و هدف: عفونت دستگاه ادراری یکی از شایع‌ترین بیماری‌ها در تمامی گروه‌های سنی در جهان است. حضور فاکتورهای بیماری‌زایی مختلف عامل مهمی در بروز عفونت دستگاه ادراری است. مطالعه حاضر به‌منظور شناسایی ژن‌هایiha ، iroNو ompTدر جدایه‌های اشریشیا کلی اوروپاتوژنیک جداشده از نمونه‌های بالینی با روش Multiplex-PCR در استان کرمان انجام گردید. مواد و روش‌ها: در این مطالعه توصیفی-مقطعی تعداد 200 نمونه ا...
full textWhat is broad-range 16S rDNA PCR?
Patel A, et al. Arch Dis Child Educ Pract Ed 2017;0:1–4. doi:10.1136/archdischild-2016-312049 INTRODUCTION PCRs have revolutionised the detection of bacteria in clinical samples since their widespread introduction in the 1990s. Quantitative PCR (qPCR), also known as specific PCR, involves the targeting of particular bacterial species. The technique uses specific primers (short strands of nuclei...
full textMy Resources
Journal title
volume 8 issue شماره 3 (پیاپی 24)
pages 209- 220
publication date 2015-12-01
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023