بررسی چند شکلی DNA در جمعیت‌های AG-4 Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP

توالی­های DNA ریبوزومی به­دلیل اینکه دارای کپی­های زیادی از ژن­های rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر می­باشند، به­منظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار می­گیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هسته­ای، واحد­های تکراری تکامل یافته ثابت می­باشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. به­منظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژن­های s28 و s18 در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani  گروه آناستوموزی 4 (AG-4)، 28جدایه از میزبان­های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایه­ها DNA استخراج و از آن­ها به عنوان الگو در واکنش­های PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصله­ساز داخلی بین ژن­های ریبوزومی با استفاده از آغازگر­های ITS1 و ITS4 یک قطعه DNA به اندازه 700 جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیم­های برشیTaq I  Xba I, Hae III, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I, Hinc II, Hinf I, Eco RI, هضم شد. ولی آنزیم­های Xba I, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایه­های Rhizoctonia solani AG4 هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروه­های AG4-HG I و AG4-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.