بررسی میزان مشارکت ژن‌های دخیل در سرطان سلول‌های استرومای سینه بر اساس تجزیه و تحلیل نتایج ریزآرایه با استفاده از مدل ریاضی

Authors

  • دکتر حمیدرضا نویدی, دانشگاه شاهد
  • سعید برجسته, دانشگاه شاهد
  • هادی آقایاری, دانشگاه شاهد
Abstract:

سابقه و هدف: سرطان سینه شایعترین نوع سرطان و عمده‌ترین دلیل مرگ‌ ناشی از سرطان در زنان سراسر دنیا است. تعیین عوامل مؤثر در این بیماری یکی از دغدغه‌های جامعه پزشکی امروز است. عوامل ژنتیکی یکی از مؤثرترین عوامل در بروز سرطان سینه هستند. برخی گزارشات پزشکی به طور انتزاعی به نقش برخی از ژن‌ها در این بیماری اشاره کرده‌اند. در این پژوهش با توجه به عدم وجود اطلاعات کافی و معتبر برای مدل‌سازی ریاضی درباره بیان ژن‌های شناخته شده در این نوع سرطان، اطلاعات مورد نیاز برای مدل‌سازی درباره تغییرات بیان ژنی از سایت NCBI جمع‌آوری گردید. مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی روی مجموعه داده‌های بیان ژنی حاصل از تجزیه و تحلیل ریزآرایه مربوط به 5 فرد سالم و 28 بیمار مبتلا به سرطان سلول‌های استرومای سینه موجود در سایت NCBI صورت گرفت. مدل‌سازی بر روی بیان 22277 ژن مرتبط با این نوع سرطان صورت گرفت. در این مدل، هر ژن به عنوان یک بازیکن در بازی TU در نظر گرفته شد و سهم مشارکت هر یک از ژن‌ها در این نوع سرطان محاسبه گردید. سرانجام 200 ژن که سهم بیشتری داشتند انتخاب و رتبه‌بندی شدند. یافته‌ها: نتایج این پژوهش دال بر این هستند که بیش از 200 ژن سهم مشارکتی بالایی در بروز این نوع سرطان دارند، اما تغییر در بیان ژن‌های DDR1، SLC23A2 و PADI2 به ‌ترتیب بالاترین سهم مشارکت در بروز سرطان در سلول‌های استرومای سینه را در مقایسه با دیگر ژن‌ها در این نوع سرطان دارا می‌باشند. نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد که تغییر در بیان تعدادی از ژن‌ها در این نوع سرطان به وقوع می‌پیوندد. در تأیید یافته ما، نقش تغییر در بیان ژن‌های DDR1 و PADI2 در بروز این نوع سرطان به طور تجربی در پژوهشهای قبلی نشان داده شده است. اما این پژوهش از نظر رتبه‌بندی بیان ژن‌هایی که در سرطان سینه دچار تغییر می‌شوند، منحصر به فرد است. این رتبه‌بندی بیان ژنی دارای ارزش پشتیبانی بالایی در تصمیم‌گیری برای تشخیص و درمان سرطان است. تصمیم‌گیری نهایی در ارتباط با صحت طبقه‌بندی ما منوط به نتایج پژوهشهای تحلیلی در ارتباط با تعیین سهم ژن‌های دخیل در بروز سرطان سینه است.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی میزان مشارکت ژن های دخیل در سرطان سلول های استرومای سینه بر اساس تجزیه و تحلیل نتایج ریزآرایه با استفاده از مدل ریاضی

سابقه و هدف: سرطان سینه شایعترین نوع سرطان و عمده ترین دلیل مرگ ناشی از سرطان در زنان سراسر دنیا است. تعیین عوامل مؤثر در این بیماری یکی از دغدغه های جامعه پزشکی امروز است. عوامل ژنتیکی یکی از مؤثرترین عوامل در بروز سرطان سینه هستند. برخی گزارشات پزشکی به طور انتزاعی به نقش برخی از ژن ها در این بیماری اشاره کرده اند. در این پژوهش با توجه به عدم وجود اطلاعات کافی و معتبر برای مدل سازی ریاضی دربا...

full text

تحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه

Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...

full text

تحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه

Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...

full text

عوامل خطرساز و ژنهای دخیل در سرطان تخمدان

سرطان تخمدان ششمین سرطان شایع دنیا، دومین و کشنده­ ترین سرطان شایع زنانه و هفتمین علت مرگ ناشی از سرطان در زنان می باشد و 2 درصد زنانی که سابقه فامیلی ابتلا به آن را ندارند، ممکن است در طول عمر خود به آن مبتلا شوند. سرطان تخمدان هنوز در راس علل مرگ و میر ناشی از سرطان­های دستگاه تناسلی است. اگرچه ممکن است جامعه در مقابل این بیماری، بی­ دفاع به نظر بیاید، ولی می‌توان با استفاده از عوامل خطر متعد...

full text

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

full text

پیش‌بینی اهداف MicroRNAهای دخیل در سرطان سینه با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیکی

مقدمه: پیش‌بینی اهداف miRNA‌ها از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. توسعه روش‌های محاسباتی و متعاقباً صرفه‌جویی در هزینه و زمان پژوهش‌های آزمایشگاهی، تأثیر به سزایی در افزایش سرعت ساخت داروهای درمانی از جمله داروهای ضد سرطانی دارد. با توجه به این که زمان کمی از شناخت miRNA‌ها می‌گذرد، روند پژوهش‌ها در ابتدا کند بود. اما به مرور با شکل‌گیری دیتابیس‌های بیولوژیکی و درک اهمیت آن‌ها، دانشمندان بر روی این ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 17  issue 5

pages  228- 233

publication date 2012-12

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023