بررسی ساختار ژنتیکی روباه معمولی(Vulpes vulpes) در مرکز ایران با استفاده از توالی ژن ناحیه کنترل میتوکندری
Authors
Abstract:
در این مطالعه به منظور بررسی ساختار ژنتیکی روباه معمولی در مناطق مرکزی ایران، 32 نمونه بافت از پنج استان (اصفهان، تهران، سمنان، کرمان و یزد) جمعآوری شد. پس از استخراج DNA، ژن ناحیه کنترل از ژنوم میتوکندری توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز تکثیر و 327 جفت نوکلئوتید از این ژن برای هر نمونه توالییابی شد. نتایج نشان داد که 24 هاپلوتایپ متفاوت در بین نمونهها وجود دارد و تنوع هاپلوتایپی برابر با 98/0 است. با توجه به نتایج تجزیه و تحلیل واریانس مولکولی (AMOVA) نمونهها، شباهت متوسطی بین جمعیتها وجود دارد و بیشترین واریانس نمونهها مربوط به تغییرات درون جمعیتی است. بر اساس میزان شاخص راجر-هارپندینگ و چند نمایی بودن نمودار آن گسترش گونه اتفاق نیفتاده است، اما بر اساس نتایج دو آماره تاجیما و FU میتوان نتیجه گرفت که امکان گسترش گونه در گذشته وجود داشته، اما این گسترش معنیدار نبوده است. درخت تبارزایشی رسم شده بیانگر این مسئله است که ساختار ژنتیکی مستقلی برای جمعیتهای مورد مطالعه وجود ندارد و تفاوت درون جمعیتی بیشتر از تفاوت بین جمعیتی است و شبکه هاپلوتایپی رسم شده نیز این نظر را تأیید میکند. اگرچه با توالییابی یک قسمت کوتاه از ژنوم یک گونه به تنهایی نمیتوان برنامه حفاظتی برای یک گونه را مشخص نمود ولی بر اساس نتایج بدست آمده میتوان نتیجه گرفت که جمعیت روباه در این مناطق در حال حاضر با مشکل گردنه بطری روبرو نیست.
similar resources
بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (Vulpes vulpes) در شمال شرق ایران براساس ژن سیتوکروم b
به منظور بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (Vulpes vulpes)در شمال شرق ایران، 25 نمونه بافت از سه استان (خراسان رضوی، خراسان شمالی و گلستان) جمعآوری شد. پس از استخراج DNA، ژن سیتوکروم b توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز، با استفاده از پرایم...
full textاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
full textاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
full textمطالعة ساختار ژنتیکی اسبهای بومی ایران با استفاده از توالی D-loop ژنوم میتوکندری
در این مطالعه، به منظور آگاهی از ساختار ژنتیکی اسبهای بومی ایران در مقایسه با نمونههای خارجی، نمونههای خون از 95 رأس اسب از جمعیتهای متعدد نقاط مختلف کشور و 114 توالی D-loop میتوکندری از بانک اطلاعات ژنوم بدست آمد. DNA کلیة نمونههای بومی با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شده و بعنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیة D-loop ژنوم میتوکندری بکار برده شدند. با آنالیز توالی قطعة 247 جفت ...
full textبررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (vulpes vulpes) در شمال شرق ایران براساس ژن سیتوکروم b
به منظور بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی روباه معمولی (vulpes vulpes)در شمال شرق ایران، 25 نمونه بافت از سه استان (خراسان رضوی، خراسان شمالی و گلستان) جمع آوری شد. پس از استخراج dna، ژن سیتوکروم b توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، تکثیر و پس از خالص سازی و توالی یابی، قطعه ای به طول 1098 جفت نوکلئوتید از این ژن برای هر نمونه ویرایش شد. سپس با تجزیه و تحلیل این قطعه در ن...
full textبررسی ساختار جغرافیایی و تاریخچه جمعیتشناختی خرس قهوهای بر اساس توالی ناحیه کنترل میتوکندری
در سالهای اخیر، گستره پراکنش خرس قهوهای با کاهش شدیدی روبرو بوده است و در این میان، احتمال انقراض برخی جمعیتهای ناشناخته وجود دارد. بنابراین، داشتن یک تصویر جامع از تنوع ژنتیکی و ساختار جغرافیایی جمعیتها و گونههای مختلف در راستای توسعه راهکارهای حفاظتی مؤثر ضروری است. در پژوهش حاضر، یک قطعه 271 نوکلئوتیدی ناحیه کنترل میتوکندری مربوط به تعداد هفت نمونه خرس قهوهای از ایران و 460 توالی از خر...
full textMy Resources
Journal title
volume 69 issue 4
pages 917- 933
publication date 2017-01-20
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023