بررسی الگوی بیان ژن ویژه تیپ سلولی در جلبک Volvox carteri تحت شرایط تنش نوری
Authors
Abstract:
طول موجهای UV-B عمیقتر از هر طول موج دیگری به آب نفوذ میکنند. موجودات یوکاریوتی پیچیده از طریق بیان انتخابی بخش ویژهای از ژنوم یکسان در انواع مختلف سلول، در پاسخ به نشانههای نموی و محیطی از قبیلUV-B تکامل یافتهاند. تشکیل موجودات پرسلولی به مسیرهای سیگنالینگ ژنتیکی از پیش تعریف شده در انواع مختلف سلول نیاز دارد. انواع مختلف سلول باید بتوانند پاسخهای سازشی مناسب را نسبت به محیط در حال تغییر پیرامون خود، تنظیم کنند. جلبک سبز پرسلولیVolvox carteri تنها از دو تیپ سلولی با تقسیم بارز کار تشکیل شده است.در اینجا، از تکنیکRNA-seq برای بررسی پروفایل ترنسکریپتوم دو تیپ سلولی تفکیک شده V. carteri تحت یک ساعت تابش UV-B استفاده شد. نتایج نشان داد که تقریبا یک سوم از ژنها (8392 ژن از 23778 ژن) بهطور معنیداری بین دو تیپ سلولی بیان متفاوتی داشتهاند. برای شناسایی نحوه عملکرد هر یک از سلولها در پاسخ به تابش UV-B، ژنهای اختصاصی آنها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که در سلولهای سوماتیک، انتقال تراغشایی پتاسیم و هیدرولیز باند فسفودیاستراز RNA فعال شدهاند. درحالیکه در سلولهای زایشی، ترمیم برشی عدم تطابق (MMR)، گردایش نوکلئوزوم و کروموزوم بعد از تابش UV-B رخدادهاست. فرایند بیوسنتزDNA وابسته به RNA، پاسخ مشترک هر دو سلول به تابش UV-B بوده است. هر دو تیپ سلولی در مجموع سازوکارهای دفاعی را آغازکردهاند و باعث کاهش حساسیت جلبک به این اشعه شدهاند.
similar resources
بررسی بیان ژنهای گیرنده نوری و ژنهای هدف مسیر پاسخ به تابش UV-B در جلبک Volvox carteri
نور مهمترین منبع انرژی برای موجودات فتوسنتزی است. پروتئینهای گیرنده نور قادرند تا طول موجهای خاصی از نور را دریافت کرده و مسیر انتقال سیگنال را آغاز نمایند. Volvox carteri جلبک سبز پرسلولی ساده با داشتن ویژگیهای منحصربه فرد خود، بهعنوان مدل یوکاریوتی کمتر تکامل یافته برای مطالعه تکامل و توسعه گیرنده های نوری بسیار مناسب است. در پژوهش حاضر، اثر تابش (UV-B (0.056 mw.cm-2 بر بیان 13 ژن گیرن...
full textهمسانهسازی و بررسی فیلوژنتیکی توالیهای دو ژن متعلق به زیر خانواده کریپتوکروم DASH جلبک Volvox carteri
در اکثر موجودات، گیرنده های نوری پیام رسانی به منظور درک و تفسیر علائم محیطی بهوجود آمدهاند. این مولکولها قادرند، نور را توسط کروموفورهای خود جذب کرده، مسیرهای پیام رسانی خاصی را در سلولها به راه انداخته و سبب بروز پاسخ مناسب در سلول شوند. شاخه جدیدی از علم به نام اپتوژنتیک تلاش میکند تا از گیرنده های نوری به عنوان ابزارهای مولکولی جهت کنترل دقیق وقایع سلولی استفاده کند. یکی از راههای ت...
full textSexual Induction in Volvox Carteri
The study of the dependence of reactions on the concentration of various compounds is often of great value in determining reaction mechanisms . In chemical kinetics, it is often found that, according to van't Hoff's rule, the order of dependence of a reaction on the concentration of some compound involved in that reaction is equal to the number of molecules of the compound involved in each reac...
full textTwo Different Rickettsial Bacteria Invading Volvox carteri
BACKGROUND Bacteria of the family Rickettsiaceae are principally associated with arthropods. Recently, endosymbionts of the Rickettsiaceae have been found in non-phagotrophic cells of the volvocalean green algae Carteria cerasiformis, Pleodorina japonica, and Volvox carteri. Such endosymbionts were present in only C. cerasiformis strain NIES-425 and V. carteri strain UTEX 2180, of various strai...
full textA Preliminary Genetic Investigation of VOLVOX CARTERI.
A preliminary genetic analysis of a number of genetic variants of Volvox carteri f. nagariensis is presented. Techniques are outlined for mutagenesis of Volvox, isolation of mutants and routine genetic analysis. All of the mutants show simple Mendelian segregation patterns and have been tentatively placed in 14 linkage groups.
full textFunctional analysis of the Volvox carteri asymmetric division protein GlsA
The Zuotin-family J protein chaperone GlsA is essential for the asymmetric divisions that establish germ and somatic cell initials during embryogenesis in the green alga Volvox carteri, but it is not known on what cellular process GlsA acts to carry out this function. Most GlsA protein is nuclear, and GlsA possesses two SANT domains, suggesting that GlsA may function as a transcriptional regula...
full textMy Resources
Journal title
volume 33 issue 2
pages 248- 258
publication date 2020-06-21
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023