استنتاج مجموعة پیشبینی کننده در شبکة تنظیم کنندة ژن مبتنی بر الگوریتم‌جستجوی گرانشی و تابع برازندگی میانگین آنتروپی شرطی
Authors
Abstract:
استنتاج شبکة تنظیم‌کنندة ژن (GRN) با استفاده از دادههای بیان ژن، برای درک وابستگی و نحوة تنظیم ژنها، درک فرآیندهای زیستشناسی، نحوة رخداد فرآیندها و همچنین جلوگیری از وقوع برخی فرآیندهای ناخواسته (بیماری)، حائز اهمیت است. ساخت صحیح GRN، نیازمند استنتاج صحیح مجموعة پیشبینیکننده است. به‌طور کلی، مهم‌ترین محدودیت برای استنتاج صحیح مجموعة پیشبینیکننده، حجم عظیم ژنها، کم بودن تعداد نمونهها و امکان نفوذ نویز در دادههای بیان ژن است؛ بنابراین، ارائة روشهایی کارا برای استنتاج پیشبینی کنندهها با قابلیت اطمینان بالا، یک نیاز جدی است. در این مقاله، با استفاده از الگوریتم جستجوی گرانشی(GSA)، یک روش کارا برای استنتاج مجموعة پیشبینیکننده ارائه شده است. به‌ازای هر ژن هدف، یک الگوریتم GSA برای استنتاج زیر‌مجموعة پیشبینی کنندة آن ژن استفاده شده است. در هر جمعیت، یک جرم نشان دهندة زیر‌مجموعة پیشبینی کنندة مرتبط با آن ژن هدف است. جمعیت اولیه به‌ازای هر ژن هدف، براساس ضریب همبستگی پیرسون تولید میشود. برای هدایت الگوریتم GSA، از معیار ارزیابی میانگین آنتروپی شرطی (MCE) استفاده شده است. نتایج تجربی حاصل از اعمال این روش روی دادههای زیستشناسی نشان میدهد که، روش پیشنهادی دقت بالایی برای استنتاج مجموعة پیشبینیکننده دارد. به‌علاوه، نتایج روی دادههای زیستشناسی با مقیاس کوچک و بزرگ نشان میدهند که، میزان دقت روش پیشنهادی برای استنتاج GRN بیشتر از روشهای مشابه است.
similar resources
اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
full textاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
full textمباحثی در آنتروپی مبتنی بر تابع چندک
در این پایان نامه ابتدا مروری بر مفاهیم پایه ای و تاریخچه آنتروپی و قابلیت اعتماد خواهیم داشت. سپس فرمول ها و روابط بسته ای برای آنها بر مبنای تابع چندک ارائه می شود. در ادامه آنتروپی متغیر طول عمر باقیمانده و گذشته مبتنی بر تابع چندک در مدل های پیوسته مطالعه و خواص آنها بررسی می شود. مشخصه سازی مدل آماری جامعه بر حسب آنتروپی باقیمانده و گذشته مبتنی بر تابع چندک انجام می شود. با در نظر گرفتن مد...
ارزیابی روش مبتنی بر تئوری آنتروپی چیو در برآورد توزیع سرعت و پیشبینی دبی جریان در رودخانه ها
full text
تولید نام‌های زیبا و معنادار ایرانی به‌کمک الگوریتم ژنتیک با تابع برازندگی مبتنی بر شبکه عصبی مصنوعی
Beautiful and Meaningful Iranian Names Production by Genetic Algorithm using Artificial Neural Network-Based Fitness Function
full textپیشبینی کم‌آبی ماهانه با استفاده از یک مدل استوکستیک و سیستم استنتاج فازی مبتنی بر شبکة تطبیقی
آگاهی از دبی جریان و پیشبینی آن به ویژه در مواقعی که رودخانه با کم‌آبی مواجه است امری ضروری در جهت مدیریت بهره‌‌برداری از رودخانه است. در این مقاله به منظور مدل‌سازی سری‌های زمانی تشکیل شده از کم‌آبی‌های ماهانه و پیشبینی مقدار و زمان وقوع کم‌آبی‌ها، از یک مدل استوکستیک متداول (مدل میانگین متحرک تجمعی خودبازگشت-ARIMA) و یک مدل مبتنی بر هوش مصنوعی (سیستم استنتاج فازی مبتنی بر شبکة تطبیقی-ANF...
full textMy Resources
Journal title
volume 9 issue 4
pages 375- 386
publication date 2016-01-21
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023