آنالیز غنی‌سازی مجموعة ژنی در غده‌های سیب‌زمینی (Solanum tuberosum L.) در جریان مراحل نموی
Authors
Abstract:
سیب‌زمینی، چهارمین گیاه ارزشمند در تغذیه بشر است. غده سیب‌زمینی علاوه بر کربوهیدرات‌ها، دارای ویتامین‌ها و ریزمغذی‌های مهمی برای تأمین سلامت بشر است. طی مراحل نموی غده سیب‌زمینی، تغییرات متعدد مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و مولکولی رخ می‌دهند. مطالعه این اتفاق‌ها از منظر مولکولی، برای به‌نژادی ارزش غذایی و بهبود عملکرد سیب‌زمینی بسیار مهم است. روش‌های توالی‌یابی نوین، داده‌های ژنتیکی فراوان و سودمندی برای به‌نژادی مولکولی محصولات زراعی تولید می-کنند. در این مطالعه، از غده در حال نمو سیب‌زمینی در دو دوره نموی نمونه‌برداری صورت گرفت. توالی‌یابی cDNA و ساخت RNA پس از استخراج با دو تکرار برای هر Illumina انجام شد. آنالیزهای بیوانفورماتیکی، هستی‌شناسی ژن و غنی‌سازی گروه‌های ژنی صورت گرفت. در نهایت، از 1829 ژن افتراقی، 1186 ژن توسط پایگاه‌های معتبر شناسایی شدند. نتایج مقایسه‌های هستی‌شناسی ژن نشان داد که به ترتیب 393، 483 و 669 ژن در فرایندهای بیولوژیکی، اجزای سلولی و کارکردهای مولکولی نقش داشتند. بیشترین تعداد ژن در مسیرهای بیوسنتز فنیل پروپانوئیدها، بیوسنتز متابولیت‌های ثانویه و مسیرهای متابولیکی حضور داشتند. ژن‌های کدکننده‌ی پراکسیدازها و ناقلین غشایی مهم‌ترین ژن‌ها در ابتدای دوره نموی تا شروع غده‌دهی بودند. نمو غده در سیب‌زمینی مسیرهای متابولیکی بسیاری را فعال می‌سازد، که نه تنها موجب رشد و نمو می‌گردند، بلکه باعث فعال شدن مسیرهای مقابله با تنش‌ها و همچنین مسیرهای ساخت مواد مورد نیاز می‌گردند. در مجموع تعداد ده ژن کلیدی برای بیوسنتز نشاسته در جریان نمو، شناسایی شدند که بیشتر آن‌ها افزایش بیان معنی‌داری نشان دادند، این موضوع نشان می‌دهد که فرایند بیوسنتز نشاسته از شروع نمو استولون تا بلوغ غده پیوسته ادامه دارد.
similar resources
Respiration rate of potatoes (Solanum tuberosum L
This work investigated the effects of soft rot (Erwinia carotovora) on respiration rate of potatoes stored at three storage temperatures (5, 10, and 15 C) covering temperature ranges commonly encountered in storage. Five treatments were evaluated: healthy (H), healthy with holes (HW), inoculation with no incubation (I0), inoculation with 24 hr incubation (I1), and inoculated with 48 hr incubati...
full textبررسی مراحل فنولوژی و برخی از شاخصهای رشد در ارقام سیب‌زمینی (Solanum tuberosum L.)
به منظور بررسی مراحل فنولوژی، برخی از شاخصهای رشد و خصوصیات کمی و کیفی ارقام ساوالان، سانته و کوزیما آزمایشی به مدت یک سال (90-1389) در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با سه تیمار و سه تکرار در ایستگاه تحقیقات کشاورزی بهبهان انجام گرفت. غدهها در اواخر دی ماه کشت و اواخر اردیبهشت ماه برداشت شدند. نتایج حاصل نشان داد که طولانی بودن مرحله رشد و نمو جوانهها و بالا بودن دما در مرحله حجیم شدن غدهه...
full textIn vitro microtuberization in potato (Solanum tuberosum L.) cultivars.
Mechanism of microtuberization in three elite cultivars kufri badhsha (KB), kufri chandramukhi (KCM) and kufri jawahar (KJ) of potato was studied. Sprouts of all the three cultivars were used to obtain in vitro shoot cultures. MS medium supplemented with chlorocholine chloride was found to be most suitable for all the cultivars. Maximum tuberization was obtained under incubation conditions of c...
full textSensory Evaluation of Pigmented Flesh Potatoes (Solanum tuberosum L.)
Pigmented potato cultivars were ranked by a consumer panel for overall acceptance, and acceptance of aroma, appearance, and flavor. Potatoes were analyzed for total phenolics, anthocyanins and carotenoids. Concentrations of total phenolics in yellow and purple potato cultivars were 2-fold greater (P < 0.001) than in the white cultivar. Anthocyanins were low to non-detectable in white and yellow...
full textIn Vivo Propagation of Potato (solanum Tuberosum L.) Cultivars
Farhat Ali Khan and Shabana Irum Department of Botany, Hazara University Mansehra, Pakistan Shazia Erum and Aish Muhammad Plant Genetic Resource Institute, National Agricultural Research Centre, Islamabad, Pakistan Faisal Nouroz Department of Botany, Hazara University Mansehra, Pakistan and Molecular Genetics Laboratory, Department of Biology, University of Leicester, UK Saima Kanwal Food Scien...
full textMy Resources
Journal title
volume 9 issue 29
pages 39- 51
publication date 2020-05-21
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023