بررسی داکینگ مولکولی آنزیم پروتئاز ویروس hiv-۱ با ترکیبات تری ترپنوئیدی با منشأ گیاهی و قارچی
نویسندگان
چکیده
زمینه و هدف: به دلیل توان بالای عفونتزایی و مقاومتهای دارویی گزارش شده در ویروس hiv-1 طی سالهای اخیر، پژوهشهای زیادی در خصوص کشف و معرفی داروهای ضد ویروس hiv-1 انجام شده است. نتایج بررسیهای متعدد نشان داده است که داروها و ترکیبات مهارکننده پروتئاز که سهم عمدهای از آنها را مشتقات گیاهی به ویژه ترپنوئیدها تشکیل میدهند، در کنترل عفونت ناشی از ویروس hiv-1 بسیار موثر میباشند. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم پروتئاز hiv-1 به وسیلهی داروهای استاندارد و ترکیبات تری ترپنوئیدی با منشا گیاهی و قارچی میباشد. مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی –تحلیلی انجام گرفت. برای انجام این بررسی بیوانفورماتیکی، ساختار مربوط به داروها، ترکیبات تری ترپنی و آنزیم پروتئاز hiv-1 به ترتیب از پایگاه دادههای chem spider، pubchem، hmdb و pdb دریافت شد. سپس داکینگ مولکولی به وسیله نرم افزار igemdok2.1 انجام گرفت. یافتهها: نتایج نشان داد که محل برهمکنش ترکیبات تری ترپنی همانند داروهای استاندارد، سه ناحیه حفاظت شده و کاتالیتیکی دومین مرکزی، فلاپ و دومین انتهای کربوکسیل خصوصا اسید آمینههای asp25-gly27-ala28-asp29-asp30 واقع در جایگاه فعال پروتئاز hiv-1 میباشد. همچنین بررسی برهمکنشهای این نواحی نشان داد که استحکام میانکنشهای ایجاد شده در این مناطق ارتباط مستقیمی با مقادیر ic50 این ترکیبات دارد. نتیجهگیری: در پایان با توجه به اثر بخشی بالا و عمل اختصاصی تری ترپنوئیدها میتوان نتیجه گرفت که این ترکیبات میتوانند به عنوان داروهای موثرضد پروتئاز hiv-1 مطرح شوند.
منابع مشابه
مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure
کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...
متن کاملارزیابی اثرمهارکنندگی فلز روی بر فعالیت اکسیداتیو آنزیم پراکسیداز با طیف سنجی جذبی و داکینگ مولکولی
سابقه و هدف:با توجه به اثرات وابسته به غلظت فلز روی هدف از این تحقیق ارزیابی اثر مهارکنندگی فلز روی بر فعالیت اکسیداتیو آنزیم پراکسیداز به عنوان یکی از مهمترین انزیمهای تنفسی سلول است. مواد و روشها:به منظور استخراج پارامترهای سینتیکی منحنی فعالیت پراکسیداز در غلظتهای مختلف روی بر علیه زمان رسم شده و مکانیزم مهارکنندگی با کمک رسم منحنی های لینور- برگ و داکینگ مولکولی بررسی شده است. یافته ها:فل...
متن کاملطراحی ترکیبات کرومنی جدید با فعالیت ضد سرطانی و بررسی چگونگی میانکنش آنها با توبولین به روش داکینگ مولکولی
در حال حاضر روش‌های in silico یکی از کم هزینه‌ترین و سریعترین روش‌های موجود جهت طراحی و کشف دارو در زمینه درمان محسوب می گردد. در این مطالعه ما علاقه‌مند شدیم تا با انجام طراحی محاسباتی دارو به روش داکینگ مولکولی ترکیباتی را معرفی کنیم که نقش موثری در مهار پلی‌مریزاسیون توبولین‌ها به عنوان عوامل اصلی تقسیم سلولی در تومورهای سرطانی دارند. بدین منظور ترکیبات کرومنی که توسط محققین مختلف خواص ضد سر...
متن کاملاثر ترکیبات جدید 8- فنیل - 4- کینولون با استخلاف‌های مختلف در موقعیت 3 بازدارنده آنزیم اینتگراز علیه ویروس HIV
زمینه و هدف : تهدید HIV علیه نظام سلامت جهانی، سبب مطالعاتی برای یافتن ترکیبات جدید ضدویروس HIV شده است. این مطالعه به منظور تعیین اثر ترکیبات جدید 8- فنیل - 4- کینولون با استخلاف‌های مختلف در موقعیت 3 بازدارنده آنزیم اینتگراز علیه ویروس HIV انجام شد. روش بررسی : در این مطالعه توصیفی ویریون (single cycle replicable) HIV SCR به وسیله ترانسفکت کردن سلول‌های HEK293T با سه پلاسمید pmzNL4-3 ، pSPAX....
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله دانشگاه علوم پزشکی اراکجلد ۱۸، شماره ۳، صفحات ۶۷-۷۹
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023