شناسایی in silico اپی توپ های پروتئین های سگ و گربه خانگی به عنوان کاندیدهای ایمونوتراپی پپتیدی بر اساس میل ترکیبی با آنتی ژن لکوسیت انسانی

هدف از این مطالعه توصیفی تعیین اپی توپ های پروتئینی felis domesticus (گربه) و canis familiaris (سگ) بود که به شدت به آلل های hla رده ii انتخابی متصل می شوند تا اپی توپ های کاندید واکسن سنتزی و جمعیت ها/اشخاصی که احتمال دارد به واکسن پاسخ دهند را شناسایی کنند. توالی های اسید آمینه fasta پروتئین های آلرژی زای به طور تجربی تایید شده سگ و گربه خانگی با استفاده از پایگاه داده های نامگذاری آلرژن اتحادیه بین المللی جوامع ایمنی (iuis) شناسایی شدند. سرور netmhcii 2.2 برای تعیین میل ترکیبی در قالب 1-log 50 k و در nm با آلل های متداول یافت شده hla ii استفاده شد. غربالگری پروتئین های آلرژی زای سگ و گربه خانگی به ترتیب 4 (با دو ایزوفرم برای زنجیره 1 و سه ایزوفرم برای زنجیره 2 برای fel d 1) و 6 پروتئین را شناسایی کردند. تعداد متصل کننده های قوی از هر پروتئین در مقابل هر نوع hla به عنوان کاندید بالقوه برای ایونوتراپی آلرژن تعیین شد. hla-drb1*0101 به حداکثر تعداد اپی توپ ها متصل شد (به ترتیب 207 و 275 از گربه و سگ خانگی)، در حالی که hla-drb1*0802 به اپی توپی متصل نشد. ما نتیجه می گیریم که پیش بینی اپی توپ اختصاصی hla می تواند به شناسایی کاندیدهای واکسن پپتیدی سنتزی کمک کرده و همچنین پاسخ را نیز پیش بینی کند.