whole-genome scan of eight iranian native cattle breeds to detect selection signatures.

[ ' t h i s s t u d y a i m e d t o i d e n t i f y g e n e s t h a t s h o w s i g n a t u r e s o f s e l e c t i o n f o r m u t a t i o n s i n i r a n i a n n a t i v e c a t t l e b r e e d s . t h e d a t a c o n s i s t e d o f g e n o t y p e s f o r ~ 7 7 7 9 6 2 s n p m a r k e r s o f 9 0 a n i m a l s f r o m e i g h t i r a n i a n n a t i v e c a t t l e b r e e d s d i s t r i b u t i n g o v e r t h e c o u n t r y . t h e r e f o r e ' , ' t h e a i m w a s t o i d e n t i f y i n g d i v e r g e n t l y s e l e c t e d r e g i o n s o f t h e g e n o m e . s t u d y o f p o p u l a t i o n d i f f e r e n t i a t i o n a c r o s s t h e g e n o m e u s i n g w e i r a n d c o c k e r h a m ’ s f s t t e s t r e v e a l e d s o m e r e g i o n s s h o w i n g e v i d e n c e o f s e l e c t i o n . a c r o s s t h e 3 0 b o v i n e c h r o m o s o m e s ( b t a ) ' , ' s e v e n p u t a t i v e s e l e c t i o n s i g n a t u r e s w e r e d e t e c t e d . t h e s e r e g i o n s w e r e l o c a t e d o n c h r o m o s o m e s 1 ' , 2 , 7 , 8 , 1 2 , ' 1 3 a n d x . f i n a l l y ' , ' s t u d y o f t h e r e p o r t e d q t l r e g i o n s i n t h e o r t h o l o g o u s a r e a s o f t h e c a t t l e g e n o m e s h o w e d t h a t t h e g e n o m i c r e g i o n s i d e n t i f i e d i n t h i s s t u d y o v e r l a p p e d w i t h t h e r e p o r t e d q t l r e p r e s e n t i n g e c o n o m i c a l l y i m p o r t a n t t r a i t s s u c h a s m i l k y i e l d ' , ' c o l d t o l e r a n c e a n d r e p r o d u c t i v e t r a i t s . r e s u l t o f t h i s r e s e a r c h p r o v i d e d i m p o r t a n t i n f o r m a t i o n o n e x i s t e n c e o f g e n e t i c d i v e r s i t y a n d s e l e c t i o n s i g n a t u r e s i n i r a n i a n n a t i v e c a t t l e . ' ]