الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها در جمعیت های linum austriacum l.
نویسندگان
چکیده
رتروترنسپوزونها عناصر رایج در ژنوم گیاهان میباشند که فراوانی، فعالیت و توزیع یکنواخت آنها در ژنوم، استفاده از آنها را به عنوان نشانگرهای مولکولی ایدهآل میسازد. بهمنظور مطالعه فعالیت، الگوی توزیع و چندشکلی ادغامی برخی رتروترنسپوزونهای ltr (long terminal repeat) در گیاه linum austriacum l. از نشانگرهای irap (inter-retrotransposon amplified polymorphism) و remap (retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism) استفاده شد. نتایج نشان داد که رتروترنسپوزونهای ltr مورد استفاده به لحاظ انتقالی در ژنوم l. austriacum فعال بوده و در داخل یکدیگر به حالت آشیانهای و همچنین در نواحی نزدیک ریزماهوارهها ادغام میشوند. از 58 آغازگر منفرد و ترکیب آغازگری بررسی شده، 20 آغازگر (7 آغازگر irap و 13 آغازگر remap) الگوی باندی واضح و قابل امتیازدهی تولید نمودند. در مجموع 199 مکان توسط 20 آغازگر تکثیر شد که از این تعداد 129 مکان (8/64 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای ltr1868 و ltr1854-a13 به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد مکان چندشکل را تولید نمودند. براساس آزمون مانتل همبستگی بین ماتریسهای کوفنتیک irap و remap معنیدار نبود. تجزیه خوشهای براساس داده های حاصل از ترکیب دو نشانگر (irap+remap) به روش minimum evolution بر پایه ضریب number of differences، ژنوتیپها را به چهار گروه منتسب کرد. افراد مربوط به هر جمعیت در گروههای مشابه قرار گرفت. براساس نتایج حاصل از این تحقیق میتوان اظهار داشت که نشانگرهای irap و remap توسعه یافته براساس رتروترنسپوزونهای فعال در جنس linum میتوانند به عنوان ابزار نسبتاً جدیدی در برنامههای اصلاحی گونههای مختلف این جنس مورد استفاده قرار گیرند.
منابع مشابه
فعالیت انتقالی و چندشکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها در ارقام و لاین های گندم دوروم
رتروترنسپوزون ها عناصر متحرک رایج در ژنوم گیاهان بوده که گستردگی، توزیع یکنواخت و قابلیت جابه¬جایی، استفاده از آن ها را به عنوان نشانگرهای مولکولی ایده آل می سازد. در این مطالعه نشانگرهایirap و remap، مبتنی برخانواده¬های رتروترنسپوزونی ltr دار (گندم و جو) جهت مطالعه تنوع ژنتیکی 94 لاین و رقم بومی گندم دوروم (triticum turgidum l.) مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج نشان داد که بیشتر خانواده¬های رتر...
15 صفحه اولFlax (Linum usitatissimum L
The archaeological evidence of flax cultivation dates back to >6000 BC and it is considered as one of the oldest and most useful crops. Components of flax have diverse uses. Cultivar development of flax is currently focused on enhancing the oil content and nutritional value to meet the demand of nutraceutical market supply, as an alternate source of fish oil, a rich source of eicosapentaenoic a...
متن کاملتحلیل اثر عوامل محیط طبیعی در الگوی توزیع فضایی سکونتگاه ها و جمعیت روستایی شهرستان آمل
این مقاله فاقد چکیده میباشد.
متن کاملنوسانات جمعیت و الگوی توزیع فضایی شپشک Kermes quercus (L.) (Hem.: Kermesidae) در جنگل های بلوط گیلانغرب
شپشک Kermes quercus (L.) به طور اختصاصی از درختان بلوط تغذیه و خسارت وارد می کند. این شپشک درطی سالهای 94-1393 در جنگل های بلوط شهرستان گیلان غرب بر روی بلوط ایرانی، Quercus branti مطالعه شد. مراحل زیستی آفت از روی سرشاخه ها جمع آوری شد و در آزمایشگاه، در زیر استریومیکروسکوپ به تفکیک شمارش، ثبت و نوسانات جمعیت آن به صورت منحنی ترسیم گردید. همچنین توزیع فضایی و نوسانات جمعیت آفت با استفاده ...
متن کاملچندشکلی ریزماهواره ای در جمعیت های ماهی خیاطه (Alburnoides eichwaldi) رودخانه های کبودوال و سفیدرود
ماهی خیاطه (Alburnoides eichwaldi) یک گونه رودخانه ای است که در حوضه جنوبی دریای خزر از فراوانی نسبتا خوبی برخوردار می باشد اما در بسیاری از آب های اروپا نزدیک به انقراض می باشد. تا کنون هیچ گونه مطالعه ای در زمینه تنوع ژنتیکی این گونه صورت نگرفته است. در این تحقیق به منظور بررسی ساختار ژنتیکی ماهی خیاطه در رودخانه های کبودوال و سفیدرود از 6 جایگاه ریزماهوارهای ...
متن کاملAccumulation of lignans by in vitro cultures of three Linum species.
Justicidin B, an arylnaphthalene lignan, has strong cytotoxicity on chronic myeloid and chronic lymphoid leukemia cell lines. The first report of the production of justicidin B in a Linum species concerned in vitro culture of Linum austriacum. Therefore, culture characterization and presence of arylnaphthalene-type lignans in calli and plantlets of Linum tenuifolium from section Linastrum, Linu...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
فن آوری زیستی در کشاورزیجلد ۶، شماره ۲، صفحات ۵۱-۶۱
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023